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DNA專題:血基因組DNA提取實(shí)驗(yàn)

2013-7-22  閱讀(1709)

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血基因組DNA提取可以:(1)從凍全血,、血漿,、血清,、骨髓,、其他體液、淋巴細(xì)胞,、培養(yǎng)細(xì)胞,、病毒和線粒體中提取DNA;(2)用于后續(xù)測(cè)序,、遺傳信息學(xué)等研究,。

實(shí)驗(yàn)方法
  • 血基因組DNA 試劑盒提取法
  • 血基因組DNA大量試劑盒提取法
  • 血基因組DNA中量試劑盒提取法
實(shí)驗(yàn)方法原理 本試劑盒采用*的兩相分離技術(shù),,結(jié)合DNA制備膜選擇性地吸附DNA的方法達(dá)到純化基因組DNA的目的,。適合從3ml的抗凝人或哺乳動(dòng)物全血獲得100 μg的基因組DNA,抗凝鳥類或兩棲動(dòng)物全血中獲得多至120 μg的基因組DNA,。
實(shí)驗(yàn)材料
試劑,、試劑盒
儀器、耗材
實(shí)驗(yàn)步驟
一,、試劑盒組成,、貯存、穩(wěn)定性
 
說(shuō)明書,,耗材:中量制備管,、中量濾器、連接管,、塑料扳手,、中量管蓋。
 
Buffer VL:細(xì)胞和病毒裂解液,,室溫密閉貯存,。
 
Buffer G-B:蛋白沉淀液,室溫密閉貯存,。
 
Buffer DV-A:Buffer DV 的制備液,,請(qǐng)參照實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備Buffer DV 的配制方法配制,室溫密閉貯存,。
 
Buffer DV:相分離液,,室溫密閉貯存。
 
Buffer BV:DNA 結(jié)合液,,室溫密閉貯存,。
 
Buffer W1:洗滌液,室溫密閉貯存,。
 
Buffer W2 concentrate:去鹽液,。使用前,根據(jù)瓶上數(shù)量加入乙醇,,混合均勻,,室溫密閉貯存??捎?00%乙醇或95%乙醇,。
 
Eluent:2.5 mM Tris-HCl,pH 8.5,,室溫密閉貯存,。
 
二、實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備
 
1. *次使用時(shí),在Buffer W2 concentrate 中按試劑瓶上的體積加入無(wú)水乙醇,。
 
2. 準(zhǔn)備無(wú)核酸和核酸酶污染的Tip 頭,、離心管。
 
3. 制備Buffer DV:取2 ml Buffer DV-A 125 ml 異丙醇,,75 ml 異丁醇,,加入提供的250 ml 試劑瓶中,混合均勻,。
 
4. 4℃預(yù)冷Buffer DV,。
 
三、操作步驟
 
【DNA 釋放 】
 
1. 將3 ml 抗凝全血加入一50 ml 離心管中,,若全血樣本體積不足3 ml,用PBS 補(bǔ)充至3 ml,。

2. 加入6 ml Buffer VL,,蓋緊離心管帽,旋渦振蕩1 min,。
 
3. 加入6 ml Buffer G-B,,再次蓋緊離心管帽,立刻上下混勻,。
 
【兩相分離去除蛋白和其它雜質(zhì)】
 
4. 加入12 ml Buffer DV(4℃預(yù)冷),,用力混合均勻。≥5 000×g 離心5 min,。
 
* 請(qǐng)?jiān)趯?shí)驗(yàn)前按實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備中提供的方法準(zhǔn)備Buffer DV,。
 
5. 盡可能吸盡藍(lán)色上相,保留相間沉淀和下相,。加入12 ml,,4℃預(yù)冷Buffer DV,用力混合,,≥5 000×g 離心5 min,。
 
【基因組DNA 的純化】
 
6. 丟棄上相,將下相轉(zhuǎn)移至中量濾器中(濾器置于另一50 ml 離心管中),,將活塞插入注射器,,緩慢推動(dòng)活塞,收集50 ml 離心管中的濾液,。
 
* 上相必須*棄盡,。
* 如在轉(zhuǎn)移過(guò)程中下相沒有任何界面沉淀,步驟6 可以省略,。
 
7. 棄濾器,,在濾液中加入6 ml Buffer BV,混合均勻,。
 
8. 將連結(jié)管插到負(fù)壓裝置的插口上,,再將DNA 中量制備管插到連結(jié)管上,。將步驟7 的混合液移到制備管中,開啟并調(diào)節(jié)負(fù)壓裝置至-20-30 英寸汞柱,,吸盡管中液體,。
 
9. 保持負(fù)壓,加入8 ml Buffer W1,,吸盡管中液體,。
 
10. 保持負(fù)壓,加入9 ml 已加入乙醇的Buffer W2,,吸盡管中液體,。
 
* 確認(rèn)在Buffer W2 concentrate 中已按試劑瓶上的體積加入無(wú)水乙醇。
 
11. 用塑料扳手將中量制備管中的DNA 結(jié)合部分從負(fù)壓裝置轉(zhuǎn)移至另一潔凈的1.5 ml 離心管中,,加入0.3 ml Buffer W2,,蓋上中量制備管蓋后,12 000×g 離心2 min,。
 
12. 將DNA 結(jié)合部分置于另一潔凈的1.5 ml 離心管中,,在silica 膜中央加0.5 ml Eluent 或去離子水,蓋上中量制備管蓋后,,室溫靜置2 min,,12 000×g 離心1 min 洗脫DNA。
 
* 將去離子水或Eluent 加熱至65℃將提高洗脫效率,。
 
13. 可選步驟:同樣方法,,在silica 膜中央加0.25 ml Eluent 或去離子水,蓋上中量制備管蓋后,,室溫靜置1 min,,12 000×g 離心1 min 洗脫DNA。
 
 
收起 
注意事項(xiàng)
1. Buffer VL,,Buffer BV 和Buffer W1 含刺激性化合物,,操作時(shí)要戴乳膠手套和眼鏡,避免沾染皮膚,、眼睛和衣服,,謹(jǐn)防吸入口鼻。若沾染皮膚,、眼睛時(shí),,要立即用大量清水和生理鹽水沖洗,必要時(shí)尋求醫(yī)療咨詢,。

2. 在按照此說(shuō)明書操作前,,請(qǐng)確保已做好足夠的對(duì)血傳播病毒的防護(hù)工作,按照正確方法處理體液和感染源。
 
3. 操作時(shí)嚴(yán)格按操作步驟進(jìn)行,,廢物必須放入含消毒液的廢物缸,,并高壓滅菌

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