如何使用Deconvolution算法分析CD譜圖檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

圓二色譜（Circular Dichroism, CD）是研究dànbáizhì二級結(jié)構(gòu)的重要手段,。然而，CD譜圖本質(zhì)上是多個結(jié)構(gòu)成分（如α-螺旋,、β-折疊,、無規(guī)卷曲）疊加后的結(jié)果，無法直接揭示各組分的比例,。此時,，Deconvolution（去卷積）算法成為了關(guān)鍵的解析工具。本文將系統(tǒng)介紹該算法在CD譜圖分析中的原理,、流程及注意事項,。

一、CD譜圖中的數(shù)據(jù)解讀挑戰(zhàn)

CD譜記錄的是手性分子對左右旋圓偏振光吸收差異的信號,，對于dànbáizhì結(jié)構(gòu)分析而言，其190–260 nm區(qū)域的光譜形狀反映了α-螺旋,、β-折疊等二級結(jié)構(gòu)的相對比例,。然而，由于這些結(jié)構(gòu)單元在光譜上的信號存在顯著重疊,，直接從原始譜圖中判讀結(jié)構(gòu)信息幾乎不可能,。因此，研究人員需借助數(shù)學(xué)建模方法——特別是Deconvolution算法——將復(fù)合光譜拆解為各個二級結(jié)構(gòu)的獨(dú)立貢獻(xiàn),，獲得更定量,、更客觀的結(jié)構(gòu)比例估計。

二,、什么是Deconvolution算法,？

Deconvolution在CD分析中是一種反卷積建模方法，其基本思想是將樣本CD光譜表示為已知參考光譜的加權(quán)線性組合,。這些參考光譜來自一組結(jié)構(gòu)已知的標(biāo)準(zhǔn)dànbáizhì數(shù)據(jù)庫,。

※ 算法的數(shù)學(xué)本質(zhì)可表達(dá)為以下形式：

樣本CD信號 = 各種參考結(jié)構(gòu)的標(biāo)準(zhǔn)譜圖 × 對應(yīng)比例系數(shù) + 殘差項

更具體地說：

S(λ) ≈ c?·R?(λ) + c?·R?(λ) + ... + c?·R?(λ) + ε(λ)

其中：

• S(λ) 表示樣本在波長 λ 處的CD譜信號

• R?(λ), R?(λ), ..., R?(λ) 是已知參考譜圖（不同結(jié)構(gòu)單元）

• c?, c?, ..., c? 是各結(jié)構(gòu)的比例系數(shù)（需要解出）

• ε(λ) 是擬合殘差

通過zuì小化殘差，即可估算dànbáizhì中不同結(jié)構(gòu)元素的比例,。

三,、主流的Deconvolution算法類型

不同的算法使用不同的數(shù)學(xué)策略和參考數(shù)據(jù)庫，常見類型包括：

1,、Singular Value Decomposition (SVD)

通過奇異值分解提取主要成分譜圖,，降噪效果良好，但對數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)依賴性較強(qiáng),。

2,、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)法

利用深度學(xué)習(xí)模型擬合譜圖與結(jié)構(gòu)比例的復(fù)雜關(guān)系,，適合大規(guī)模樣本分析。

3,、zuì小二乘擬合法（Least Squares Fitting）

通過zuì小化觀測譜圖與擬合譜圖的差異來確定結(jié)構(gòu)比例,，簡潔、直觀,，是應(yīng)用zuì廣的算法之一,。

4、zuì大熵法或貝葉斯模型

引入先驗知識,，適合處理低信噪比數(shù)據(jù),，有助于提升結(jié)構(gòu)估計的穩(wěn)健性。

四,、標(biāo)準(zhǔn)分析流程

為了保證結(jié)果的準(zhǔn)確性和可重復(fù)性,，建議遵循如下流程：

Step 1：數(shù)據(jù)準(zhǔn)備與預(yù)處理

• 建議選取190–250 nm波段

• 去除緩沖液背景，進(jìn)行噪聲平滑（如Savitzky-Golay濾波）

• 將信號單位標(biāo)準(zhǔn)化為摩爾橢圓率（[θ]）

Step 2：選擇合適的參考數(shù)據(jù)庫

參考譜圖應(yīng)涵蓋α-螺旋,、β-折疊,、無規(guī)卷曲等典型結(jié)構(gòu)，且數(shù)據(jù)庫蛋白種類應(yīng)具有代表性,。

Step 3：算法擬合

輸入標(biāo)準(zhǔn)庫與目標(biāo)CD譜圖,，運(yùn)行所選Deconvolution算法，擬合出結(jié)構(gòu)比例,，并輸出擬合優(yōu)度指標(biāo),。

Step 4：結(jié)果解讀與驗證

必要時結(jié)合質(zhì)譜、DSC,、NMR等手段進(jìn)行多維驗證,，判斷Deconvolution結(jié)果是否可信。

五,、使用時的關(guān)鍵注意事項

• 輸入譜圖質(zhì)量決定上限：建議使用高靈敏度儀器獲取高S/N比數(shù)據(jù)

• 參考庫匹配性非常關(guān)鍵：數(shù)據(jù)庫中蛋白與目標(biāo)樣本的結(jié)構(gòu)相似性會顯著影響擬合準(zhǔn)確度

• 防止過擬合：使用參考結(jié)構(gòu)數(shù)目應(yīng)適度,，避免非生物學(xué)意義的擬合結(jié)果

Deconvolution算法是解讀CD譜圖中隱藏結(jié)構(gòu)信息的關(guān)鍵工具。它將原本疊加的信號分離,、量化,，助力研究者深入理解dànbáizhì的構(gòu)象特征和穩(wěn)定性。通過科學(xué)的算法選型與參考數(shù)據(jù)庫選擇,，研究者可以從“曲線”中讀懂結(jié)構(gòu),。如果您正在開展蛋白結(jié)構(gòu)研究，歡迎咨詢百泰派克生物科技,。我們將以zhuānyè的儀器平臺與算法能力,，為您提供可靠的CD結(jié)構(gòu)解析支持。

百泰派克生物科技特色項目

一,、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進(jìn)行分析,，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù,，Cduāncèxù和全序列分析,，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì,，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),，對蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液,、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響,。

二,、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué),、靶向dànbáizhì組學(xué),、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù),。此外,，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué),、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,，適用于分析組織、細(xì)胞,、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,，實驗結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確,。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,，然后用流式細(xì)胞原理分離單個細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達(dá)量,。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題,?？稍趩渭?xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標(biāo)蛋白,。

2.分析數(shù)量大,，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞,，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq,。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景,；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向,。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾,；

③可檢測細(xì)胞存活率,、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量,、DNA合成速率以及蛋白酶活性等,。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的,、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案,。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析,，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識別和定量,。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥,、免疫疾病及傳染病的解決方案,，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五,、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù),，提供一系列完善的生物藥物分析方案,，從dànbáizhì、多肽,、抗體,、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析,。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì),。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù),。公司實驗室遵循NMPA,、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,，設(shè)備定期計量/期間核查,，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),，支持新藥研發(fā),、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù),；

2.獲國家CNAS實驗室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù),；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué),、多肽組學(xué)、代謝組學(xué),、生物藥物表征,、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式,、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等,；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務(wù)需求,；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇,；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

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