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高分辨代謝物數(shù)據(jù)庫(kù) 在合成生物學(xué)非靶向代謝物分析的應(yīng)用研究

閱讀:669      發(fā)布時(shí)間:2020-06-19
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目標(biāo): 本文應(yīng)用非靶向代謝組學(xué)闡釋了在不同生長(zhǎng)條件下,,誘導(dǎo)劑類型和濃度 對(duì)工程菌代謝指紋譜圖的影響。

簡(jiǎn)介: 制藥,、農(nóng)業(yè)以及加工制造業(yè)對(duì)特種化合物的巨大需求,,一直是現(xiàn)代化學(xué) 工業(yè)面臨的巨大挑戰(zhàn)之一。而現(xiàn)代化學(xué)工業(yè)需要在日益嚴(yán)格的監(jiān)管審查 情況下,,不得不提出環(huán)境友好型的生產(chǎn)方法,。由合成生物學(xué)和科技驅(qū)動(dòng) 的生物技術(shù)方法被認(rèn)為是有潛力能夠提供必要的持續(xù)解決方案。合成生 物學(xué)的核心是將“設(shè)計(jì)-構(gòu)建測(cè)試框架1”應(yīng)用于重新設(shè)計(jì)的天然生物系 統(tǒng)內(nèi)以實(shí)現(xiàn)目的,。通過(guò)在微生物(例如大腸桿菌2和鏈霉菌屬3)的“ 生物工廠”中插入和微調(diào)遺傳信息,,組裝復(fù)雜的酶促途徑以實(shí)現(xiàn)化學(xué)物 質(zhì)的快速和多樣化生成。像異丙基β-D-1-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG) (Lac啟動(dòng)子)或四環(huán)素(Tet啟動(dòng)子)這樣的誘導(dǎo)型細(xì)菌啟動(dòng)子,,通常用 于激活基因轉(zhuǎn)錄,,開啟工程化生物合成途徑。然而,,人們還未*掌握 這些誘導(dǎo)系統(tǒng)與整個(gè)細(xì)菌代謝組的相互作用,,尤其是毒副作用方面的影 響。

本研究的目的是研究不同增長(zhǎng)條件下,,如何應(yīng)用非靶向代謝組學(xué)了解誘 導(dǎo)劑類型和濃度對(duì)工程菌(含有IPTG誘導(dǎo)型紅色熒光蛋白表達(dá)質(zhì)粒pBbA1a-RFP的大腸桿菌DH5α)代謝指紋譜圖的影響,。這種表型信息有可 GC-Orbitrap/MS結(jié)合高分辨代謝物數(shù)據(jù)庫(kù) 在合成生物學(xué)非靶向代謝物分析的應(yīng)用研究 能為上游基因調(diào)控提供參考,同時(shí)也可更好地定義該啟動(dòng)子 在生化途徑表達(dá)中的有效用途。

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