GPF-DIA和Direct DIA：哪個(gè)更適合大規(guī)模蛋白定量,？檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在大規(guī)模dànbáizhì組學(xué)研究中,，數(shù)據(jù)獨(dú)立采集（DIA, Data-Independent Acquisition）技術(shù)因其高通量、高重現(xiàn)性和數(shù)據(jù)完整性,，已成為主流,。然而，DIA的發(fā)展也催生了多種策略,，其中以GPF-DIA（Gas Phase Fractionation DIA）與Direct DIA（直接DIA）zuì為常見,。兩者在譜圖庫構(gòu)建方式、實(shí)驗(yàn)流程與適用場(chǎng)景上存在顯著差異,。本文將系統(tǒng)比較這兩種DIA策略,，幫助科研人員在不同研究需求下作出科學(xué)選擇。

一,、什么是GPF-DIA,？

GPF-DIA是一種通過氣相分級(jí)提升譜圖庫質(zhì)量的DIA策略。研究人員將混合樣本在質(zhì)譜m/z維度進(jìn)行分段采集（如每次覆蓋一個(gè)100–150 m/z的窗口）,，從而獲得更高的MS/MS覆蓋度,。隨后，以這些高覆蓋度數(shù)據(jù)構(gòu)建實(shí)驗(yàn)樣本特異性的DIA譜圖庫,，用于后續(xù)大批量樣本的定量分析,。

? GPF-DIA的特點(diǎn)：

• 蛋白鑒定更深：適合發(fā)掘低豐度、差異性蛋白

• 譜圖庫質(zhì)量更高：針對(duì)目標(biāo)樣本構(gòu)建,，具有高度代表性

• 定量準(zhǔn)確性更優(yōu)：尤其適合機(jī)制研究與生物標(biāo)志物挖掘

• 實(shí)驗(yàn)成本較高：需額外運(yùn)行多個(gè)氣相分級(jí)樣本,，增加儀器時(shí)間與樣本消耗

二,、什么是Direct DIA？

Direct DIA則wánquán跳過譜圖庫構(gòu)建步驟,，直接利用軟件算法（如DIA-NN,、Spectronaut）從原始DIA數(shù)據(jù)中進(jìn)行蛋白鑒定與定量。這種“譜庫自由"方式顯著簡(jiǎn)化了實(shí)驗(yàn)流程,，并具備良好的通量擴(kuò)展性,。

? Direct DIA的特點(diǎn)：

• 流程更簡(jiǎn)潔：無需分級(jí)與譜圖庫采集

• 更適合高通量項(xiàng)目：如臨床隊(duì)列研究、藥物篩選等

• 對(duì)樣本量要求低：適合樣本寶貴或難以批量制備的項(xiàng)目

• 鑒定深度略遜：對(duì)極低豐度蛋白的識(shí)別能力有限

三,、GPF-DIA vs Direct DIA：核心指標(biāo)對(duì)比

四,、如何選擇更適合的DIA策略？

選擇DIA策略的核心在于研究目標(biāo)與資源配置：

• 如果您關(guān)注的是蛋白鑒定深度與定量精度,，如疾病機(jī)制解析,、功能蛋白篩選或圖譜構(gòu)建，GPF-DIA更具優(yōu)勢(shì),。

• 若研究更強(qiáng)調(diào)樣本通量,、數(shù)據(jù)處理效率與自動(dòng)化能力，如大型臨床樣本隊(duì)列,、藥效評(píng)估或多時(shí)間點(diǎn)干預(yù)實(shí)驗(yàn),，Direct DIA是更高效的選擇。

科學(xué)地根據(jù)項(xiàng)目需求選用DIA策略,，不僅提升數(shù)據(jù)質(zhì)量,，也能顯著優(yōu)化成本效益比。百泰派克生物科技提供多樣化DIA策略支持,，滿足從基礎(chǔ)科研到臨床轉(zhuǎn)化的廣泛需求,。不論您的研究聚焦于生物機(jī)制探索，還是臨床應(yīng)用開發(fā),，我們都可為您提供定制化蛋白組學(xué)解決方案,。了解更多DIA策略選擇建議或獲取典型項(xiàng)目案例，歡迎聯(lián)系我們,！

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一,、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù),，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析,，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析,，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù),。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析,。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上先進(jìn)的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液,、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉,，PEC和和糖基化等N端修飾的影響,。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC,，提供定量dànbáizhì組學(xué),、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué),、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù),。此外,，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作,。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析,，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織,、細(xì)胞,、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白,，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三,、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞,，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)先進(jìn),，填補(bǔ)技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征,，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大,，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高,，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq,。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷,、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景,；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾,；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小,、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量,、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四,、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的,、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別,。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析,，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,，旨在助力科研工作者尋找癌癥,、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo),。

五,、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF,，高效色譜分離技術(shù),，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì,、多肽,、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析,，到產(chǎn)品變異性和純度分析,。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì),。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征,，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA,、ICH,、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系,，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤,，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行,。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可,，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù),；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué),、代謝組學(xué),、生物藥物表征、單細(xì)胞分析,、單細(xì)胞質(zhì)譜流式,、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái),，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè),，10000+客戶的選擇,；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

GPF-DIA和Direct DIA：哪個(gè)更適合大規(guī)模蛋白定量？檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