一個基因表達的終結(jié)果是產(chǎn)生相應(yīng)的蛋白質(zhì)（或酶）。因此檢測蛋白質(zhì)是測定基因表達的主要標志,，檢測蛋白質(zhì)的方法很多,，除ELISA法外，也可用與檢測DNA和RNA相類似的吸印方法,。前兩法有“南”和“北”之意,，故本法遂被延伸稱為Western（西）印跡法，該法能用SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳分辨出與專一抗血清結(jié)合的專一性蛋白質(zhì),。將聚丙烯酰胺凝膠上分辨出的蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上并與一體共孵,。一抗專一地與待分離蛋自質(zhì)的抗原決定簇結(jié)合，然后用另一種蛋自質(zhì),，如135I-蛋白A或辣根過氧化物酶連接的山羊抗IgG檢測已結(jié)合上去的抗體,。本法所需時間6小時或過夜。 蛋白質(zhì)的聚丙烯酰胺凝膠電泳 幾乎所有蛋白質(zhì)電泳分析都在聚丙烯酰胺凝膠上進行,，而所用條件總要確保蛋白質(zhì)解離成單個多肽亞基并盡可能減少其相互間的聚集,。常用的方法是將強陰離子去污劑SDS與某一還原劑并用,，并通過加熱使蛋白質(zhì)解離后再加樣于電泳凝膠上。變性的多肽與SDS結(jié)合并因此而帶負電荷,，由于多肽結(jié)合SDS的量幾乎總是與多肽的分子量成正比而與其序列無關(guān),，因此SDS多肽復(fù)合物在聚丙烯酰凝膠電泳中的遷移只與多肽的大小相關(guān)。在達到飽和的狀態(tài)下,，每克多肽約可結(jié)合1.4克去污劑,，借助已知分子量的標準參照物，則可測算出多肽鏈的分子量,。 SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳大多在不連續(xù)緩沖系統(tǒng)中進行,，其電泳槽緩沖液的pH值與離子強度不同于配膠緩沖液，當兩電極間接通電流后,，凝膠中形成移動界面,，并帶動加入凝膠的樣品中所含的SDS多肽復(fù)合物向前推進。樣品通過高度多孔性的積層膠后,，復(fù)合物在分離膠表面聚集成一條很薄的區(qū)帶（或稱積層）,。曲于不連續(xù)緩沖系統(tǒng)具有把樣品中的復(fù)合物全部濃縮于極小體積的能力，故大大提高了SDS聚丙烯酰胺凝膠的分辨率,。 廣泛使用的不連續(xù)緩沖系統(tǒng)早是由Ornsstein（1964）和Davis（1964）設(shè)計的,，樣品和積層膠中含Tris-Cl（pH6.8），上下槽緩沖液含Tris-甘氨酸（pH8.3）,，分離膠中含Tris-Cl（pH8.8）的,。系統(tǒng)中所有組分都含有0.1％的SDS（Laemmli, 1970），樣品和積層膠中的氯離干形成移動界面的先導(dǎo)邊界而甘氨酸分子則組成尾隨邊界,，在移動界面的兩邊界之間是一電導(dǎo)較低而電位滴度較陡的區(qū)域,，它推動樣品中的多肽前移并在分離膠前沿積聚，此處pH值較高,，有利于甘氨酸的離子化,，所形成的甘氨酸離子穿過堆集的多肽并緊隨氯離子之后，沿分離膠泳動,。從移動界面中解脫后,，SDS多肽復(fù)合物成一電位和pH值均勻的區(qū)帶泳動穿過分離膠，并被篩分而依各自的大小得到分離,。