40210酵母基因組DNA快速提取試劑盒 核酸提取
【簡(jiǎn)單介紹】
品牌 | NobleRyder/諾博萊德 | 貨號(hào) | 40210 |
---|---|---|---|
規(guī)格 | 50次 | 供貨周期 | 現(xiàn)貨 |
主要用途 | 適用于快速提取各種酵母基因組DNA | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 環(huán)保,化工,生物產(chǎn)業(yè),農(nóng)林牧漁,制藥/生物制藥 |
酵母基因組DNA快速提取試劑盒 核酸提取
【詳細(xì)說(shuō)明】
酵母基因組DNA快速提取試劑盒(離心柱型)
酵母基因組DNA快速提取試劑盒 核酸提取
目錄號(hào):40210
目錄編號(hào) | 包裝單位 |
40210-50 | 50次 |
40210-50-1 | 50次(帶蛋白酶K) |
40210-50-2 | 50次(帶Lyticase) |
40210-50-3 | 50次(帶蛋白酶K,,帶Lyticase) |
v 適用范圍:
適用于快速提取各種酵母基因組DNA
v 試劑盒組成,、儲(chǔ)存、穩(wěn)定性:
試劑盒組成 | 保存 | 50次 |
緩沖液YB | 室溫 | 20ml |
結(jié)合液CB | 室溫 | 11ml |
抑制物去除液IR | 室溫 | 25ml |
漂洗液WB | 室溫 | 15ml |
第一次使用前按說(shuō)明加指ding量乙醇 | ||
洗脫緩沖液EB | 室溫 | 15ml |
Lyticase 10U/μl | 室溫 | 2500U |
蛋白酶K fen(可選)20mg/ml | 室溫 | 20mg |
吸附柱AC | 室溫 | 50個(gè) |
收集管(2ml) | 室溫 | 50個(gè) |
本試劑盒在室溫儲(chǔ)存12個(gè)月不影響使用效果,。
儲(chǔ)存事項(xiàng):
1. 結(jié)合液CB或者抑制物去除液IR低溫時(shí)可能出現(xiàn)析出和沉淀,,可以在37℃水浴幾分鐘幫助重新溶解,恢復(fù)澄清透明后冷卻到室溫即可使用,。
2. 為避免降低活性,,方便運(yùn)輸,,提供蛋白酶K為凍干粉狀(20mg),收到后,,可短暫離心后,,加入1毫升滅菌水溶解配制成20mg/ml溶液,因?yàn)榉磸?fù)凍融可能會(huì)降低酶活性,,因此溶解后立即按照每次使用量分裝凍存,,-20℃保存。
3. 為避免降低活性,,方便運(yùn)輸,,提供Lyticase(2500U)為凍干粉狀,收到后,,可短暫離心后,,加入0.25毫升滅菌水溶解配制成10U/μl,因?yàn)榉磸?fù)凍融可能會(huì)降低酶活性,,因此溶解后立即按照每次使用量分裝凍存,,-20℃保存。
4. 避免試劑長(zhǎng)時(shí)間暴露于空氣中產(chǎn)生揮發(fā),、氧化,、pH值變化,各溶液使用后應(yīng)及時(shí)蓋緊蓋子,。
v 產(chǎn)品介紹:
該試劑盒采用DNA吸附柱和du有的溶液系統(tǒng),,適合于從多種來(lái)源的酵母培養(yǎng)物中快速簡(jiǎn)單地提取基因組DNA。約3ml處于指數(shù)生長(zhǎng)期的酵母培養(yǎng)液一般一次抽提可純化出10-15μg的高質(zhì)量的基因組DNA,。純化DNA產(chǎn)物可直接用于PCR,、酶切和雜交等實(shí)驗(yàn)。酵母細(xì)胞經(jīng)lyticase處理去除細(xì)胞壁后,,du特的結(jié)合液/蛋白酶K迅速裂解細(xì)胞和滅活細(xì)胞內(nèi)核酸酶,,然后基因組DNA在高離序鹽狀態(tài)下選擇性吸附于離心柱內(nèi)硅基質(zhì)膜, 再通過(guò)一系列快速的漂洗-離心的步驟,,抑制物去除液和漂洗液將細(xì)胞代謝物,,蛋白等雜質(zhì)去除,最后低鹽的洗脫緩沖液將純凈基因組DNA從硅基質(zhì)膜上洗脫,。
v 產(chǎn)品特點(diǎn):
1. 離心吸附柱內(nèi)硅基質(zhì)膜全部采用進(jìn)口世界有名公司特制吸附膜,,柱與柱之間吸附量差異極小,可重復(fù)性好,??朔藝?guó)產(chǎn)試劑盒膜質(zhì)量不穩(wěn)定的弊端。
