40213糞便基因組DNA快速提取試劑he(離心柱型)
【簡單介紹】
品牌 | NobleRyder/諾博萊德 | 貨號 | 40213 |
---|---|---|---|
規(guī)格 | 50次 | 供貨周期 | 現(xiàn)貨 |
主要用途 | 適用于快速提取各種糞便DNA | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 環(huán)保,化工,生物產(chǎn)業(yè),農(nóng)林牧漁,制藥/生物制藥 |
糞便基因組DNA快速提取試劑he(離心柱型)
【詳細說明】
糞便基因組DNA快速提取試劑he(離心柱型)
糞便基因組DNA快速提取試劑he(離心柱型)
目錄號:40213
目錄編號 | 包裝單位 |
40213-50 | 50次 |
v 適用范圍:
適用于快速提取各種糞便DNA
v 試劑盒組成,、儲存,、穩(wěn)定性:
試劑盒組成 | 保存 | 50次 |
緩沖液ASL | 室溫 | 70ml |
雜質(zhì)清除劑AB | 室溫 | 5ml |
結(jié)合液CB | 室溫 | 11 ml |
抑制物去除液IR | 室溫 | 25 ml |
漂洗液WB | 室溫 | 15 ml 第一次使用前按說明加指ding量乙醇 |
洗脫緩沖液EB | 室溫 | 15 ml |
蛋白酶K fen(可選) 20mg/ml | 室溫 | 20mg |
吸附柱AC | 室溫 | 50個 |
收集管(2ml) | 室溫 | 50個 |
本試劑盒在室溫儲存12個月不影響使用效果。
雜質(zhì)清除劑AB,,短時間內(nèi)使用可以放室溫,,長期保存負-20℃。
儲存事項:
1. 緩沖液ASL或者結(jié)合液CB低溫時可能出現(xiàn)析出和沉淀,,可以在70℃水浴幾分鐘幫助重新充分溶解,,恢復(fù)澄清透明后冷卻到室溫即可使用。
2. 雜質(zhì)清除劑AB常溫運輸,,短期一個月內(nèi)可4℃存放,,-20℃長期保存。
3. 為避免降低活性,,方便運輸,,提供蛋白酶K為凍干粉狀,收到后,,可短暫離心后,,加入1毫升滅菌水溶解,因為反復(fù)凍融可能會降低酶活性,,因此溶解后立即按照每次使用量(20微升)分裝凍存,,-20℃保存。
4. 避免試劑長時間暴露于空氣中產(chǎn)生揮發(fā),、氧化,、pH值變化,各溶液使用后應(yīng)及時蓋緊蓋子,。
v 產(chǎn)品介紹:
常規(guī)的DNA純化方式并不能有效地去除糞便中存在的大量抑制因子而導(dǎo)致下游實驗的失敗,,如PCR不能擴增出所需片段。該試劑盒采用DNA吸附柱和新型du特的溶液系統(tǒng),,能有效去除動物糞便中各種影響下游實驗(如PCR)的抑制因子,,并能高效地回收糞便中的基因組DNA。動物糞便樣品經(jīng)特殊緩沖液ASL重懸后,70℃處理5分鐘裂解細菌,;離心去除不溶解的雜質(zhì),,蛋白酶K消化進一步去除蛋白和雜質(zhì);然后基因組DNA在高離序鹽狀態(tài)下選擇性吸附于離心柱內(nèi)硅基質(zhì)膜,, 再通過一系列快速的漂洗-離心的步驟,,抑制物去除液和漂洗液將細胞代謝物、蛋白等雜質(zhì)去除,,最后低鹽的洗脫緩沖液將純凈基因組DNA從硅基質(zhì)膜上洗脫。
v 產(chǎn)品特點:
1. 離心吸附柱內(nèi)硅基質(zhì)膜全部采用進口*公司特制吸附膜,,柱與柱之間吸附量差異極小,,可重復(fù)性好??朔藝a(chǎn)試劑盒膜質(zhì)量不穩(wěn)定的弊端,。
2. 不需要使用有毒的苯fen等試劑,也不需要乙醇沉淀等步驟,。
3. 快速,,簡捷,單個樣品操作一般可在40分鐘內(nèi)完成,。
4. 多次柱漂洗確保高純度,,OD260/OD280典型的比值達1.7~1.9,可直接用于PCR,,Southern-blot和各種酶切反應(yīng),。
v 注意事項:
1. 所有的離心步驟均在室溫完成,使用轉(zhuǎn)速可以達到13,000rpm的傳統(tǒng)臺式離心機,,如Eppendorf 5415C 或者類似離心機,。
2. 開始實驗前將需要的水浴先預(yù)熱到70℃?zhèn)溆谩?/span>
3. 結(jié)合液CB和抑制物去除液IR中含有刺激性化合物,操作時要戴乳膠手套,,避免沾染皮膚,,眼睛和衣服。若沾染皮膚,、眼睛時,,要用大量清水或者生理鹽水沖洗。
4. 洗脫液EB不含有螯合劑EDTA,, 不影響下游酶切,、連接等反應(yīng)。也可以使用水洗脫,, 但應(yīng)該確保pH大于7.5,, pH過低影響洗脫效率。用水洗脫DNA應(yīng)該保存在-20℃。DNA如果需要長期保存,,可以用TE緩沖液洗脫(10mM Tris-HCl,, 1mM EDTA,pH 8.0),,但是EDTA可能影響下游酶切反應(yīng),,使用時可以適當(dāng)稀釋。
5. PCR可能被過量的DNA(一般大于1μg)抑制,,使用最小用量的洗脫DNA(適當(dāng)稀釋)反而可以得到更好的擴增,。一般加入的洗脫DNA體積不要超過總PCR反應(yīng)體積的10%。我們建議在PCR反應(yīng)體系中加入終濃度0.1 μg/μl的BSA(牛血清白蛋白)有助于得到優(yōu)良擴增效果,。
v 操作步驟:(實驗前請先閱讀注意事項)
提示:第一次使用前請先在15ml漂洗液WB中加入60ml無水乙醇,,充分混勻,加入后請及時在方框打鉤標(biāo)記已加入乙醇,,以免多次加入!
