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蛋白質(zhì)翻譯后修飾的常見研究策略

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dànbáizhì翻譯后修飾的常見研究策略檢測技術(shù)服務(wù): 在真核細(xì)胞中,dànbáizhì的結(jié)構(gòu)和功能不僅由其氨基酸序列決定,更受到翻譯后修飾(Post-Translational Modifications, PTMs)的深遠(yuǎn)影響。PTMs 是指dànbáizhì在翻譯完成后通過酶促作用被化學(xué)修飾的過程,這一機制參與了細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、基因表達(dá)調(diào)控、細(xì)胞周期,、免疫應(yīng)答等多種生物學(xué)過程。鑒于其在生理和

蛋白質(zhì)翻譯后修飾的常見研究策略檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在真核細(xì)胞中,,dànbáizhì的結(jié)構(gòu)和功能不僅由其氨基酸序列決定,,更受到翻譯后修飾(Post-Translational Modifications, PTMs)的深遠(yuǎn)影響。PTMs 是指dànbáizhì在翻譯完成后通過酶促作用被化學(xué)修飾的過程,,這一機制參與了細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo),、基因表達(dá)調(diào)控、細(xì)胞周期,、免疫應(yīng)答等多種生物學(xué)過程,。鑒于其在生理和病理狀態(tài)中的核心作用,dànbáizhì翻譯后修飾研究已成為蛋白組學(xué)中的關(guān)鍵領(lǐng)域,。


一,、常見的dànbáizhì翻譯后修飾類型

dànbáizhì可以經(jīng)歷數(shù)百種不同的翻譯后修飾,其中zuì為常見且研究zuì深入的包括:

1,、磷酸化(Phosphorylation)

磷酸化是zuì常見的PTM形式之一,,通常發(fā)生在sīānsuān(Ser)、sūānsuān(Thr)和làoānsuān(Tyr)殘基上,。它在信號傳導(dǎo)通路中發(fā)揮核心作用,,調(diào)控酶活性、dànbáizhì穩(wěn)定性和蛋白互作,。


2,、乙?;ˋcetylation)

乙酰化廣泛存在于組蛋白和非組蛋白中,,對染色質(zhì)結(jié)構(gòu),、基因表達(dá)調(diào)控具有重要意義,。賴氨酸殘基的乙?;梢愿淖僤ànbáizhì的正電荷,,從而影響其結(jié)構(gòu)和功能,。


3,、泛素化(Ubiquitination)

泛素化是通過將小分子dànbáizhì“泛素"連接到目標(biāo)dànbáizhì的賴氨酸殘基上,實現(xiàn)對其降解,、定位或功能調(diào)節(jié),。多泛素鏈的構(gòu)型還可決定不同的細(xì)胞命運。


4,、糖基化(Glycosylation)

糖基化是將糖類基團共價附著到dànbáizhì上,,常見于細(xì)胞膜蛋白和分泌蛋白。其不僅影響dànbáizhì折疊,、穩(wěn)定性和半衰期,,也與癌癥、感染等疾病密切相關(guān),。


5,、甲基化(Methylation)

甲基化可發(fā)生在賴氨酸或jīngānsuān殘基上,常見于組蛋白中,,調(diào)控染色質(zhì)狀態(tài)與基因沉默,。同時也存在于代謝酶、轉(zhuǎn)錄因子等非組蛋白中,。


二,、dànbáizhì翻譯后修飾的研究策略

由于PTMs通常發(fā)生在低豐度、特異性位置且動態(tài)變化明顯,,因此對其研究需要高度靈敏和特異的技術(shù)支持,。以下為目前主流的研究策略。

1,、親和富集策略:提高修飾肽的檢測效率

翻譯后修飾的一個挑戰(zhàn)在于其豐度低,、修飾位點復(fù)雜,直接質(zhì)譜檢測往往難以識別,。為此,,親和富集技術(shù)是研究PTMs的前提步驟。


  • 抗體富集:針對特定修飾(如磷酸化,、乙?;╅_發(fā)的單克隆或多克隆抗體可以高效識別目標(biāo)肽段,,例如使用anti-phospho-Ser/Thr/Tyr抗體進(jìn)行磷酸肽富集。

  • 金屬氧化物親和層析(MOAC)與IMAC:這兩種方法常用于磷酸肽的非抗體依賴型富集,,TiO?和Fe3?離子可與磷酸基團強烈結(jié)合,,提高磷酸肽的回收率。

