首頁(yè) >> 公司動(dòng)態(tài) >> ASTRAL客戶之聲| 高通量與高深度兼得，拓展蛋白質(zhì)分析的極限
原創(chuàng) 飛飛 賽默飛色譜與質(zhì)譜中國(guó)
關(guān)注我們,，更多干貨和驚喜好禮
導(dǎo)語(yǔ)：
賽默飛在2023年ASMS上發(fā)布的全新Orbitrap Astral超高分辨質(zhì)譜儀,，一經(jīng)問(wèn)世立即引起了國(guó)內(nèi)學(xué)界的廣泛關(guān)注。隨之,，眾多行業(yè)精英紛紛訂購(gòu)這一劃時(shí)代的革命性產(chǎn)品,。隨著shou批用戶的裝機(jī)，相關(guān)實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)陸續(xù)發(fā)布,。為此我們精心匯總了shou家用戶—諾禾致源所攬獲的實(shí)測(cè)數(shù)據(jù),，從細(xì)胞到血漿，從植物到動(dòng)物,，這款革命性的質(zhì)譜儀以其無(wú)與lun比的性能,，quan方位刷新了學(xué)界對(duì)質(zhì)譜儀的認(rèn)知,。
01
Hela細(xì)胞--180 runs/天，
真正的高通量分析時(shí)代已經(jīng)來(lái)臨
采用Orbitrap Astral高分辨質(zhì)譜儀對(duì)Hela細(xì)胞裂解液樣本進(jìn)行分析,，分別測(cè)試8 min,、15 min、24 min 的時(shí)間梯度,。結(jié)果顯示,，8 min 梯度（包括上樣、平衡,、洗脫,、有效分析時(shí)間的總時(shí)長(zhǎng)）下蛋白質(zhì)鑒定數(shù)目可達(dá)8,000+。這意味著每天可實(shí)現(xiàn)180個(gè)樣本的分析通量,，運(yùn)行成千上萬(wàn)樣本的大隊(duì)列分析可成為每個(gè)蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)室的日常,。真正的高通量分析時(shí)代已經(jīng)來(lái)臨！
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在24 min梯度下,，鑒定數(shù)目可輕松達(dá)到 10,000+,，實(shí)現(xiàn)更高深度的覆蓋。該測(cè)試結(jié)果不僅相較HF-X（1μg上樣量,，90分鐘梯度）的分析深度（7285個(gè)蛋白）得到了3400+新的蛋白質(zhì)定性數(shù)據(jù),，而且可覆蓋HF-X數(shù)據(jù)的98.5%。這意味著采用Astral分析平臺(tái),，不僅可以完美重現(xiàn)以往深度分析的鑒定結(jié)果,，還使分析效率提升了3-4倍，同時(shí)獲得了更卓越的鑒定效果,。Astral多快好省助力蛋白質(zhì)組學(xué)高深度分析,。
02
血漿-短梯度蛋白分析深度新突破
以往，血漿蛋白質(zhì)組的復(fù)雜性限制了大規(guī)模,、無(wú)偏的蛋白質(zhì)組學(xué)研究,。使用Orbitrap Astral高分辨質(zhì)譜儀，對(duì)不同血漿蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法的性能進(jìn)行了比較,，得到了前suo未有的優(yōu)異結(jié)果。通過(guò)去除高豐度蛋白,，顯著增加了分析的深度,。僅使用500 ng血漿蛋白量，在24min梯度下鑒定數(shù)目就可以超過(guò)1,200個(gè),，血漿蛋白鑒定數(shù)目提升45%,。這一發(fā)現(xiàn)使得在精簡(jiǎn)的工作流程基礎(chǔ)上，實(shí)現(xiàn)血漿蛋白質(zhì)組學(xué)高深度,、廣覆蓋的研究成為現(xiàn)實(shí),。
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03
植物組織-一針上樣窮盡擬南芥蛋白定性結(jié)果成為可能
采用非數(shù)據(jù)依賴性數(shù)據(jù)采集模式(DIA),， Orbitrap Astral 質(zhì)譜儀實(shí)現(xiàn)了擬南芥樣本的高深度分析。其中,，擬南芥葉樣本蛋白鑒定數(shù)目達(dá)到11,195,，根莖樣本蛋白鑒定數(shù)目達(dá)到12,781。值得注意的是,，與 2020 年Nature公開發(fā)表的擬南芥蛋白質(zhì)深度分析數(shù)據(jù)相比,，本次在 Astral 平臺(tái)僅通過(guò)2種擬南芥樣本，3次重復(fù),，在短短24min梯度分析中得到的蛋白分析結(jié)果,，即可覆蓋30種擬南芥組織公開數(shù)據(jù)80%以上的蛋白。這表明通過(guò) Astral 質(zhì)譜儀,，或可實(shí)現(xiàn)僅通過(guò)單針上樣即可基本窮盡樣本蛋白質(zhì)定性結(jié)果,。
