詳細介紹
DNA Shuffling試劑盒產(chǎn)品及特點 DNA Shuffling 即 DNA 分子的體外同源重組,,它是一種分子水平上的定向進化(directed evolution)技術(shù),它以一個或多個基因為起始材料,,通過先隨機
斷裂成小片段,,再進行互為模板和引物的 PCR(無外加引物),zui后再進行常規(guī)
PCR(外加引物)等處理,,zui后得到含有大量 DNA 重組突變的 PCR 產(chǎn)物,。
DNA Shuffling試劑盒其原理示意圖如下:
就是根據(jù)上述原理優(yōu)化改進而成,它具有下列特點:
1. 即開即用,,用戶只需要提供樣品 DNA 模板,,無需單獨準備各成分。
2. 操作手冊經(jīng)過優(yōu)化,,1-2 天即可完成,,節(jié)省大量優(yōu)化時間。
3. 本產(chǎn)品只適用于科研,,不能用于臨床診斷,。 規(guī)格及成分 成分 編號 十孔盒包裝
PCR Mix 3.0(含染料) 90805A 1 mL×3
DNase I 溶液(1U/μL) 90903A 10 μL
溶液 A,10× 131178A 100 μL
溶液 B,,10× 131178B 100 μL
超純水 100935 1 mL
使用手冊 131178sc 1 份
運輸及保存 低溫運輸,,-20℃保存,,保存期限一年。 自備試劑 待突變基因片段,、DNA Shuffling 引物(第二輪 PCR 引物),、膠回收試劑盒。
使用方法 1. 待突變基因片段的制備:待突變基因片段可以用含一個或多個同源基因的質(zhì)
粒為模板,、用 PCR 法或酶切法制備,。制備時需保證含同源基因(或此同源
基因的一部分)的 DNA 段總長度不要超過 1kb,同時比 DNA shuffling
終產(chǎn)物(第二輪 PCR 產(chǎn)物)長 200-400 bp,。每次 DNA Shuffling 實驗至
少需要 2 μg 起始 DNA 段(如果含幾個同源基因片段,,則彼此的比例為
1:1:1),zui多可以達 5 μg 起始 DNA 段,,并且必須通過膠回收的方法回
收,,以便*去除殘留的質(zhì)粒模板、引物和非特異擴增產(chǎn)物等,。zui后需用分
光光度法準確定量,。如果不去除此步的引物,其將對后續(xù) PCR 造成嚴重干
擾,。
2. 提前準備 37℃和 75℃水浴,,同時新鮮配制 0.1U/μL 的 DNase 工作液放
冰上待用(必須在用時才配制,方法是將 1 μL 本試劑盒提供的 1U/uL 的
DNase I 溶液和 1 μL 溶液 A 和 8 μL 超純水混合),。此溶液需在 24 小時
內(nèi)使用,。
3. 在一個離心管中,按順序加入下列成分:
成分 用量
待突變同源基因片段(第 1 步制備所得) 2-5 μg
溶液 A 5 μL
溶液 B 5 μL
DNase I 工作液(第 2 步制備所得) 2 μL
補超純水到 50 μL
4. 充分輕柔吹打混勻后 37℃水浴 8 分鐘,,然后立即放 75℃水浴處理 10 分鐘
以滅活 DNase I,。
5. 在 2-3%瓊脂糖凝膠上電泳,用常規(guī)的膠回收法回收 25-150 bp 范圍的所
有片段待用,。注意:一定要加合適的 DNA marker 以便確定片段范圍,。
6. 分光光度法精確測定回收片段的濃度。
7. 在 PCR 管中按順序加入 0.5 μg 上步回收得到的回收片段,、50 μL PCR Mix
3.0,、加超純水到 100 μL。
8. 按下面的 PCR 反應參數(shù)進行*輪無引物 PCR:
過程 溫度 時間
PCR 前變性 94℃ 150 s
PCR 反應 94℃ 30 s
(40 循環(huán)) 47.5℃ 45 s
72℃ 10 s,,每次循環(huán)后增加 5s
PCR 后延伸 72℃ 10 min
9. 取 5-10 μL 進行電泳檢測(本 PCR mix 含上樣成分,,可以直接上樣。紅色
染料的泳動速度相當于 50bp DNA),,然后進行 PCR 回收,,去除小片段 DNA
的干擾,得到*輪 PCR 產(chǎn)物,。
10. 將回收的*輪 PCR 產(chǎn)物原液,、10 倍,、20 倍和 50 倍稀釋液各 1uL 作為
PCR 模板設置 4 管第二輪 PCR 反應。
成分 用量
PCR 模板 1 μL
PCR Mix 3.0 50 μL
自備 DNA Shuffling 引物 各 30 pmol
超純水 加水到 100 μL
11. 按下列 PCR 參數(shù)進行第二輪 PCR,。
過程 溫度 時間
活化 94℃ 150 s
PCR 反應
(25 次循環(huán))
94℃ 30 s
47.5℃ 45 s
72℃ 60 s,,每次循環(huán)后增加 5s
PCR 后延伸 72℃ 10 min
12. 電泳檢測 4 個 PCR 產(chǎn)物,回收預期大小的 PCR 產(chǎn)物,,用于后續(xù)實驗(略),。 答客問 Q:易錯 PCR 和 DNA Shuffling 有何區(qū)別?
A:前者引入的是點突變,,后者引入的是重組突變。示意圖如下:
關(guān)聯(lián)產(chǎn)品 即用型易錯 PCR 試劑盒(CAT#:101005-100)
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