  • Lectin富集:適用于糖基化研究,,不同凝集素可識別不同類型的糖殘基結(jié)構(gòu),,如ConA、WGA等,。


親和富集后的樣品可顯著提高質(zhì)譜分析中目標(biāo)修飾肽的比例,,增強檢測靈敏度和數(shù)據(jù)質(zhì)量。


2,、高分辨質(zhì)譜分析:定性與定量的核心工具

質(zhì)譜(MS)是研究PTMszuì強大的工具之一,,尤其是Orbitrap、TOF等高分辨平臺,。


  • 數(shù)據(jù)依賴采集(DDA):通過對高強度離子優(yōu)先碎裂,,獲取修飾肽段序列信息,適用于修飾位點鑒定,。

  • 數(shù)據(jù)獨立采集(DIA):全面,、重復(fù)性強,適合多樣本間修飾定量比較,,常與Spectronaut,、DIA-NN等軟件配合分析。

  • 平行反應(yīng)監(jiān)測(PRM)與選擇反應(yīng)監(jiān)測(SRM):用于特定修飾肽的靶向定量分析,,靈敏度高,、定量jīngquè。


通過MS/MS譜圖解讀,,可以確定修飾類型,、修飾位點位置及其變化趨勢。


3,、定量策略:揭示PTMs的動態(tài)調(diào)控機制

在比較不同處理條件(如刺激前后,、突變體與野生型)下PTMs變化時,定量策略尤為關(guān)鍵,。


  • TMT/iTRAQ標(biāo)記:適用于多樣本并行定量分析,,配合高通量MS平臺可實現(xiàn)數(shù)十個樣本中修飾變化的系統(tǒng)分析。

  • Label-free定量:對樣本處理簡便,,不受標(biāo)簽限制,,適合大規(guī)模探索性研究,但對質(zhì)譜平臺穩(wěn)定性要求高。

  • SILAC:通過代謝標(biāo)記將重同位素氨基酸摻入細(xì)胞中,,適合細(xì)胞系的jīngzhǔn定量研究,,尤其在泛素化等動態(tài)變化中表現(xiàn)優(yōu)異。


4,、生物信息學(xué)分析:從“點"到“網(wǎng)"的整合解讀

PTMs的研究不僅止于位點的鑒定,,更需要系統(tǒng)地理解其在生物通路和功能模塊中的作用。


  • 位點注釋:如使用PhosphoSitePlus,、UniProt數(shù)據(jù)庫,,識別已知與新發(fā)現(xiàn)的修飾位點。

  • 富集分析:GO與KEGG通路富集幫助揭示修飾蛋白的功能傾向與生物學(xué)意義,。

  • 互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建:結(jié)合STRING,、Cytoscape等工具構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò),挖掘核心調(diào)控節(jié)點,。

  • 修飾互作分析(Crosstalk):多個修飾類型之間可能存在協(xié)同或拮抗作用,,如磷酸化-乙?;罢{(diào)控開關(guān)"的關(guān)系,,是PTMs研究的前沿方向。


dànbáizhì翻譯后修飾是解析生命活動精細(xì)調(diào)控的“密碼層",,其研究對于疾病機制揭示,、藥物靶點發(fā)現(xiàn)及生物標(biāo)志物開發(fā)具有bùkětìdài的重要意義。通過整合樣本前處理,、富集技術(shù),、質(zhì)譜分析與生物信息學(xué)解讀,科研人員正不斷拓展dànbáizhì翻譯后修飾的研究,。百泰派克生物科技依托深厚的蛋白組學(xué)技術(shù)積累和gāoduān質(zhì)譜平臺,,持續(xù)為生命科學(xué)研究提供高質(zhì)量的翻譯后修飾蛋白組分析服務(wù),助力更多科研項目走得更深,、更遠(yuǎn),。


百泰派克生物科技特色項目


一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進(jìn)行分析,,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,,Cduāncèxù和全序列分析,,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì,,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),,對蛋白序列進(jìn)行分析。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.采用目前世界上先進(jìn)的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,,即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉,,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。



二,、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué),、多肽組學(xué),、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),,助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作,。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,適用于分析組織,、細(xì)胞,、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實驗結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白,,線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。



三,、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細(xì)胞原理分離單個細(xì)胞,,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達(dá)量。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.技術(shù)先進(jìn),,填補技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),,避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭?xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時進(jìn)行表征,,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大,,成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,,所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細(xì)胞,,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,,且成本不高于單細(xì)胞RNAseq,。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,在臨床診斷,、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景,;

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,,質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾,;

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小,、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量,、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。



四,、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的,、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別,。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析,,可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,,旨在助力科研工作者尋找癌癥,、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標(biāo),。



五,、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),,MALDI TOF,,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,,從dànbáizhì,、多肽、抗體,、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),,幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì),。



百泰派克生物科技七大檢測平臺

蛋白質(zhì)翻譯后修飾的常見研究策略




百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù),。公司實驗室遵循NMPA,、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計量/期間核查,,軟件審計追蹤,,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā),、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行,。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù),;

2.獲國家CNAS實驗室認(rèn)可,,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué),、多肽組學(xué),、代謝組學(xué)、生物藥物表征,、單細(xì)胞分析,、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等,;

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,,滿足您一站式服務(wù)需求;

5.服務(wù)3000+企業(yè),,10000+客戶的選擇,;

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!



蛋白質(zhì)翻譯后修飾的常見研究策略檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

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