2. 不需要使用有毒的苯fen等試劑,也不需要乙醇沉淀等步驟,。
3. 快速,,簡(jiǎn)捷,,單個(gè)樣品裂解后操作一般可在30分鐘內(nèi)完成,。
4. 多次柱漂洗確保高純度,OD260/OD280典型的比值達(dá)1.7~1.9,,可直接用于PCR,,Southern-blot和各種酶切反應(yīng)。
v 注意事項(xiàng):
1. 所有的離心步驟均在室溫完成,,使用轉(zhuǎn)速可以達(dá)到13,000rpm的傳統(tǒng)臺(tái)式離心機(jī),,如Eppendorf 5415C 或者類似離心機(jī)。
2. 需要自備乙醇,、異丙醇,、β-巰基乙chun。
3. 開始實(shí)驗(yàn)前將需要的水浴先預(yù)熱到37℃和70℃?zhèn)溆谩?/span>
4. 結(jié)合液CB和抑制物去除液IR中含有刺激性化合物,,操作時(shí)要戴乳膠手套,,避免沾染皮膚,眼睛和衣服,。若沾染皮膚,、眼睛時(shí),要用大量清水或者生理鹽水沖洗,。
5. 用戶需要自備Sorbitol buffer( 1M 山梨chun,,0.1M Na2EDTA,14 mMβ-巰基乙醇),。配制方法:在600 ml 去離子水里面溶解182.2克山梨chun,,加入200 ml 0.5 M Na2EDTA (pH 8.0) ,不需要調(diào)節(jié)PH值,,定容到1L,,4℃保存。臨用前加0.1%β-巰基乙醇(商品化的β-巰基乙醇摩爾濃度一般為14M),。
6. 菌體濃度檢測(cè)一般OD600值為1的時(shí)候,釀酒酵母細(xì)胞是1-2x107 cells/ml,,由于菌種和分光度計(jì)不同即使同樣細(xì)胞數(shù)量OD值變化也很大,以上僅供參考,。
7. 洗脫液EB不含有螯合劑EDTA,,不影響下游酶切、連接等反應(yīng),。也可以使用水洗脫,,但應(yīng)該確保批pH大于7.5,pH過(guò)低影響洗脫效率,。用水洗脫DNA應(yīng)該保存在-20℃,。DNA如果需要長(zhǎng)期保存,,可以用TE緩沖液洗脫(10mM Tris-HCl,1mM EDTA,,pH 8.0),,但是EDTA可能影響下游酶切反應(yīng),使用時(shí)可以適當(dāng)稀釋,。
v 操作步驟:(實(shí)驗(yàn)前請(qǐng)先閱讀注意事項(xiàng))
提示:
e 第一次使用前請(qǐng)先在15ml漂洗液WB中加入60ml無(wú)水乙醇,,充分混勻,加入后請(qǐng)及時(shí)在方框打鉤標(biāo)記已加入乙醇,,以免多次加入!
e 吸取使用量的Sorbitol buffer加入0.1%β-巰基乙醇,,回復(fù)到室溫備用。
1. 取1-3毫升酵母培養(yǎng)物(不超過(guò)3X107cells,,最好是早對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期),,12,000rpm離心30秒,盡可能的吸棄上清,,收集菌體,。
收集超過(guò)1.5毫升菌液,可以離心棄上清后,,在同一個(gè)1.5ml管內(nèi)加入更多的菌液,,重復(fù)步驟1,直到收集到足夠的菌體,。
2. 加入600μl Sorbitol buffer,,輕柔吹打充分重懸細(xì)胞;可按照20-50U/1x107cells的比例加入Lyticase(一般3 ml培養(yǎng)物可能需要加到150U),,充分顛倒混勻,,37℃溫育至少30分鐘消化細(xì)胞壁,中間可顛倒數(shù)次幫助消化,。
如果破壁效果不好導(dǎo)致DNA產(chǎn)量低,,可以加大lyicase用量來(lái)提高酶工作濃度,還可以延長(zhǎng)消化時(shí)間來(lái)提高效果,,不適合Lyticase消化的酵母可選用Zymolase或者其它方法如玻璃珠渦旋,,煮沸,反復(fù)凍融等,。
3. 13,000rpm離心1分鐘,,盡可能吸棄上清,加180μl 緩沖液YB充分重懸細(xì)胞團(tuán),。
4. 加入20μl的蛋白酶K溶液(20mg/ml),,立刻渦旋振蕩充分混勻。
5. 將混合物放置在55℃水浴消化直到消化wan全,期間輕柔的振蕩幾次幫助裂解,。
