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常用CD光譜分析工具怎么選?BeStSe

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百泰派克生物科技-生物藥物表征,,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Biotech Pack Scientific Co., Ltd. 簡稱BTP)從事以生物質(zhì)譜為依托的生物藥物表征,,大分子物質(zhì)(包括蛋白質(zhì)、多肽,、代謝物)質(zhì)譜分析以及小分子物質(zhì)檢測服務(wù),。

l 公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,專業(yè)提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù),;

l 獲國家CNAS實驗室認可,,為客戶提供符合藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);

l 業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白質(zhì)組學(xué),、多肽組學(xué)、代謝組學(xué),、生物藥物表征,、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式,、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等,;

l 7大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務(wù)需求,;

l 服務(wù)3000+企業(yè),,10000+客戶的選擇;

l 致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!






業(yè)務(wù)范圍主要圍繞蛋白和小分子代謝物檢測兩大板塊,,從事蛋白質(zhì)和小分子代謝物的理化性質(zhì)分析及結(jié)構(gòu)解析等相關(guān)技術(shù)服務(wù),,為客戶提供高性價比、高效率的技術(shù)服務(wù),。

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常用CD光譜分析工具怎么選,?BeStSel與DichroWeb對比解析檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在結(jié)構(gòu)生物學(xué)和dànbáizhì研究中,圓二色性(Circular Dichroism, CD)光譜是一種重要的工具,,廣泛應(yīng)用于dànbáizhì二級結(jié)構(gòu)分析,、構(gòu)象變化監(jiān)測以及熱穩(wěn)定性評估。CD光譜提供了對dànbáizhì折疊狀態(tài)的快速,、非破壞性檢測手段,,但其數(shù)據(jù)解讀高度依賴于計算工具和算法的支持。當(dāng)前主流的CD數(shù)據(jù)分析平臺包括BeStSel和DichroWeb,,兩者均被廣泛采用,,卻在算法原理、分析精度和適用場景上各有千秋,。本文將圍繞“CD光譜分析工具怎么選”這一核心問題,,從功能,、算法精度、適配性等維度對BeStSel與DichroWeb進行深入解析,,為結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究人員提供實用參考,。


一、什么是CD光譜分析,?為什么離不開計算工具,?

CD光譜是由手性分子對圓偏振光吸收差異產(chǎn)生的譜圖,dànbáizhì的不同二級結(jié)構(gòu)(α-螺旋,、β-折疊,、無規(guī)卷曲)在190–260 nm波長區(qū)間具有特征信號。由于CD信號強度弱且各結(jié)構(gòu)的譜圖高度重疊,,單靠肉眼難以jīngquè判斷蛋白結(jié)構(gòu)組成比例,,這便凸顯了計算工具的重要性。

※ 理想的CD分析工具應(yīng)具備以下特征:


  • 高準(zhǔn)確性:可區(qū)分相似的結(jié)構(gòu)特征,,如平行與反平行β折疊,;

  • 高通量兼容性:支持批量分析與自動化處理;

  • 數(shù)據(jù)庫依賴度低:避免因參考數(shù)據(jù)庫偏差導(dǎo)致的誤判,;

  • 用戶友好性強:便于非結(jié)構(gòu)生物學(xué)背景的研究者操作,。


二、BeStSel:結(jié)構(gòu)解析的“β折疊專家”

※ 核心優(yōu)勢

BeStSel(Beta Structure Selection)專為高分辨β結(jié)構(gòu)判定而設(shè)計,,特別適用于富含β-結(jié)構(gòu)的dànbáizhì,。其算法不僅識別總β含量,還能進一步細分為平行與反平行構(gòu)型,,解決了傳統(tǒng)算法難以區(qū)分β類型的難題,。


