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Northern blot 是一種通過檢測RNA的表達(dá)水平來檢測基因表達(dá)的方法,，通過northernblot的方法可以檢測到細(xì)胞在生長發(fā)育特定階段或者脅迫或病理環(huán)境下特定基因表達(dá)情況。Northern blot 首先通過電泳的方法將不同的RNA分子依據(jù)其分子量大小加以區(qū)分,，然后通過與特定基因互補(bǔ)配對的探針雜交來檢測目的片段,。
實(shí)驗(yàn)方法
- Northern blot技術(shù)
- Northern Blot
| 實(shí)驗(yàn)方法原理 | Northern blot的基本概述是將RNA樣品通過變性瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行分離，再轉(zhuǎn)移至尼龍膜等固相膜載體上,，用放射性或非放射性標(biāo)記DNA或RNA特異性探針對固定于固相膜上的mRNA進(jìn)行雜交,，洗膜去除非特異性結(jié)合雜交信號(hào)，經(jīng)放射自顯影或現(xiàn)色反應(yīng),，對雜交信號(hào)進(jìn)行分析,。將雜交的mRNA分子在電泳中遷移位置與標(biāo)準(zhǔn)分子量分子進(jìn)行比較，即可知道細(xì)胞中特定的基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的大??；對雜交信號(hào)的強(qiáng)弱比較，可以知曉該基因表達(dá)mRNA水平的強(qiáng)弱,。 |
|---|---|
| 實(shí)驗(yàn)材料 | DNA |
| 試劑,、試劑盒 | MOPS電泳buffer 甲醛凝膠加樣buffer EB EGFR探針 DIG SSC |
| 儀器、耗材 | 水平電泳儀 制冰機(jī) 恒溫水浴箱 凝膠成像系統(tǒng) EP管 移液器 Tip頭 |
| 實(shí)驗(yàn)步驟 | 一,、RNA轉(zhuǎn)移與固定 1. 變性瓊脂糖電泳分離總RNA樣品完成后,，1×MOPS buffer淋洗凝膠片刻，10×SSC中浸泡平衡凝膠30 min,。 2. 按southern blot實(shí)驗(yàn)中DNA轉(zhuǎn)移方法及裝置轉(zhuǎn)移總RNA至尼龍膜上（過程中注意無RNA酶操作）,。 3. 1×SSC淋洗尼龍膜后濾紙吸干，夾在2層干凈濾紙中80℃烤箱烘烤2小時(shí),。 4. RNA染色,，干燥的尼龍膜先于5%冰乙酸中室溫浸泡15 min。 5. 于0.5 mol/L 乙酸鈉和0.04%亞甲藍(lán)溶液中浸泡5~10 min,。 6. 去離子水淋洗膜5~10 min,，可見RNA標(biāo)準(zhǔn)及28s及18 sRNA的條帶，軟鉛筆標(biāo)記,。 二、預(yù)雜交,、雜交及顯色 1. Washing buffer潤洗1遍（3~5 min）,。 2. 100 ml blocking buffer工作液封閉30 min,。 3. 100 ml antibody buffer（1：5000）孵育30 min。 4. Washing buffer洗膜（15 min×2）,。 5. 20 ml detection buffer 平衡2~5 min,。 6. 將尼龍膜置于10 ml color-substrate solution 棕色瓶中，避光數(shù)min至1天（出現(xiàn)顏色時(shí)不要搖動(dòng)）,。 7. 當(dāng)出現(xiàn)條帶時(shí),，TE-buffer洗膜（5 min×1），終止現(xiàn)色,。 8. 照相記錄,，80℃烤干，儲(chǔ)存,。 9. 掃描計(jì)算EGFR基因擴(kuò)增的倍數(shù),。 |
| 注意事項(xiàng) | 1. 避免RNA酶污染，防止RNA降解,。 2. 凝膠中不要加入EB,，以免降低雜交的效率。 3. 為降低膜雜交本底,，可適當(dāng)延長預(yù)雜交時(shí)間,。 |
