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實(shí)驗(yàn)題目 :目的基因的亞克隆
一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/p>
1,、掌握細(xì)菌基因組提取的方法和原理,。
2、掌握限制性核酸內(nèi)切酶處理基因組及其結(jié)果分析,。
3,、掌握基因片段回收的方法。
二,、實(shí)驗(yàn)原理
細(xì)菌基因組的提?。和ㄟ^堿法或者酶法裂解細(xì)菌之后,可以將胞內(nèi)的核酸和蛋白質(zhì)全釋放出來,。DNA溶于1mol/L的NaCl中,,不溶于0.14mol/L的NaCl,而RNA溶于0.14mol/L的NaCl不溶于1mol/L的NaCl中,,通過溶液中鹽濃度的變化可以將DNA和RNA分開,。氯仿-異戊醇法除去蛋白,2倍體積乙醇將DNA沉淀出來,。
限制性核酸內(nèi)切酶只作用于特定的位點(diǎn),,處理基因組后只會(huì)得到有限的片斷。通過單酶切或者多酶切后電泳檢驗(yàn)就可以得到與物種本身有關(guān)的特定的圖譜,。
電泳后選定目的基因的條帶,,紫外燈下將含有目的基因的凝膠切下,使用凝膠回收試劑盒,,將凝膠溶化后,,通過吸附柱時(shí),核酸片段就吸附在柱上,洗脫液洗脫后加入2倍體積乙醇,,核酸沉淀,,TE溶解沉淀,核酸片段得到回收,。
三,、試劑與器材
1、試劑 E.coli JM109,,牛肉膏,,胰蛋白胨,NaCl,,微量細(xì)菌基因組抽提試劑盒(上海生工),,BamH I、Xho1 核酸內(nèi)切酶(Takara),,NEB 標(biāo)準(zhǔn)分子量片段(1kb DNA Ladder),,凝膠電泳回收試劑盒
2、器材 高速臺(tái)式冷凍離心機(jī),,水平電泳儀,,漩渦混合儀,紫外檢測儀,,凝膠成像分析系統(tǒng),,微量移液器及吸頭。
四,、操作方法
1.使用LB培養(yǎng)基活化,、培養(yǎng)菌體。
2.離心收集菌體,,根據(jù)試劑盒說明提取基因組,。
3.限制性酶處理基因組。
4.E.coli JM109的基因組經(jīng)過限制性內(nèi)切酶處理后,,使用瓊脂糖凝膠電泳檢測,,凝膠成像系統(tǒng)將酶切圖譜采集下來并對(duì)其分析。
5.紫外燈下將需要回收的核酸片段切下來,,使用凝膠回收試劑盒回收DNA片段,。
6.電泳檢測回收的核酸片段。
五,、關(guān)鍵步驟與注意事項(xiàng)
1.菌體培養(yǎng)過程要嚴(yán)格無菌,,染菌后提取得到的基因組會(huì)成多條帶,酶切的圖譜也會(huì)比較復(fù)雜,。
2.基因組提取過程中所使用的器材要嚴(yán)格滅菌,,防止核酸酶降解基因組,。
3.基因組提取過程不可以劇烈振蕩,防止DNA斷鏈,。
4.在內(nèi)切酶zui適條件下充分處理基因組,,得到正確的圖譜。
5.瓊脂糖溶化要充分,。
6.切下凝膠時(shí)要注意防護(hù)紫外線,,電泳結(jié)束之后盡快將膠條切下來,凝膠條要窄,,脫尾部分不回收,。
六、思考題
1.BamH I,、Xho1的作用位點(diǎn)分別是什么,?
2.內(nèi)切酶分析基因圖譜的注意事項(xiàng)?
3.瓊脂糖溶解不好會(huì)對(duì)核酸片段回收產(chǎn)生什么影響,?
4.凝膠回收的注意事項(xiàng),?