Edman降解 vs 質(zhì)譜：蛋白質(zhì)測序技術(shù)對比（二）檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

dànbáizhì作為細胞功能的核心執(zhí)行者,，其氨基酸序列信息不僅揭示其結(jié)構(gòu)與功能,，還為生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)、抗體鑒定,、疫苗設(shè)計等應(yīng)用提供基礎(chǔ),。dànbáizhì測序，作為解析氨基酸組成與排列的關(guān)鍵技術(shù),，歷經(jīng)數(shù)十年發(fā)展,，主要形成了兩種主流路徑：Edman降解法與質(zhì)譜（Mass Spectrometry, MS）法,。那么，這兩種dànbáizhì測序技術(shù)各有何優(yōu)勢,，又適用于哪些研究場景,？本文將為您全面對比解析。

一,、什么是Edman降解,？

Edman降解是由Pehr Edman于1950年開發(fā)的一種經(jīng)典dànbáizhì測序技術(shù)，原理是通過化學(xué)方式依次從N端切割出氨基酸,，并加以鑒定,，從而一步步推斷蛋白序列。

1,、核心機制

（1）PITC標(biāo)記：苯異硫氰酸酯（PITC）與N端氨基酸反應(yīng)形成環(huán)狀衍生物,；

（2）酸解切除：釋放出dìyī個氨基酸衍生物（PTH-aa）；

（3）高效液相色譜（HPLC）分析：鑒定該氨基酸種類,；

（4）重復(fù)上述步驟，逐個讀取氨基酸,。

2,、優(yōu)點

（1）高保真度，適用于序列已知或抗體驗證,；

（2）適用于純化程度高的dànbáizhì,；

（3）對序列中氨基酸修飾不敏感。

3,、局限

（1）通常只能測定前30–50個氨基酸,；

（2）要求樣品純度高，量大,；

（3）對C端及中段序列無能為力,；

（4）無法識別翻譯后修飾（PTMs）。

二,、什么是質(zhì)譜蛋白測序,？

質(zhì)譜法測序是通過對dànbáizhì或肽段的質(zhì)量-電荷比（m/z）進行jīngquè測定，結(jié)合數(shù)據(jù)庫搜索或de novo算法,，實現(xiàn)蛋白序列解析的現(xiàn)代技術(shù)路徑,。

1、核心流程

（1）蛋白酶切：如yídànbáiméi水解蛋白成小肽,；

（2）LC-MS/MS分析：液相色譜分離 + 串聯(lián)質(zhì)譜碎裂肽段,；

（3）數(shù)據(jù)庫匹配或de novo算法推斷序列。

2,、優(yōu)點

（1）高通量：可同時測定上千種dànbáizhì,；

（2）靈敏度高：納克級甚至皮克級樣本也能測序,；

（3）識別翻譯后修飾：如磷酸化、乙?；?、糖基化等；

（4）適配復(fù)雜樣本：如細胞裂解液,、組織提取物,、血漿等。

3,、局限

（1）對小肽（< 5 aa）難以解析,；

（2）de novo算法結(jié)果需驗證，存在一定不確定性,；

（3）復(fù)雜修飾,、異構(gòu)體可能增加鑒定難度。

三,、二者比較一覽

四,、dànbáizhì測序技術(shù)選擇建議

若您手頭擁有高純度單一蛋白，并希望驗證其N端序列或抗體片段,，Edman降解仍具價值,；

若您關(guān)注整體蛋白表達譜、翻譯后修飾,、或進行未知蛋白序列測定,，質(zhì)譜法則是更現(xiàn)代、高效的選擇,。

在dànbáizhì測序需求日益增長的jīntiān,，選擇可靠的實驗平臺至關(guān)重要。百泰派克生物科技依托先進的Orbitrap與Q-TOF質(zhì)譜平臺,，提供涵蓋N/C端測序,、de novo肽段測序、翻譯后修飾分析等多樣化服務(wù),。我們不僅滿足科研人員的基礎(chǔ)需求,，更助力生物醫(yī)藥企業(yè)推進抗體藥物研發(fā)、疫苗驗證與創(chuàng)新蛋白設(shè)計,。無論您是科研單位,、醫(yī)院研究者，還是生物醫(yī)藥企業(yè),，歡迎聯(lián)系我們,，一站式解決dànbáizhì測序難題。

百泰派克生物科技特色項目

一,、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，N端測序,，C端測序和全序列分析,，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì,，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),，對蛋白序列進行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上先進的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液,、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響,。

二,、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué),、靶向dànbáizhì組學(xué),、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù),。此外,，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué),、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,，適用于分析組織、細胞,、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,，實驗結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,，分析更系統(tǒng)準確,。

三、單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細胞表面和內(nèi)部的分子,，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質(zhì)量譜,，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量,。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)先進，填補技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題,?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標(biāo)同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標(biāo)蛋白,。

2.分析數(shù)量大,，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞,，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq,。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化,，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景,；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向,。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾,；

③可檢測細胞存活率,、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量,、DNA合成速率以及蛋白酶活性等,。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的,、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案,。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進行免疫肽組學(xué)分析,，可從zuì小的樣品材料中進行可重復(fù)的識別和定量,。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥,、免疫疾病及傳染病的解決方案,，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五,、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù),，提供一系列完善的生物藥物分析方案,，從dànbáizhì、多肽,、抗體,、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析,。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì),。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù),。公司實驗室遵循NMPA,、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證,，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,，設(shè)備定期計量/期間核查,，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),，支持新藥研發(fā),、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù),；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù),；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué),、多肽組學(xué)、代謝組學(xué),、生物藥物表征,、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式,、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等,；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務(wù)需求,；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇,；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

Edman降解 vs 質(zhì)譜：蛋白質(zhì)測序技術(shù)對比（二）檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