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DNA實驗技術(shù):高質(zhì)量DNA獲取方法之月桂酸鈉法

2013-10-12  閱讀(3164)

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從組織中獲取DNA難嗎?不難,,真不難。高一就有開設(shè)的從雞血中獲取DNA的生物實驗課,很簡單的幾步就可以得到DNA,。但要想獲取高質(zhì)量的DNA,尤其是從一些富含多糖,、多酚,、淀粉、纖維和蛋白的組織,,后面用于酶切,、高通量測序大片段文庫的構(gòu)建,還是有一定的難度的。
 
zui近協(xié)助北京農(nóng)業(yè)生物技術(shù)研究中心一個老師提取桃葉片DNA還是遇到了一些困難,,因為老師要做桃的個體重測序,,因此對DNA的要求還是非常高的。之前跟其他很多老師交流植物DNA的提取,,大多數(shù)目前仍然使用CTAB法,,有些老師購買試劑盒進行提取,,其實很多植物DNA提取試劑盒成分也是CTAB。CTAB法是提取植物DNA非常經(jīng)典方法,,但在提取的過程中由于要在65℃水浴中放置1個小時,,因此耗時較長。我們在使用該法提取桃DNA時,,獲得DNA中含有大量的蛋白和多糖,,雖然通過多次的苯酚氯仿抽提可以大部分去除,但DNA得率較低,。在這里給大家分享一種快速獲取植物高質(zhì)量DNA的方法,,供大家在提取植物DNA時作為參考,用該法提取的植物DNA*后續(xù)酶切,、BAC文庫構(gòu)建,、高通量測序大片段文庫構(gòu)建,將該法稱之為月桂酸鈉法,。
 
月桂酸鈉抽提緩沖液:
Tris-Hcl(pH8.0)100mmol/L,;NaCl 100mmol/L;EDTA(pH8.0)20mmol/L,;月桂酸鈉 1%,;
 
配法:準確稱取NaCl 5.844g,月桂酸鈉 10g置于1000mL燒杯中,,加入100ml Tris-Hcl(1M)以及40mLEDTA(0.5M),、800mlddH2O,用鹽酸調(diào)節(jié)pH至8.0,,定容至1000 mL,,滅菌后室溫保存。
 
月桂酸鈉英文名稱:sodium lauroyl sarcosine  分子式:C15H28NaO3N,,分子量:293.39,。
 
以該法大量獲取玉米葉片DNA為例的實驗流程:
(1)選取適量的玉米幼苗新鮮葉片,以紗布捆扎,,做好標記,,置于液氮中保存;
(2)研缽以液氮預(yù)冷,,將玉米葉片置于研缽中,,倒入液氮,迅速研磨至粉末級,,期間時時加入液氮,,防止研磨過程中DNA被降解;
(3)將研磨好的粉末移入滅菌后的50mL抽提試管中,,用移液管加入10mL月桂酸鈉抽提緩沖液,,反復(fù)緩慢的搖勻,;
(4)用移液管向50mL抽提試管中加入等體積(10mL)酚:氯仿:異戊醇(25:24:1),反復(fù)緩慢的搖勻,;
(5)12000 rpm,,4°C離心20min后取出,小心吸取上清液16mL于新滅菌的50ml抽提試管中,;
(6)向上述抽提試管中加入12mL異丙醇,,上下緩慢顛倒數(shù)次,有白色絮狀沉淀析出,,顛倒時注意往一個方向,,防止沉淀散開,不利于后續(xù)實驗,;
(7)將白色絮狀沉淀用槍頭從抽提試管中輕輕挑出,,至于2mL EP管中;
(8)向上述2mL EP管中加入1.8mL70%乙醇,,反復(fù)輕輕震蕩洗滌,4°C,,12000 rpm,,高速離心15min,棄上清,,重復(fù)此步驟兩次,;
(9)將得到的白色沉淀再次4°C,12000 rpm短暫離心數(shù)秒,,以移液器吸干殘留乙醇,;
(10)白色沉淀置于37°C干燥箱中,使殘存的70%乙醇全部揮發(fā)干凈,,這個過程中要經(jīng)常拿出觀察,,防止過度烘干,不利于后面溶解,;
(11)待白色沉淀變透明后,,向2mLEP管中加入0.9mLTE緩沖液(pH8.0),放置于65℃恒溫箱中,,期間輕微彈勻,,使DNA充分溶解;
(12)DNA*溶解后,,加入5μL RNase(0.1mg/mL),,置于37°C干燥箱中30min,消化RNA,,取出3μL,,以1%瓊脂糖膠檢測是否有RNA殘留,;
(13)待RNA消化完成后,向EP管中加入等體積(0.9mL)氯仿,,輕輕搖勻,;
(14)4°C,12000 rpm高速離心15min,;
(15)吸取0.7mL上清置于1.5ml新EP管中,,加入1/10體積(約0.07mL)NaAc(3M/L)溶液,輕輕搖勻,;
(16)向上述EP管中加入等體積(0.7mL)異丙醇,,輕輕搖勻后,于-20°C靜置20min,;
(17)4°C,,12000 rpm高速離心15min,棄上清,;
(18)將得到的白色沉淀以70%乙醇洗滌兩次,,去除殘留的乙醇;
(19)白色沉淀置于37°C干燥箱中,,使殘存的70%乙醇全部揮發(fā)干凈,,該過程中要經(jīng)常拿出觀察,防止烘干過度,,不利于后面溶解,;
(20)待白色沉淀變透明,管中無殘留的乙醇味后,,加入200μL TE(pH8.0),,于37°C干燥箱中溶解;
(21)待DNA*溶解后,,取出1μL,,以分光光度計測定OD值,分裝后于保存(-20°C),。
以該法獲取的玉米葉片DNA電泳圖如下:



DNA提取過程中常見問題及建議解決方案:



來源:http://blog.sciencenet.cn/blog-657244-721856.html

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