SWATH蛋白組學(xué)在農(nóng)業(yè)研究中的應(yīng)用與突破檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué)中,，jīngzhǔn解析生物體內(nèi)的分子機(jī)制已成為推動(dòng)作物改良、病害防控和農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展的關(guān)鍵路徑,。其中,，SWATH（Sequential Window Acquisition of All Theoretical Mass Spectra）蛋白組學(xué)作為基于數(shù)據(jù)獨(dú)立采集（DIA）模式的質(zhì)譜技術(shù)，正在農(nóng)業(yè)研究中展現(xiàn)出qiánsuǒwèiyǒu的潛力,。

一,、SWATH蛋白組學(xué)的技術(shù)優(yōu)勢(shì)

DDA（數(shù)據(jù)依賴采集）模式因掃描深度和重現(xiàn)性受限，常導(dǎo)致低豐度蛋白難以捕獲,，尤其在復(fù)雜生物樣本中更為明顯,。相比之下，SWATH作為DIA模式的代表,，通過(guò)預(yù)設(shè)質(zhì)量窗口進(jìn)行全面掃描,，可在單次運(yùn)行中實(shí)現(xiàn)上萬(wàn)條肽段的高覆蓋、可重現(xiàn),、高通量定量,。這一特性，使得SWATH蛋白組學(xué)非常適合農(nóng)業(yè)研究中多樣本,、復(fù)雜背景,、對(duì)比分析強(qiáng)烈依賴的數(shù)據(jù)場(chǎng)景，如不同品種,、逆境處理,、發(fā)育階段等變量之間的系統(tǒng)研究,。

應(yīng)用一：加速作物性狀改良的分子解析

作物性狀如抗旱,、耐鹽、抗病,、高產(chǎn)等,，往往是多個(gè)基因與信號(hào)通路協(xié)同調(diào)控的結(jié)果。SWATH蛋白組學(xué)能對(duì)不同條件下的蛋白表達(dá)譜進(jìn)行全面定量,，識(shí)別與目標(biāo)性狀密切相關(guān)的dànbáizhì調(diào)控網(wǎng)絡(luò),。這不僅加快了候選基因的挖掘進(jìn)程,，也為后續(xù)的基因編輯或分子育種提供了可靠靶點(diǎn)。此外,，SWATH還可結(jié)合轉(zhuǎn)錄組,、代謝組等多組學(xué)平臺(tái)，實(shí)現(xiàn)從“基因-蛋白-代謝物"層面的多維整合,，為解析復(fù)雜農(nóng)業(yè)性狀的系統(tǒng)生物學(xué)機(jī)制提供數(shù)據(jù)支撐,。

應(yīng)用二：深入理解植物-病原互作機(jī)制

農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中病害問(wèn)題始終是限制作物產(chǎn)量和質(zhì)量的重要因素。通過(guò)SWATH蛋白組學(xué)技術(shù),，研究者可系統(tǒng)分析植物在病原脅迫下的動(dòng)態(tài)dànbáizhì組響應(yīng),，包括信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、免疫反應(yīng),、細(xì)胞壁重構(gòu)等關(guān)鍵過(guò)程,。SWATH可揭示全局蛋白表達(dá)趨勢(shì)及其與病原抗性相關(guān)的調(diào)控模塊，從而輔助開(kāi)發(fā)更具廣譜抗性的作物品種,，為綠色農(nóng)業(yè)提供新的解決方案,。

應(yīng)用三：支持農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì)形成機(jī)制研究

農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì)如營(yíng)養(yǎng)成分、風(fēng)味,、儲(chǔ)藏特性等,，越來(lái)越受到消費(fèi)者和市場(chǎng)的重視。SWATH蛋白組學(xué)可用于系統(tǒng)研究不同栽培管理或加工條件對(duì)dànbáizhì表達(dá)的影響,，進(jìn)而解析調(diào)控品質(zhì)形成的核心生物通路,。例如，SWATH可用于挖掘果實(shí)成熟過(guò)程中與風(fēng)味物質(zhì)合成,、細(xì)胞壁降解相關(guān)的蛋白組變化,，助力優(yōu)化采收時(shí)機(jī)與后處理方案，從而提升終端產(chǎn)品的感官與營(yíng)養(yǎng)價(jià)值,。

