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RNA實驗技術(shù):RNA的變性瓊脂糖凝膠電泳實驗原理、材料和操作步驟

2013-10-22  閱讀(1270)

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一、實驗目的

學習RNA瓊脂糖凝膠電泳的使用技術(shù),。

二、實驗原理

RNA可以使用非變性或變性凝膠電泳進行檢測,。在非變性電泳中,,可以分離混合物中不同分子量的RNA分子,凡是無法確定分子量,。只有在變性情況下,,RNA分子*伸展,其泳動率才與分子量成正比,。

判斷RNA提取物的完整性是進行電泳的主要目的之一,。完整的未降解的RNA制品的電泳圖譜應可清晰看到18s rRNA、28s rRNA,、5s rRNA的三條帶,,且28s rRNA的亮度應為18s rRNA的兩倍。

三,、材料,、試劑及器具

1、 材料

總RNA提取物,。

2,、 試劑

(1)0.1%DEPC水:200ml雙蒸去離子水加0.2mlDEPC焦炭酸、二乙酯混勻,,室溫放置,,高壓滅菌。

(2)10x電泳緩沖液,。

嗎啉代丙烷磺酸(MOPS) 0.4mol/L(pH 7.0)

NaAc 0.1mol/L

乙二胺四乙酸(EDTA) 10mmol/L

(3)50mL變性瓊脂糖凝膠(1%)

(4)10x電泳緩沖液 5 mL

瓊脂糖 0.5 g

0.1%DEPC水 36.5 mL

加熱溶解,,稍冷卻,加入8.5 mL 37%甲醛,。

(5)上樣緩沖液:50%甘油,,1mmmol/LEDTA,0.4% 溴酚蘭,,0.4%二甲苯藍,。

(6)甲酰胺(去離子)。

3、器具

(1)電泳系統(tǒng)

(2)紫外透視儀

四,、操作步驟

1,、 將制膠用具用70%乙醇沖洗一遍,晾干備用,。

2,、 制膠:

稱取0.5g瓊脂糖粉末,加入放有36.5mL的DEPC水的錐形瓶中,,加熱使瓊脂糖*溶解,。稍冷卻后加入5mL的10x電泳緩沖液、8.5mL的甲醛,。然后在膠槽中灌制凝膠,,插好梳子,水平放置待凝固后使用,。

3,、 加樣:

在一個潔凈的小離心管中混合以下試劑:電泳緩沖液(10x)2μl、甲醛3.5mL,、甲酰胺10mL,、RNA樣品3.5μl?;靹?,置60℃保溫10min,冰上速冷,。加入3μl的上樣緩沖液混勻,,取適量加樣于凝膠點樣孔內(nèi)。同時點RNA標準樣品,。

4、 電泳:

打開電泳儀,,穩(wěn)壓7.5V/cm電泳,。

5、 電泳結(jié)束后通過紫外透視儀觀察,。

五,、注意事項

本實驗中必須保持RNase污染以免RNA降解。所有試劑用DEPC水配制,,用具也用DEPC水沖洗,,并滅菌。

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