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賽默飛精彩亮相第十屆烏普薩拉國際會議

閱讀:32      發(fā)布時(shí)間:2024-11-20
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——ETD技術(shù)發(fā)明人分享研究成果

2013年2月17日,,第十屆烏普薩拉電子捕獲與電子轉(zhuǎn)移裂解國際會議(UPPCON 2013)在北京友誼賓館召開,由北京生命科學(xué)研究所(NIBS)和中科院計(jì)算技術(shù)研究所合作承辦,。UPPCON 2013是一個(gè)偏重質(zhì)譜基礎(chǔ)研究的國際會議,,圍繞離子-離子和離子-電子的氣相反應(yīng)的理論、實(shí)驗(yàn),、儀器開發(fā)和應(yīng)用,,數(shù)位最的的學(xué)者介紹他們的研究工作。
 

 
會議現(xiàn)場
 

 
賽默飛展臺
 

賽默飛科技ETD技術(shù)發(fā)明人 John E.P.Syka博士
 

賽默飛ETD技術(shù)發(fā)明人John E.P. Saka博士的報(bào)告題目是《Instrumental Approaches to Improving ETD Spectral Quality》,,介紹了ETD技術(shù)的進(jìn)展,。
ETD是基于離子/離子氣相化學(xué)一種碎裂多肽的新方法,是鑒定蛋白及其翻譯后修飾強(qiáng)有力的工具,。ETD通過從陰離子自由基到質(zhì)子肽轉(zhuǎn)移電子的化學(xué)能量將肽碎裂,,引發(fā)多肽骨干分裂,獲得蛋白質(zhì)翻譯后修飾的重要序列信息,。 


LTQ Orbitrap 系統(tǒng)結(jié)構(gòu)
 

傳統(tǒng)的誘導(dǎo)活化裂解(CAD)常用來鑒定蛋白,,并試圖確定和找到它們修飾的位點(diǎn),但CAD技術(shù)有其固有的缺點(diǎn),。與線性離子阱的結(jié)合使用的ETD,,可以很容易鑒定用CAD不能鑒定的多肽,。
ETD 是由電子捕獲解離ECD 發(fā)展而來,但ECD僅能在的FT ICR 高分辨質(zhì)譜上使用,,而ETD 的誕生,,可以較為經(jīng)濟(jì)的在低分辨離子阱質(zhì)譜上實(shí)現(xiàn)同樣的功能。
報(bào)告討論了在質(zhì)譜上提高ETD產(chǎn)生離子的數(shù)量的方法,。分別從兩個(gè)方面,,一是進(jìn)入ETD的離子數(shù)量,一是ETD產(chǎn)生的m/z離子的數(shù)量,。
 


賽默飛應(yīng)用中心 張偉博士 

賽默飛應(yīng)用中心張偉博士作了題為《Method Development of Typical ETD Experiments for Proteomics Applications》的報(bào)告,。
張博士認(rèn)為,ETD的發(fā)展非常迅速,,能獲得更豐富的系列碎片,。在蛋白質(zhì)組學(xué)等領(lǐng)域,ETD與CID是很好的互補(bǔ),,30%蛋白質(zhì)組學(xué)的用戶都在使用這個(gè)技術(shù),。
ETD產(chǎn)生離子的反應(yīng)機(jī)理
ETD產(chǎn)生離子的反應(yīng)機(jī)理很簡單,當(dāng)電子轟擊氮?dú)獾臅r(shí)候,,會產(chǎn)生一個(gè)熱電子,,熱電子很容易被捕獲,肽段發(fā)生斷裂反應(yīng),。相對于傳統(tǒng)的CAD技術(shù),,ETD提供了更穩(wěn)定的方法來定性PTMs,鑒定大型多肽或甚至整個(gè)蛋白質(zhì),。ETD能夠?qū)⑵胀ǚg后修飾的多肽,,或者多個(gè)堿性殘基的多肽甚至整個(gè)蛋白質(zhì)生成離子。 ETD也可以輕易碎裂含有二硫鍵的的多肽,。

