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PCR技術(shù)專題:巢式PCR

2013-11-20  閱讀(2054)

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巢式PCR

標(biāo)簽: 巢式 PCR

巢式PCR是一種變異的聚合酶鏈反應(yīng)(PCR),,使用兩對(而非一對)PCR引物擴增完整的片段,。*對PCR引物擴增片段和普通PCR相似,。第二對引物稱為巢式引物(因為他們在*次PCR擴增片段的內(nèi)部)結(jié)合在*次PCR產(chǎn)物內(nèi)部,,使得第二次PCR擴增片段短于*次擴增,。

實驗方法

  • 基本方案
實驗方法原理

由于巢式PCR反應(yīng)有兩次PCR擴增,,從而降低了擴增多個靶位點的可能性(因為與兩套引物都互補的引物很少)增加了檢測的敏感性;又有兩對PCR引物與檢測模板的配對,,增加了檢測的可靠性,。 由于第二套引物位于*輪PCR產(chǎn)物內(nèi)部,而非目的片斷包含兩套引物結(jié)合位點的可能性極小,,因此第二套引物不可能擴增非目的片斷,。這種巢式PCR擴增確保第二輪PCR產(chǎn)物幾乎或者*沒有引物配對特異性不強造成的非特異性擴增的污染。


巢式PCR反應(yīng)模式圖

實驗材料

基因樣品

試劑,、試劑盒

PCR緩沖液 Tris·HCl KCl Taq聚合酶

儀器,、耗材

PCR儀

實驗步驟

1.  目標(biāo)的DNA模板藍色的*對引物結(jié)合。*對引物也可能結(jié)合到其他具有相似結(jié)合位點的片段上并擴增多種產(chǎn)物,。但只有一種產(chǎn)物是目的片斷(圖中未顯示可能的多種產(chǎn)物),。


2.  使用圖中紅色標(biāo)記的第二套引物對*輪PCR擴增的產(chǎn)物進行第二輪PCR擴增。


*輪


1.  大?。?192 bp


2.  初始孵育:94℃4分鐘


3.  變性:94℃45秒


4.  退火:58攝氏度45秒


5.  聚合:72攝氏度45秒


6.  PCR循環(huán):36


第二輪


1.  大?。?71 bp


2.  初始溫育:95℃2分鐘


3.  變性:95℃45秒


4.  退火:60℃下45秒


5.  聚合:72攝氏度30秒


6.  PCR循環(huán):36

收起 
注意事項

1.  引物設(shè)計原則:每個特異性引物為24~26個堿基,Tm:64-65%,,GC:44-55% ,。這樣你可以同時做多個不同的TAIL PCR。


2.  在*輪PCR結(jié)束之后,,將PCR產(chǎn)物稀釋1 000倍(視情況而定)作為第二輪PCR的模板,,第二輪PCR的產(chǎn)物同樣稀釋1 000倍(視情況而定)作為第三輪PCR的模板,這樣依次類推,。實際操作中可以搞3輪甚至更多,,當(dāng)然做3輪是比較合適了,這個時候PCR的產(chǎn)物已經(jīng)是高度特異性了,。

展開 
其他

1.  圖解

 

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