所需消化時(shí)間和酵母數(shù)量,、種類和生長(zhǎng)狀態(tài)有關(guān),一般15分鐘即可,,但是如果方便的話消化過(guò)夜也無(wú)不良影響,。
可選步驟,一般不需要: 如果RNA殘留較多,,需要去除RNA,,可在完成操作步驟5后加20μl RNase A(25mg/ml)溶液,,振蕩混勻,,室溫放置5-10分鐘。
6. 加入200μl結(jié)合液CB,,立刻渦旋振蕩充分混勻,,70℃放置10分鐘。
7. 冷卻后加入100μl 異丙醇,,立刻渦旋振蕩充分混勻,,此時(shí)可能會(huì)出現(xiàn)絮狀沉淀。
8. 將上一步混合物(包括可能有的沉淀)加入一個(gè)吸附柱AC中,,(吸附柱放入收集管中)13,000rpm離心30-60秒,,倒掉收集管中的廢液。
9. 加入500μl抑制物去除液IR,,12,000rpm 離心30秒,,棄廢液。
10. 加入700μl漂洗液WB(請(qǐng)先檢查是否已加入無(wú)水乙醇!),,12,000rpm 離心30秒,,棄掉廢液。
11. 加入500μl漂洗液WB,,12,000rpm 離心30秒,,棄掉廢液。
12. 將吸附柱AC放回空收集管中,,13,000rpm離心2分鐘,,盡量除去漂洗液,以免漂洗液中殘留乙醇抑制下游反應(yīng),。
13. 取出吸附柱AC,,放入一個(gè)干凈的離心管中,在吸附膜的中間部位加100μl洗脫緩沖液EB(洗脫緩沖液事先在65-70℃水浴中預(yù)熱效果更好),,室溫放置3-5分鐘,,12,000rpm 離心1分鐘。將得到的溶液重新加入離心吸附柱中,室溫放置2分鐘,,12,000rpm離心1分鐘,。
洗脫體積越大,洗脫效率越高,,如果需要DNA濃度較高,,可以適當(dāng)減少洗脫體積,但是最小體積不應(yīng)少于50μl,,體積過(guò)小降低DNA洗脫效率,,減少DNA產(chǎn)量。
14. DNA可以存放在2-8℃,,如果要長(zhǎng)時(shí)間存放,,可以放置在-20℃。
v 問(wèn)題與解決方法
問(wèn)題 | 評(píng)論與建議 |
DNA產(chǎn)量低 | *某些種類酵母裂解困難-建議:仔細(xì)閱讀步驟2,,確認(rèn)處理的酵母種類可以用lyticase裂解,,還可以考慮選用其它裂解方法如Zymolase、玻璃珠渦旋,、煮沸,、反復(fù)凍融等,lyticase最好按照使用量分裝凍存,,保證有效性,,使用早對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期酵母。 *蛋白酶K失效了-建議:按照每次使用量分裝凍存,,避免反復(fù)凍融,,延長(zhǎng)處理時(shí)間。 *裂解不wan全或者和異丙醇沒(méi)有充分混勻-建議:加入結(jié)合液后,,和加入蛋白酶K后立即吹打或者渦旋混勻,;加入異丙醇后立即吹打或者渦旋混勻才加入吸附柱,如果太粘稠必須渦旋振蕩15秒充分混勻,。 |
DNA降解了 | *組織中核酸酶活性導(dǎo)致降解-建議:樣品處理前妥善保存在-20℃,,處理量不要過(guò)量。 |
未提取到DNA | *漂洗液WB中忘記加無(wú)水乙醇-建議:第一次實(shí)驗(yàn)時(shí),,在漂洗液WB中加入指ding量無(wú)水乙醇,。 |
洗脫下來(lái)的 | *離心柱殘留有較多乙醇或者底部不慎沾有乙醇-建議:確保做了步驟12,否則殘留乙醇會(huì)影響洗脫效率,。 *使用了水或者其它非優(yōu)良液體代替洗脫緩沖液-建議:仔細(xì)閱讀注意事項(xiàng)7和步驟13和只使用洗脫緩沖液EB洗脫,。 |
A260吸光值 | *一些硅基質(zhì)膜成分一起洗脫下來(lái),干擾了吸光值-建議:將洗脫的基因組DNA溶液13,000rpm再離心一分鐘,,小心取上清使用,。 |
DNA下游酶切 | *一些硅基質(zhì)膜成分一起洗脫下來(lái),,抑制了酶切反應(yīng)-建議:將洗脫的基因組DNA溶液13,000rpm再離心一分鐘,小心取上清使用,。 *離心柱殘留有較多乙醇或者底部不慎沾有乙醇抑制了酶切反應(yīng)-建議:確保做了步驟12,,然后空氣中晾幾分鐘,讓殘留乙醇揮發(fā),。 |
酵母基因組DNA快速提取試劑盒 核酸提取
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