5月26日,,CNHUPO|臨床蛋白質(zhì)組學(xué)和糖組學(xué)學(xué)術(shù)研討會于上海勝利閉幕,。此次研討會,諸多蛋白組學(xué)和糖組學(xué)專家闡述了組學(xué)技術(shù)在醫(yī)學(xué)/臨床研究中的應(yīng)用,,為未來從研究到臨床轉(zhuǎn)化探討了新的思路,,開拓了更加廣闊的應(yīng)用前景。
北京生命科學(xué)研究院邵峰院士
報告題目:Innate immunity to cytosolic LPS:Pyroptosis and beyond
報告主要內(nèi)容:
大會由復(fù)旦大學(xué)陸豪杰教授致開幕詞,,北京生命科學(xué)研究所邵峰院士做了題為“Innate immunity to cytosolic LPS:Pyroptosis and beyond”的報告,,明晰了細胞焦亡與傳統(tǒng)細胞凋亡的區(qū)別,闡述了分子免疫機制:Caspase-4/5/11作為胞內(nèi)LPS的受體,,識別LPS的Lipid A部分,,進而發(fā)生寡聚化而激活。這些細菌免疫受體活化后,,均通過誘導(dǎo)組裝炎癥小體復(fù)合物進而激活膜打孔蛋白GSDMD,,誘發(fā)細胞焦亡。
復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院副院長楊芃原教授
報告題目:疾病糖蛋白質(zhì)組的定量質(zhì)譜
報告主要內(nèi)容:
從質(zhì)譜技術(shù)發(fā)展歷史,,到質(zhì)譜如何幫助蛋白組學(xué)研究,,再到質(zhì)譜技術(shù)未來向臨床發(fā)展的展望:以MRM為基礎(chǔ)的質(zhì)譜ELISA技術(shù)可以在臨床檢驗中逐步部分取代現(xiàn)有傳統(tǒng)ELISA,特別是檢驗具有群和網(wǎng)絡(luò)特征的關(guān)鍵蛋白,。同時,,運用Orbitrap技術(shù)的pGlyco 2.0提供給糖蛋白研究者又一有效的定量策略。
國家蛋白質(zhì)科學(xué)中心·北京秦鈞主任
報告題目:胃癌的臨床蛋白組學(xué)研究
報告主要內(nèi)容:
從蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用于臨床所面臨的問題,,到未來蛋白質(zhì)組學(xué)走向臨床的前景,,秦鈞教授通過一些臨床研究實例,講述了如何在實踐中逐步克服臨床生物樣本,、檢測手段等方面的局限性,,描繪了蛋白質(zhì)組學(xué)驅(qū)動轉(zhuǎn)化臨床的可行性,。尤其是惡性腫瘤化療藥物靶點,、免疫治療標志物、治療響應(yīng)性標志物等,,有望應(yīng)用于臨床伴隨診斷,。無論是在探索分子病理方面,,抑或是實現(xiàn)臨床早診、治療領(lǐng)域,,蛋白質(zhì)組學(xué)都發(fā)揮著越來越重要的作用,。蛋白質(zhì)組學(xué)驅(qū)動的醫(yī)療時代(Proteomics-driven precision medicine)已經(jīng)被開啟。
同濟大學(xué)田志新教授
報告題目:基于糖蛋白質(zhì)組學(xué)的癌癥和癌癥干細胞生物標志物的分析
報告主要內(nèi)容:
同濟大學(xué)田志新教授,,做了在肝癌,、乳腺癌研究中發(fā)現(xiàn)N-糖蛋白質(zhì)標志物的報告,結(jié)合ZIC-HILIC富集,、同位素二甲基標記,、pentaHILIC-nESI-MS/MS(HCD,stepped NCEs),、GPseeker定性,、GPseekerQuan定量,對HCC HepG2細胞中差異表達N-糖基化在完整水平上進行大規(guī)模位點和結(jié)構(gòu)特異性的分離,、鑒定和定量,。
西湖大學(xué)郭天南教授
西湖大學(xué)的郭天南教授介紹了運用DIA技術(shù)結(jié)合PCT快速樣品前處理技術(shù)在臨床大隊列樣本研究中的應(yīng)用,以及使用Orbitrap技術(shù)平臺建立人類多個組織蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)庫,,為DIA和PRM分析提供便利,。
賽默飛HRMS1-DIA方案廣受關(guān)注
大會報告中賽默飛應(yīng)用經(jīng)理周岳,帶來HRMS1-DIA技術(shù)在臨床大樣本蛋白質(zhì)組學(xué)分析中的可行性評價:
經(jīng)過來自9個國家和地區(qū)的11個實驗室,,連續(xù)7天24小時運行,,基于HRMS1-DIA工作流表現(xiàn)出長期運行中保持*的穩(wěn)定性,在不同儀器及實驗室間產(chǎn)生的數(shù)據(jù)也有重現(xiàn)性以及提供蛋白質(zhì)組學(xué)準確定量結(jié)果,。HRMS1-DIA工作流可對醫(yī)學(xué)研究中的大隊列生物樣品進行高通量和深度的蛋白質(zhì)組定量,。
HRMS1-DIA方案優(yōu)勢:
1、相對傳統(tǒng)DIA的二級碎片離子定量,,基于超高分辨一級全掃描的HRMS1-DIA定量蛋白和多肽的數(shù)量和準確性都有顯著提高(蛋白鑒定數(shù)目提高10%,,CV<10%)
2、在HRMS1-DIA工作流正常運行的狀態(tài)下,,全部11個實驗室,,平均可以鑒定到超過8000個蛋白(1% protein FDR),定量超過6000個蛋白,。
3,、在定量準確性方面,在1小時定量6000個蛋白,,50000個肽段的超高通量下,,HRMS1-DIA工作流提供93%的定量準確性。
4,、超高80%的蛋白可以在每天,、每個實驗室定量,。
賽默飛HRMS1-DIA方案對于蛋白質(zhì)組學(xué)的臨床轉(zhuǎn)化具有極為廣泛的參考價值,超高的穩(wěn)定性,、日間重復(fù)性成為臨床研究領(lǐng)域用戶值得期待的技術(shù),。
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