靶向蛋白定量:PRM技術如何在多肽水平實
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- 公司名稱 北京百泰派克生物科技有限公司
- 品牌 百泰派克
- 型號
- 產(chǎn)地 中國
- 廠商性質 其他
- 更新時間 2025/7/8 14:49:09
- 訪問次數(shù) 14
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靶向蛋白定量:PRM技術如何在多肽水平實現(xiàn)精準分析?檢測技術服務詳情介紹
dànbáizhì組學研究中,,如何對感興趣蛋白進行準確,、可重復的定量分析,是疾病機制解析,、藥物靶點確認及臨床轉化研究的關鍵需求,。而由于dànbáizhì復雜性及其表達水平的高度動態(tài)范圍,直接進行dànbáizhì層面定量往往面臨巨大挑戰(zhàn),。因此,,多肽層面的定量策略成為主流路徑。PRM技術(Parallel Reaction Monitoring)作為bǎxiàngdàn白定量質譜分析的重要工具,,憑借其高選擇性與高靈敏度,,正在多肽層面實現(xiàn)qiánsuǒwèiyǒu的jīngzhǔn定量。本文將系統(tǒng)闡述PRM技術在多肽定量中的關鍵機制,、技術優(yōu)勢與優(yōu)化路徑,,并介紹百泰派克生物科技的解決方案。
一,、PRM技術多肽水平定量的基本原理
dànbáizhì經(jīng)酶解后轉化為一系列肽段,,這些肽段作為特征性離子,代表其來源蛋白的表達水平,。多肽層面的定量,,實質上是通過質譜技術對特定肽段進行選擇性檢測,并以其峰面積或強度為基礎進行定量推斷,。
關鍵點包括:
(1)選擇代表性肽段(proteotypic peptides),,需具備dútè性、高響應性和穩(wěn)定性,。
(2)確保肽段在不同樣本中酶解效率一致,,且無翻譯后修飾干擾。
(3)利用穩(wěn)定同位素標記肽(SIL peptides)作為內標校準,,有效消除樣本間及儀器漂移造成的偏差,。
二、PRM技術在多肽定量中的原理與優(yōu)勢
PRM是一種基于高分辨率質譜儀(如Orbitrap)實現(xiàn)的bǎxiàngdàn白定量掃描技術,,其核心優(yōu)勢在于:
1,、全碎片離子監(jiān)測:相比SRM需預設1~2對transition,PRM可同時采集所有碎片離子,,提高特異性與定量靈活性,。
2、高分辨率降低干擾:通過jīngquè質量篩選(通常為0.005~0.01 Da),,有效過濾背景噪聲,,保障低豐度肽段的檢測準確性。
3,、后處理可調整定量策略:研究者可根據(jù)數(shù)據(jù)質量靈活選擇zuì佳定量離子,,提高結果穩(wěn)定性。
三,、影響多肽定量精度的關鍵因素
1,、肽段選擇與合成:應避免肽段中含有修飾位點、錯義氨基酸或易降解序列,。
2,、內標肽設計與添加:內標肽需嚴格匹配目標肽序列,僅在末端引入同位素標簽,;添加時機應在酶解前,,確保全過程校準。
3,、色譜分離性能:良好的峰形和保留時間穩(wěn)定性是實現(xiàn)線性定量的基礎,。
4、質譜參數(shù)設置:包括孤立窗口(1~2 Da),、zuì大注入時間,、掃描周期等,均需優(yōu)化至靶標響應zuì佳,。
5,、背景抑制與信號強化:采用多階段洗脫、梯度優(yōu)化,、離線分級(如SPE)以減少共洗脫干擾,。
四、PRM vs SRM/MRM:在多肽定量中的對比優(yōu)勢
百泰派克生物科技搭建了基于Orbitrap Exploris 480的PRMbǎxiàngdàn白定量平臺,,具備以下核心技術能力:
1,、高通量靶點篩選服務:結合DIA數(shù)據(jù)與in silico預測,構建靶標肽段候選庫,。
2,、SIL肽定制與質量控制體系:支持多肽級穩(wěn)定同位素內標定制,嚴格驗證純度與定量準確性,。
3,、自動化PRM技術開發(fā)流程:依托Skyline平臺,實現(xiàn)從靶標選擇到參數(shù)優(yōu)化的全流程標準化,。
4,、復雜樣本適配能力:可處理血漿、組織勻漿,、腦脊液等高背景樣本,,提供多維富集與清潔化方案,。
多肽定量的智能化發(fā)展路徑 隨著機器學習算法與AI輔助方法的引入,未來PRM數(shù)據(jù)處理將更加智能化:
1,、自動識別zuì佳定量離子組合
2,、動態(tài)調整采集窗口提升靈敏度
3、多樣本跨批次標準化分析
此外,,結合中等通量自動化平臺與多肽靶點數(shù)據(jù)庫,,將加速疾病標志物的驗證效率,為jīngzhǔn醫(yī)學研究提供高質量證據(jù)支持,。PRM技術已成為多肽層面jīngzhǔnbǎxiàngdàn白定量的重要手段,,尤其在面對低豐度、復雜背景與高重復性要求的科研場景中表現(xiàn)出顯著優(yōu)勢,。百泰派克生物科技將繼續(xù)以zhuānyè的質譜平臺與定制化服務,,助力科研客戶實現(xiàn)更高精度、更強可重復性的bǎxiàngdàn白定量分析,。
百泰派克生物科技特色項目
一,、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務,。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,,對蛋白序列進行分析,。
※服務優(yōu)勢:
1.采用目前世界上*的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二,、dànbáizhì組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學,、多肽組學,、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作,。
※服務優(yōu)勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,,發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,,適用于分析組織、細胞,、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,,分析更系統(tǒng)準確。
三,、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統(tǒng)進行單細胞質譜流式技術分析,,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,,zuì后將原子質量譜數(shù)據(jù)轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優(yōu)勢:
1.技術*,,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,,避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征,,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數(shù)量大,,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,,所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,,在臨床診斷,、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向,。除常規(guī)蛋白外,,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率,、細胞大小,、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等,。
四,、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案,。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別,。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究,,旨在助力科研工作者尋找癌癥,、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標,。
五,、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,,高效色譜分離技術,,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì,、多肽,、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,,到產(chǎn)品變異性和純度分析,。旨在提供優(yōu)質生物藥物分析服務,幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質,。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,,生物質譜多組學優(yōu)質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA,、ICH,、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,,建立了完備的質量體系,,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,,軟件審計追蹤,,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發(fā),、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行,。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務,;
2.獲國家CNAS實驗室認可,,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質量研究服務;
3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學,、多肽組學,、代謝組學、生物藥物表征,、單細胞分析,、單細胞質譜流式,、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,,滿足您一站式服務需求,;
5.服務3000+企業(yè),10000+客戶的選擇,;
6.致力于為您提供優(yōu)質的生物質譜分析服務!