ETD中電子轉(zhuǎn)移裂解原理
 


ETD達(dá)到狀態(tài)的途徑
ETD實(shí)驗(yàn)達(dá)到的狀態(tài),,主要通過四個(gè)部分的調(diào)節(jié),一是對ETD源的調(diào)諧和優(yōu)化,,二是建立合適的Tune文件,,三是建立分析方法,最后是數(shù)據(jù)處理,、搜庫軟件,。
ETD應(yīng)用的例子
CID+ETD、CID-NL-ETD,、DDDT的磷酸化蛋白質(zhì)組的分析,。從老鼠睪丸體中取出全蛋白,通過分解后,,用IMAC富集,,然后數(shù)據(jù)處理就用PD Workflow,。通過一系列的數(shù)據(jù)處理之后就得到所有譜圖的鑒定結(jié)果。CID+ETD,、CID-NL-ETD,、DDDT三種策略也是很好的互補(bǔ)。

 
CID+ETD,、CID-NL-ETD,、DDDT的互補(bǔ)性


關(guān)于賽默飛世爾科技
賽默飛世爾科技(紐約證交所代碼: TMO)是科學(xué)服務(wù)領(lǐng)域的世界。我們的使命是幫助客戶使世界更健康,、更清潔,、更安全。公司年銷售額130億美元,,員工約39,000人,。主要客戶類型包括:醫(yī)藥和生物技術(shù)公司、醫(yī)院和臨床診斷實(shí)驗(yàn)室,、大學(xué),、科研院所和政府機(jī)構(gòu),以及環(huán)境與過程控制行業(yè),。借助于Thermo Scientific,、Fisher Scientific和Unity™ Lab Services三個(gè)首要品牌,我們將創(chuàng)新技術(shù),、便捷采購方案和實(shí)驗(yàn)室運(yùn)營管理的整體解決方案相結(jié)合,,為客戶、股東和員工創(chuàng)造價(jià)值,。我們的產(chǎn)品和服務(wù)幫助客戶解決在分析領(lǐng)域所遇到的復(fù)雜問題與挑戰(zhàn),,促進(jìn)醫(yī)療診斷發(fā)展、提高實(shí)驗(yàn)室生產(chǎn)力,。欲了解更多信息,請瀏覽公司網(wǎng)站:

關(guān)于賽默飛中國
賽默飛世爾科技進(jìn)入中國發(fā)展已有30多年,,在中國的總部設(shè)于上海,,并在北京、廣州,、香港,、中國臺灣、成都,、沈陽,、西安、南京,、武漢等地設(shè)立了分公司,,員工人數(shù)超過2300名,。我們的產(chǎn)品主要包括分析儀器、實(shí)驗(yàn)室設(shè)備,、試劑,、耗材和軟件等,提供實(shí)驗(yàn)室綜合解決方案,,為各行各業(yè)的客戶服務(wù),。為了滿足中國市場的需求,現(xiàn)有5家工廠分別在上海,、北京和蘇州運(yùn)營,。我們在北京和上海共設(shè)立了5個(gè)應(yīng)用開發(fā)中心,將的前沿技術(shù)和產(chǎn)品帶給國內(nèi)客戶,,并提供應(yīng)用開發(fā)與培訓(xùn)等多項(xiàng)服務(wù),;位于上海的中國技術(shù)中心結(jié)合國內(nèi)市場的需求和技術(shù),研發(fā)適合中國的技術(shù)和產(chǎn)品,;我們擁有遍布全國的維修服務(wù)網(wǎng)點(diǎn)和特別成立的維修服務(wù)中心,,在全國有超過400名經(jīng)過培訓(xùn)認(rèn)證的、具有專業(yè)資格的工程師提供售后服務(wù),。我們致力于幫助客戶使世界更健康,、更清潔、更安全,。欲了解更多信息,,請登錄

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