如何利用LC-MS/MS進(jìn)行高通量肽組學(xué)分析？檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

肽組學(xué)（Peptidomics）是研究生物樣本中天然存在的內(nèi)源性肽段（通常小于10 kDa）的科學(xué)領(lǐng)域,。這些肽段廣泛參與神經(jīng)調(diào)節(jié),、免疫應(yīng)答、激素信號(hào),、代謝控制等生理活動(dòng),，具有重要的功能性和潛在標(biāo)志物價(jià)值。相比蛋白組學(xué),，肽組學(xué)更貼近dànbáizhì實(shí)際裂解,、加工和翻譯后修飾的狀態(tài)，能敏銳反映生物系統(tǒng)的動(dòng)態(tài)調(diào)控,。但由于肽段短,、豐度低、異構(gòu)多,，研究難度較高,。

為克服這些挑戰(zhàn)，液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜（LC-MS/MS）成為高通量肽組學(xué)分析中zuì關(guān)鍵的技術(shù)平臺(tái),。它不僅能jīngzhǔn識(shí)別肽段序列,，還可實(shí)現(xiàn)高通量、廣覆蓋,、多樣本并行的表達(dá)差異分析,。

一、LC-MS/MS在高通量肽組學(xué)分析中的角色定位

1,、什么是LC-MS/MS,？

（1）LC（Liquid Chromatography）：將復(fù)雜肽段混合物分離，按親水性/疏水性順序進(jìn)入質(zhì)譜,，提高識(shí)別率

（2）MS（Mass Spectrometry）：測(cè)定肽段的質(zhì)量（m/z）,，初步判斷其分子量

（3）MS/MS（Tandem MS）：將目標(biāo)肽段碎裂，再次檢測(cè)其碎片模式,，從而推斷氨基酸序列

在肽組學(xué)中，LC-MS/MS技術(shù)實(shí)現(xiàn)了從復(fù)雜生物樣本中分離,、識(shí)別,、定量?jī)?nèi)源肽段的全過程。

二,、高通量肽組學(xué)分析完整流程解析

1,、樣本收集與肽段富集

內(nèi)源性肽段廣泛存在于以下樣本中：

（1）血清 / 血漿

（2）尿液

（3）腦脊液

（4）組織勻漿

（5）細(xì)胞上清或裂解液

富集方法：

百泰派克采用多策略組合富集方案，提升短肽、多肽修飾種類的捕獲效率,。

2,、液相色譜分離（LC）

內(nèi)源性肽段種類繁多，保留行為復(fù)雜,，LC階段主要任務(wù)是在進(jìn)入質(zhì)譜前按理化性質(zhì)將肽段分離,，提高鑒定深度。

（1）使用納升流量nanoLC系統(tǒng)（如EASY-nLC 1200）提高靈敏度

（2）常用C18反相色譜柱,，緩沖體系為水-乙腈梯度洗脫

（3）分離時(shí)間通常為60–120分鐘,，以平衡通量與深度

3、串聯(lián)質(zhì)譜采集（MS/MS）

常見質(zhì)譜采集模式：

百泰派克支持DDA+DIA聯(lián)合采集,，結(jié)合肽組數(shù)據(jù)庫輔助識(shí)別,，提升肽段解析效率。

4,、數(shù)據(jù)處理與肽段識(shí)別

（1）數(shù)據(jù)庫搜索

* 使用如 PEAKS,、MaxQuant、Spectronaut 等工具進(jìn)行肽段匹配

• 可接入U(xiǎn)niProt,、Swiss-Prot,、RefSeq 等數(shù)據(jù)庫

• 支持定制搜索非典型起始肽、修飾肽,、剪接肽段

（2）定量分析

* Label-free,、iTRAQ、TMT 等定量方式可選擇

• 差異肽段篩選：fold change + P 值 + FDR（jiǎfā現(xiàn)率）控制

（3）功能注釋

* GO富集,、KEGG通路映射,、蛋白-肽段反向追蹤

• 可構(gòu)建“肽段-母體蛋白-功能通路”三級(jí)網(wǎng)絡(luò)

三、LC-MS/MS在高通量肽組學(xué)分析中的技術(shù)優(yōu)勢(shì)

四,、LC-MS/MS肽組學(xué)的科研應(yīng)用

神經(jīng)科學(xué)：分析神經(jīng)遞質(zhì)肽,、記憶調(diào)控肽段（如神經(jīng)肽Y）

腫瘤研究：識(shí)別腫瘤相關(guān)裂解肽段、新抗原或微環(huán)境信號(hào)肽

免疫學(xué)：結(jié)合HLA肽組學(xué),，解析免疫識(shí)別機(jī)制

代謝紊亂：發(fā)現(xiàn)內(nèi)分泌調(diào)節(jié)肽與代謝通路關(guān)聯(lián)

藥效學(xué)研究：監(jiān)測(cè)藥物干預(yù)前后肽段表達(dá)動(dòng)態(tài)變化

五,、百泰派克生物科技：高通量肽組學(xué)分析全流程服務(wù)

作為國(guó)內(nèi)lǐngxiān的多組學(xué)平臺(tái)服務(wù)商，百泰派克提供從樣本到結(jié)論的一站式LC-MS/MS肽組學(xué)研究服務(wù),，包括：

? 多樣本類型處理（組織,、液體、細(xì)胞等）

? 富集策略優(yōu)化與磁珠方案定制

? 高分辨LC-MS/MS平臺(tái)（Orbitrap Exploris,、Q Exactive等）

? DDA,、DIA、PRM等采集模式任選組合

? 多維度差異分析 + 通路富集 + 網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

? 支持與蛋白組,、代謝組,、轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析

肽組學(xué)為理解復(fù)雜生物過程提供了更高維的窗口,，而LC-MS/MS正是將這些肽段從混沌中分離、識(shí)別,、定量的“核心wǔqì”,。它讓我們能夠走近真實(shí)的蛋白加工過程、功能片段表達(dá)譜與病理調(diào)控機(jī)制,。百泰派克生物科技將繼續(xù)依托*的質(zhì)譜平臺(tái),、經(jīng)驗(yàn)豐富的生信團(tuán)隊(duì)和嚴(yán)謹(jǐn)?shù)姆?wù)體系，幫助科研人員zuì大限度釋放高通量肽組學(xué)分析的科學(xué)價(jià)值,。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一,、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù),，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析,，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析,，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù),。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù),，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析,。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉,，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二,、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC,，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué),、多肽組學(xué),、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作,。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析,，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織,、細(xì)胞,、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白,，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三,、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞,，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)*,，填補(bǔ)技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征,，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大,，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞,，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高,，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,，在臨床診斷,、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向,。除常規(guī)蛋白外,，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率,、細(xì)胞大小,、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等,。

四,、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案,。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別,。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量,。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,，深入挖掘未知的靶標(biāo),。

五,、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF,，高效色譜分離技術(shù),，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì,、多肽,、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析,，到產(chǎn)品變異性和純度分析,。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì),。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征,，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA,、ICH,、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,，建立了完備的質(zhì)量體系,，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查,，軟件審計(jì)追蹤,，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā),、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行,。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù),；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可,，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué),、多肽組學(xué),、代謝組學(xué)、生物藥物表征,、單細(xì)胞分析,、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等,；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái),，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè),，10000+客戶的選擇,；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

如何利用LC-MS/MS進(jìn)行高通量肽組學(xué)分析,？檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