化合物鑒定效率低下在中藥研發(fā)過程一直是個難題,，想要使鑒定效果*，除了需要的儀器設備之外,，如能有個涵蓋全面,、高精質(zhì)量的數(shù)據(jù)庫掌握在手，是否能夠成為研發(fā)人員的福音呢,？請看賽默飛如何攜手清華大學實現(xiàn)這一點：
研究背景
隨著質(zhì)譜技術的不斷發(fā)展,，尤其是利用高分辨質(zhì)譜能夠準確獲取待測物質(zhì)荷比，適用于復雜樣品中多種化合物的同時高選擇性分析,，具有檢測靈敏度高,、動態(tài)范圍寬的特點，因此,，其在化合物定性研究領域越來越受到廣大學者歡迎,。需要注意的是，雖然通過高分辨質(zhì)譜技術,，可以直接觀測到化合物的保留時間,、質(zhì)荷比,、同位素分布和碎片離子信息，但是在進行結(jié)構(gòu)推導時需利用大量文獻檢索和分析人員的經(jīng)驗才能完成,，導致化合物鑒定效率低下,。
為了解決質(zhì)譜結(jié)構(gòu)推導問題，幫助研究人員快速準確鑒定中藥成分,，賽默飛世爾科技與清華大學藥學院藥物發(fā)現(xiàn)平臺合作,，以《中國藥典》2015年版（一部）收錄的中藥材為參考，利用Thermo Scientific靜電場軌道阱 (Orbitrap) 高分辨質(zhì)譜平臺,，采用特定的色譜-質(zhì)譜采集方法,，完成了1200余種中藥化合物對照品的一級和碎片質(zhì)譜圖采集，獲得了7千多張目前市面上zui高質(zhì)量的二級質(zhì)譜圖,。可實現(xiàn)中藥及天然產(chǎn)物成分的快速準確表征,。
01賽默飛中藥高分辨數(shù)據(jù)庫簡介
數(shù)據(jù)庫收載化合物來源于將近430種常見植物藥、動物藥,、瀕危物種和藥食同源物種,，涵蓋所有常見的中藥成分類型，如苯丙素,、醌,、黃酮、萜,、甾體,、生物堿,、酚酸和其他類等,。
在數(shù)據(jù)處理軟件TraceFinder和Compound Discoverer (CD) 的幫助下，根據(jù)化合物的保留時間,、不同加和離子的質(zhì)荷比,、同位素豐度、碎片離子等信息可對原始數(shù)據(jù)進行數(shù)據(jù)庫檢索并綜合打分,，從而快速鑒定化合物的結(jié)構(gòu),。
該數(shù)據(jù)庫的優(yōu)勢在于：
①采用特定數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)，獲得相對固定的化合物保留時間,，可為鑒定化合物同分異構(gòu)體提供幫助,；
②Orbitrap高分辨質(zhì)譜儀具有分辨率高、質(zhì)量精度高,、穩(wěn)定性好等特點,，有力保障了數(shù)據(jù)庫譜圖質(zhì)量；
③添加了常見的植物基源,，可對特定中藥的成分進行快速篩選,；
④各化合物均添加了CAS ID 、ChemSpider ID 和PubChem ID ，可以鏈接至相應做結(jié)構(gòu)查找,。
02樣品采集系統(tǒng)
本數(shù)據(jù)庫基于超液相色譜-靜電場軌道阱高分辨質(zhì)譜 (UHPLC-Orbitrap HRMS) 平臺,。可適用于Q Exactive系列,、Fusion系列高分辨質(zhì)譜所采集的數(shù)據(jù)檢索,。
03數(shù)據(jù)庫界面展示
本數(shù)據(jù)庫分別基于TraceFinder軟件和譜圖管理軟件mzVault進行搭建，得到可用于高通量快速篩查的Database和可用于實際譜圖匹配的Spectral Library,。
圖1 基于TraceFinder軟件平臺的Database界面
圖2 基于mzVault軟件平臺的Spectral Library界面
04數(shù)據(jù)庫應用領域
該高分辨數(shù)據(jù)庫結(jié)合Thermo Scientific已有的在線高分辨數(shù)據(jù)庫mzCloud,，使得賽默飛在中藥成分鑒定、有害殘留控制和植物代謝組學等研究領域的解決方案更加完善,。
圖3 賽默飛中藥成分鑒定解決方案
圖4 賽默飛植物代謝組學解決方案
特別鳴謝
OTCML數(shù)據(jù)庫凝聚了清華大學藥學院藥物發(fā)現(xiàn)平臺各位老師的傾情奉獻與汗水,，特此鳴謝為該數(shù)據(jù)庫做出貢獻的科學家們：
丁怡：教授，清華大學藥學院藥物發(fā)現(xiàn)平臺主管,；
侯朋藝：博士,，賽默飛世爾科技生命科學質(zhì)譜應用專家；
艾靜雅：清華大學藥學院藥物發(fā)現(xiàn)平臺質(zhì)譜應用工程師,；
龐歡歡：清華大學藥學院博士后,；
其他參與數(shù)據(jù)庫建立工作人員：宋詞（清華大學藥學院）
更多詳情，請關注“賽默飛色譜與質(zhì)譜中國”公眾號,。
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