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04
動(dòng)物組織-輕松擴(kuò)展蛋白質(zhì)分析的邊界
使用 Orbitrap Astral 高分辨質(zhì)譜儀檢測(cè)，在小鼠組織樣本可在24min梯度輕松實(shí)現(xiàn)蛋白鑒定數(shù)10,000+,，肽段鑒定數(shù)目120,000+的優(yōu)異結(jié)果,。其中小鼠腦組織樣本蛋白鑒定數(shù)目為11,204，小鼠睪丸組織樣本蛋白鑒定數(shù)目12,660,，小鼠腎臟組織樣本蛋白鑒定數(shù)目10,544,。這些測(cè)試數(shù)據(jù)進(jìn)一步刷新和擴(kuò)展了動(dòng)物組織樣本分析的邊界，為廣大科研工作者帶來(lái)更多科技的驚喜和突破,！
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卓越的穩(wěn)定性和定量準(zhǔn)確性
在實(shí)現(xiàn)上述亮眼測(cè)試結(jié)果的同時(shí),，也對(duì)Astral進(jìn)行了重復(fù)性和穩(wěn)定性測(cè)試。對(duì)200 ng蛋白含量的Hela細(xì)胞裂解液樣本進(jìn)行3次重復(fù)進(jìn)樣檢測(cè),，對(duì)所鑒定蛋白CV進(jìn)行統(tǒng)計(jì),，發(fā)現(xiàn)3次進(jìn)樣CV<20%的占比為92.7%，CV的中位值是3%（下圖左）,。
使用Orbitrap Astral 高分辨質(zhì)譜儀能夠精確測(cè)定由小鼠腦組織,、大腸桿菌和擬南芥多種比例的混合物樣本中每種來(lái)源的蛋白質(zhì)比例，表明數(shù)據(jù)采集具有出色的準(zhǔn)確性,。該項(xiàng)測(cè)試中共鑒定得到 14,153 種蛋白質(zhì),，包括幾乎整個(gè)大腸桿菌蛋白質(zhì)組（下圖右）。
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注：文中所有實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)來(lái)自北京諾禾致源生物科技有限公司
諾禾致源（688315）成立12年以來(lái),，始終基于用戶需求不斷探索更多應(yīng)用場(chǎng)景下的多組學(xué)整合解決方案,。在蛋白質(zhì)組和代謝組學(xué)研究方面，基于高性能質(zhì)譜平臺(tái)以及樣本處理全自動(dòng)化產(chǎn)線,，積累了豐富的檢測(cè)及分析經(jīng)驗(yàn),。此次引進(jìn)賽默飛Orbitrap Astral高分辨質(zhì)譜平臺(tái)，將助其繼續(xù)發(fā)揮專業(yè)優(yōu)勢(shì)，以豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),、優(yōu)質(zhì)高效穩(wěn)定的服務(wù)為科研工作者賦能,。
結(jié)語(yǔ)
在諾禾致源多次測(cè)試中，Orbitrap Astral都以令人振奮的性能刷新了質(zhì)譜分析的能力邊界,。如下圖所示,，它將久經(jīng)考驗(yàn)的 Orbitrap 分析器與全新的 Astral 分析器相結(jié)合，將 Orbitrap超高分辨的優(yōu)勢(shì)發(fā)揮到j(luò)i致的同時(shí),，兼具超快的掃描速度和超高的檢測(cè)靈敏度,，集高通量、高覆蓋度,，及精準(zhǔn)定量性于一體,。可全方面為DIA（數(shù)據(jù)非依賴掃描）,、PTM（蛋白質(zhì)翻譯后修飾）,、TMT18-plex標(biāo)記定量、單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué),、大隊(duì)列分析等領(lǐng)域帶來(lái)革命性的變革,，讓我們共同期待中國(guó)shou批用戶后續(xù)更多維度的測(cè)試數(shù)據(jù)。
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