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[實驗原理]
根據(jù)決定某等位基因的堿基性質(zhì),設計3′端*個堿基分別與各等位基因的特異性堿基相匹配的序列特異性引物,,在PCR反應過程中,,只有引物3′端*個堿基與決定特定等位基因的堿基互補時才能實現(xiàn)DNA 片段的*復制,根據(jù)PCR 產(chǎn)物的有無進行等位基因的分型,。
[實驗器材]
PCR 擴增儀,、電泳儀、電泳槽,。
[實驗試劑]
引物1:5′-GCATCAAGTACCACTGGT-3′,;引物2:5′-GCATTAAGTACCACTGAG-3′;共通引物:5′-GAGAAGTTGAGAAAGGGGT-3′,。模板DNA,、Taq 聚合酶,、丙烯酰胺、電極緩沖液,、上樣緩沖液等
[實驗方法]
1.PCR擴增PCR反應體系為20μl(2個體系,,分別為引物1和引物2),含模板2μl(約50ng),,引物各1.5μl,dNTP1.6μl(0.4mM),,10×Buffer緩沖液2μl,Taq酶1.0U,,加雙蒸水至20.0μl,;PCR反應條件為94℃4min,94℃1.5min/52℃2.0min/72℃2.0min,30個循環(huán),。
2.PCR 擴增產(chǎn)物的檢測 取PCR擴增產(chǎn)物2μl,,6%聚丙烯酰胺凝膠電泳(T=6%,C=3.3%,,凝膠規(guī)格為82mm×64mm×0.75mm),。電極緩沖液為1×TBE。將加有1/5體積上樣緩沖液的酶切產(chǎn)物電泳,,220 v 電壓,電泳2-3h,。銀染顯色
[結果判定]
根據(jù)電泳譜帶的有無判定等位基因型別,,僅有1 個體系檢測到譜帶者為相應特異性引物對應型(M 或N),2 個體系均檢測到譜帶者為MN 型,。
[實驗討論]
1.注意事項 ①如引物結合序列存在堿基變異可能無擴增產(chǎn)物,,導致錯誤判型;②在對照樣品分型準確的基礎上才能判定結果,。