應(yīng)用四：揭示逆境脅迫下的蛋白調(diào)控網(wǎng)絡(luò)

面對(duì)氣候變化帶來(lái)的非生物脅迫（如干旱,、高溫、鹽堿等）,，如何提高作物對(duì)環(huán)境脅迫的適應(yīng)能力,，成為農(nóng)業(yè)研究的重要方向。SWATH蛋白組學(xué)能在不同脅迫處理下捕捉蛋白表達(dá)的微小變化,，構(gòu)建應(yīng)答通路圖譜,，識(shí)別脅迫感應(yīng)與耐受機(jī)制中的關(guān)鍵調(diào)控因子。該技術(shù)特別適用于對(duì)比研究如耐鹽與非耐鹽品種在同一鹽脅迫條件下的蛋白組響應(yīng)差異,，從而為抗逆品種的jīngzhǔn選育提供科學(xué)依據(jù),。

二、技術(shù)突破：從數(shù)據(jù)分析到標(biāo)準(zhǔn)化流程

雖然SWATH蛋白組學(xué)在農(nóng)業(yè)研究中的前景廣闊，但其在實(shí)際應(yīng)用中也面臨數(shù)據(jù)解析復(fù)雜,、譜庫(kù)構(gòu)建難度高等技術(shù)挑戰(zhàn),。近年來(lái)，隨著人工智能算法,、自動(dòng)化數(shù)據(jù)處理平臺(tái)的加入,，SWATH數(shù)據(jù)的可解釋性和通量已顯著提升。

SWATH蛋白組學(xué)作為下一代dànbáizhì定量技術(shù),，正逐步改變農(nóng)業(yè)研究的范式,。從揭示性狀形成機(jī)制到提升農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì)，從應(yīng)對(duì)環(huán)境脅迫到推動(dòng)智能育種,，其在農(nóng)業(yè)科學(xué)中的應(yīng)用正不斷拓展,。隨著技術(shù)平臺(tái)的成熟與服務(wù)體系的完善，未來(lái)SWATH蛋白組學(xué)將在農(nóng)業(yè)生物學(xué)領(lǐng)域發(fā)揮更大價(jià)值,。百泰派克生物科技也將持續(xù)以zhuānyè的蛋白組學(xué)能力,，提供SWATH定量蛋白組學(xué)服務(wù)，為農(nóng)業(yè)科研提供強(qiáng)有力的數(shù)據(jù)支持與技術(shù)保障,。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一,、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù),，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析,，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析,，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù),。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù),，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析,。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉,，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二,、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC,，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué),、多肽組學(xué),、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作,。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析,，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織,、細(xì)胞,、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白,，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三,、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞,，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)優(yōu)良,，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征,，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大,，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞,，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高,，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,，在臨床診斷,、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向,。除常規(guī)蛋白外,，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率,、細(xì)胞大小,、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等,。

四,、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別,。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析,，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,，旨在助力科研工作者尋找癌癥,、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo),。

五,、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF,，高效色譜分離技術(shù),，提供一系列完善的生物藥物分析方案,，從dànbáizhì,、多肽,、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析,，到產(chǎn)品變異性和純度分析,。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì),。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征,，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA,、ICH,、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,，建立了完備的質(zhì)量體系,，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查,，軟件審計(jì)追蹤,，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā),、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行,。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù),；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可,，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué),、多肽組學(xué),、代謝組學(xué),、生物藥物表征、單細(xì)胞分析,、單細(xì)胞質(zhì)譜流式,、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái),，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè),，10000+客戶的選擇,；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

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