  • dútè算法:基于廣泛的實驗參考光譜庫,結(jié)合支持向量機(SVM)回歸優(yōu)化,,提升分類準(zhǔn)確率,。

  • 結(jié)構(gòu)敏感性強:尤其在β-結(jié)構(gòu)占比高的蛋白中表現(xiàn)出色。

  • 支持跨物種數(shù)據(jù):算法不依賴單一數(shù)據(jù)庫,,適配多種生物樣本,。


※ 潛在局限

BeStSel對α-螺旋富集蛋白的適配性相對較弱,若研究對象為膜蛋白或天然無序蛋白,,建議搭配其他工具輔助分析,。


三、DichroWeb:通用型CD數(shù)據(jù)處理平臺

※ 核心優(yōu)勢

DichroWeb是一個成熟的CD光譜分析平臺,,提供多種算法選擇(如CONTIN,、CDSSTR、SELCON3等),,適合大多數(shù)水溶性蛋白的結(jié)構(gòu)評估,。其優(yōu)勢在于算法靈活性高,、參考數(shù)據(jù)庫豐富,尤其適合進行批量數(shù)據(jù)比對和交叉驗證,。


  • 多算法支持:可根據(jù)樣本特性選擇zuì適合的擬合模型,。

  • 操作界面友好:支持在線數(shù)據(jù)提交和圖形化輸出結(jié)果。

  • 數(shù)據(jù)庫quánwēi:集成多個經(jīng)驗證的數(shù)據(jù)集,,提高預(yù)測穩(wěn)定性,。


※ 潛在局限

DichroWeb對jíduān結(jié)構(gòu)或人工dànbáizhì的分析準(zhǔn)確性有所下降,且較依賴參考數(shù)據(jù)庫的代表性,。


四,、BeStSel vs.DichroWeb:怎么選?


常用CD光譜分析工具怎么選,?BeStSe


CD光譜作為蛋白結(jié)構(gòu)研究中的常規(guī)技術(shù),,其分析質(zhì)量高度依賴工具算法的選擇與使用策略。BeStSel和DichroWeb各具優(yōu)勢,,并非互斥,,而是應(yīng)被視為互補的分析組件。在未來的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究中,,合理整合多工具的能力將直接決定數(shù)據(jù)解釋的深度與準(zhǔn)確性。百泰派克生物科技構(gòu)建了完善的CD數(shù)據(jù)分析與結(jié)構(gòu)預(yù)測服務(wù)體系,,結(jié)合自主優(yōu)化的數(shù)據(jù)處理流程與多平臺工具互補機制,,確保客戶獲得更加jīngquè且可重復(fù)的蛋白結(jié)構(gòu)信息,。


百泰派克生物科技特色項目


一,、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù),。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),,對蛋白序列進行分析,。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.采用目前世界上先進的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,,即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉,,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。



二,、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,,提供定量dànbáizhì組學(xué),、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué),、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù),。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),,助力微量樣本蛋白組學(xué),、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,,適用于分析組織、細胞,、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,,實驗結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確,。



三、單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細胞表面和內(nèi)部的分子,,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質(zhì)量譜,,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量,。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.技術(shù)先進,填補技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),,避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題,。可在單細胞層面上對多種指標(biāo)同時進行表征,,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標(biāo)蛋白,。

2.分析數(shù)量大,成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制,,所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,,且成本不高于單細胞RNAseq,。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷,、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景,;

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,,質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾,;

③可檢測細胞存活率,、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量,、DNA合成速率以及蛋白酶活性等,。



四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的,、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案,。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進行免疫肽組學(xué)分析,,可從zuì小的樣品材料中進行可重復(fù)的識別和定量,。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥,、免疫疾病及傳染病的解決方案,,深入挖掘未知的靶標(biāo)。



五,、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),,MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),,提供一系列完善的生物藥物分析方案,,從dànbáizhì、多肽,、抗體,、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析,。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì),。



百泰派克生物科技七大檢測平臺

常用CD光譜分析工具怎么選,?BeStSe




百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù),。公司實驗室遵循NMPA,、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證,,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,,設(shè)備定期計量/期間核查,,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),,支持新藥研發(fā),、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行,。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù),;

2.獲國家CNAS實驗室認可,,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué),、多肽組學(xué),、代謝組學(xué)、生物藥物表征,、單細胞分析,、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等,;

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,,滿足您一站式服務(wù)需求;

5.服務(wù)3000+企業(yè),,10000+客戶的選擇,;

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!



常用CD光譜分析工具怎么選?BeStSel與DichroWeb對比解析檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹



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