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三、操作步驟
(一)取材,、冰凍切片:
將動(dòng)物以3%戊巴比妥鈉麻醉,,打開(kāi)胸腔,暴露心臟,,刺破右心耳,,將針尖刺入左心室用生理鹽水灌注(灌注量約為動(dòng)物體重的2倍),再注入等量的4%多聚甲醛,。(見(jiàn)圖2-7),。取材,置于4%多聚甲醛中后固定4hr,。以0.1M PBS浸泡沖洗4-5次(換液:1次/hr),。將組織塊入30%蔗糖/0.1M PBS液(4℃),1-2天后冰凍切片,,將切片裱貼于原位雜交玻片上,,切片厚度為15-20μm。
(二)探針制備與檢測(cè)(定量):
1. 隨機(jī)引物制備cDNA核酸探針以DIG DNA 標(biāo)記檢測(cè)試劑盒為例:
(1)探針制備:
①模板DNA(0.5-3 μg) 15 μl,,100℃變性10 min,,冰浴5 min。
②在冰浴中加:Hexanucleotide mix 2 μl,, dNTPmix 2 μl,,Klenow Enzyme 1 μl,反應(yīng)總體積為20 μl,。37℃孵育過(guò),。
③在上述20 μl 的標(biāo)記產(chǎn)物中加4 M LiCl 2.5 μl,,75 μl(無(wú)水乙醇預(yù)冷,輕輕混勻,,-20℃放置 2 hr,。4℃離心12 000 g×15 min,棄上清,。70%乙醇(預(yù)冷) 50 μl 洗滌,,7 500 g×5 min,棄上清,,晾干沉淀,,加TE 50 μl 溶解沉淀,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
(2)探針敏感性檢測(cè):
①樣品稀釋?zhuān)喝ig-標(biāo)記探針1 μl 用ddH2O以1:10,、1:100,、1:1000、1:1000,、1:10000梯度稀釋,。
②取一張與點(diǎn)樣器大小相近的尼龍膜,標(biāo)記方向,,ddH2O中浸泡 1 min,,6×SSC中浸泡10 min,置點(diǎn)樣器上,,負(fù)壓抽吸5 min,。
③將上述樣品點(diǎn)于尼龍膜上,繼續(xù)抽吸10 min,。
④取下尼龍膜,,置紫外燈下10 cm 處照射5 min,晾干,。
⑤將膜置于適量預(yù)雜交液(5-10 ml)中,,37℃預(yù)雜交10 min。
⑥加入Anti-dig 抗體(1:5000),,37℃雜交30 min,。
⑦洗膜:2×SSC/0.1%SDS室溫洗10 min×2次。
⑧顯色:15 ml TSM2中加300 μl 顯色液(NBT/BCIP),,37℃避光顯色30 min,。
2. PCR法制備cDNA核酸探針:
(1) 探針制備:
以PCR DIG Probe Synthesis Kit 為例:
在0.5 ml 離心管中,依次加入:
PCR引物 1(10 pM) 2 μl,;
PCR引物 1(10 pM) 2 μl,;
質(zhì)粒DNA 模板(10-100 pg) 2 μl;
PCR DIG mix 2 μl (含dNTP和DIG-11-dUTP),;
dNTPmix 2 μl,;
10×PCR buffer 5 μl,;
Taq 酶(2 u/μl) 1 μl;
加入適量ddH2O,,使總體積達(dá)50 μl,。
① 將上述混合液稍加離心,立即置PCR儀上,,執(zhí)行擴(kuò)增,。
一般:在93℃預(yù)變性3-5min,進(jìn)入循環(huán)擴(kuò)增階段:93℃ 45 s → 58℃ 45 s → 72℃ 60 s,,循環(huán)30-35次,zui后在72℃ 保溫7 min,。
② 在上述PCR產(chǎn)物中加入4 M LiCl 12.5 μl,、預(yù)冷無(wú)水乙醇375 μl,輕輕混合后置于-20℃2 h,,12 000g×15 min,,棄上清。70%乙醇(預(yù)冷) 120 μl 洗滌沉淀,,離心7500g×5 min,,棄上清,晾干沉淀,,加TE 50 μl 溶解,,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
(2)探針檢測(cè):
行瓊脂糖凝膠電泳,紫外燈下觀察DIG-DNA探針含量(采用目測(cè)法),。
(三)原位雜交反應(yīng)(以DIG-cDNA探針為例):
1. 0.1 M PBS (pH 7.2) 浸 5-10 min,。
2. 0.1 M甘氨酸/0.1 M PBS 浸5 min。
3. 0.3%TritonX-100/0.1 M PBS 浸10-15 min,。
4. 0.1 M PBS 洗 5 min×3次,,加蛋白酶K(1 μg/ml),37℃孵育30 min,。
5. 4%多聚甲醛浸5 min,。
6. 0.1 M PBS 洗 5 min×2次,浸入新鮮配制的含0.25%乙酸酐/0.1 M 三乙醇胺中10 min,。
7. 預(yù)雜交:滴加適量預(yù)雜交液,,42℃ 30 min。
(1)雜交:傾去預(yù)雜交液,,在每張切片上滴加10-20 μl 雜交液(將探針變性后稀釋在預(yù)雜交液中,,0.5 ng/μl ),覆以蓋玻片或蠟?zāi)ぃ?2℃ 過(guò),。
(2)洗片:
4×SSC,、2×SSC,、1×SSC、0.5×SSC 37℃各洗20 min,;
0.2×SSC 37℃洗10 min,;0.2×SSC與0.1 M PBS各半洗10 min;
0.05 M PBS 洗 5 min×2次,。
10. 3% BSA/0.05 M PBS 包被,,37℃ 30 min。
11. 滴加抗地高辛-抗血清堿性磷酸酶復(fù)合物(以抗體稀釋液1:5000稀釋?zhuān)?℃孵育過(guò),。
12. 0.05M PBS洗15 min×4次,;TSM1 10 min×2次; 新鮮配制TSM2 10 min×2次,。
13. 顯色:在玻片上滴加適量顯色液,,4℃避光過(guò)。
14. 將玻片置于TE中10-30 min以終止反應(yīng),。酒精梯度脫水,、二甲苯脫脂,中性樹(shù)膠封片,。
15. 顯微鏡下觀察結(jié)果,。
四、注意事項(xiàng):
1. 作為DNA-RNA的雜交,,需防RNase的污染,。
2. cDNA探針在雜交時(shí)必須變性解鏈。具體方法是:將探針置100℃加熱5 min,,冰浴驟冷