1. 收集約200-220mg糞便到一個2ml離心管,,置冰上。
如果是冰凍的標(biāo)本,,加入緩沖液ASL前不能解凍,,否則DNA容易降解。
2. 加1.4ml 緩沖液ASL,,連續(xù)渦旋振蕩1分鐘或者直到wan全混勻均一,。
注意wan全渦旋混勻,否則會嚴重降低產(chǎn)量,。
3. 將重懸物70℃溫育5分鐘,。
該加熱步驟可以提高3-5倍DNA產(chǎn)量,并且?guī)椭呀饧毦图纳x,。對于某些難裂解的細胞(如革蘭氏陽性菌)可以提高到95℃,。
4. 渦旋振蕩15秒,室溫放置1分鐘,。最高速離心1分鐘沉淀糞便顆粒,。
5. 轉(zhuǎn)移900μl上清到一個1.5ml離心管,加入100μl雜質(zhì)清除劑AB,,立刻渦旋振蕩1分鐘或者直到wan全混勻均一,,室溫放置1分鐘。最高速離心3分鐘去除雜質(zhì),。
6. 轉(zhuǎn)移所有上清到一個1.5ml離心管,,最高速離心3分鐘。
7. 轉(zhuǎn)移210μl上清到一個1.5ml離心管,,加入20μl蛋白酶K (20mg/ml)溶液,,充分混勻,,加入200μl 結(jié)合液CB,渦旋振蕩15秒,,充分混勻,。70℃溫育10分鐘。
如果產(chǎn)量偏低,,可以轉(zhuǎn)移更多的上清,,并且相應(yīng)的按比例提高蛋白酶K和結(jié)合液的和后面的異丙醇使用量。
8. 冷卻后加入100μl 異丙醇,,渦旋混勻,。
9. 將上一步所得溶液和可能出現(xiàn)的沉淀都加入一個吸附柱AC中,(吸附柱放入收集管中)13,000rpm離心30秒,,倒掉收集管中的廢液,。
10. 加入500μl抑制物去除液IR,12,000rpm 離心30秒,,棄廢液,。
11. 加入700μl漂洗液WB(請先檢查是否已加入無水乙醇!),,12,000rpm 離心30秒,棄掉廢液,。
12. 加入500μl漂洗液WB,,12,000rpm 離心30秒,棄掉廢液,。
13. 將吸附柱AC放回空收集管中,,13,000rpm離心2分鐘,盡量除去漂洗液,, 以免漂洗液中殘留乙醇抑制下游反應(yīng),。
14. 取出吸附柱AC,放入一個干凈的離心管中,,在吸附膜的中間部位加100-150μl洗脫緩沖液EB(洗脫緩沖液可事先在 65-70℃水浴中預(yù)熱),, 室溫放置2分鐘,12,000rpm 離心1分鐘,。將得到的溶液重新加入離心吸附柱中,,室溫放置2分鐘,12,000rpm離心1分鐘,。
洗脫體積越大,,洗脫效率越高,如果需要DNA濃度較高,,可以適當(dāng)減少洗脫體積,, 但是最小體積不應(yīng)少于50μl,體積過小降低DNA洗脫效率,減少DNA產(chǎn)量,。
15. DNA可以存放在2-8℃,,如果要長時間存放,可以放置在-20℃,。
v 問題與解決方法:
問題 | 評論與建議 |
洗脫液沒有 DNA或者產(chǎn)量低 | *樣品儲存不當(dāng)-建議:樣品應(yīng)該儲存在4℃或者-20℃ *在緩沖液ASL中渦旋勻漿不充分-建議:樣品在ASL中充分的渦旋直到均一。 *和結(jié)合液CB混勻不充分-建議:上清和結(jié)合液CB立即充分間斷渦旋混勻,。 *上離心柱前忘記加異丙醇-建議:記住加異丙醇 * DNA洗脫不充分-建議:洗脫前在室溫放5分鐘 *第一次使用前,,漂洗液WB中忘記加無水乙醇-建議:在漂洗液WB中加入指ding量無水乙醇。 |
A260/A280 比值異常高 | *殘留RNA過高-建議:洗脫緩沖液加RNase A,,室溫10-30分鐘。 |
DNA下游 反應(yīng)不正常 | * BSA沒有加到PCR反應(yīng)體系-建議:PCR反應(yīng)體系中加入終濃度0.1 μg/μl的BSA,。 *下游反應(yīng)中使用的DNA過量了-建議:假如DNA使用太多,可能會抑制PCR反應(yīng),,因此可減少洗脫DNA使用量 *非特異性擴增條帶-建議:洗脫液中目的DNA量太低,背景DNA過高,,可以考慮使用熱啟動PCR聚合酶 *某些目的細胞裂解困難,,不充分導(dǎo)致產(chǎn)量低-建議:可以把裂解液溫育時間提高到95℃ *沒有足夠DNA洗脫下來-建議:查看上面可能的原因 |
最初的離心步驟 第4步驟后沒有 見到多少上清 | *離心力不夠-建議:可以嘗試14000rpm離心5分鐘 |
糞便基因組DNA快速提取試劑he(離心柱型)
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