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原位雜交組織（或細胞）化學 （In situ Hybridization Histochemistry,，ISHH） 簡稱原位雜交（In Situ Hybridization）,，屬于固相分子雜交的范疇，它是用標記的DNA或RNA為探針，在原位檢測組織細胞內特定核酸序列的方法。根據所用探針和靶核酸的不同，原位雜交可分為DNA-DNA雜交,，DNA-RNA雜交和RNA-RNA雜交三類。
根據探針的標記物是否直接被檢測,，原位雜交又可分為直接法和間接法兩類,。直接法主要用放射性同位素、熒光及某些酶標記的探針與靶核酸進行雜交,，雜交后分別通過放射自顯影,、熒光顯微鏡術或成色酶促反應直接顯示,。間接法一般用半抗原標記探針，zui后通過免疫組織化學法對半抗原定位,，間接地顯示探針與靶核酸形成的雜交體,。
原位雜交zui初是以同位素標記探針進行的。盡管同位素標記（如35S,，3H,，32P等）仍然廣泛使用，但非同位素標記探針的迅速發(fā)展（尤其是生物素標記探針和地高辛標記探針）,，更引起科技工作者的極大興趣,。
根據探針的標記物是否直接被檢測,，原位雜交又可分為直接法和間接法兩類,。直接法主要用放射性同位素、熒光及某些酶標記的探針與靶核酸進行雜交,，雜交后分別通過放射自顯影,、熒光顯微鏡術或成色酶促反應直接顯示,。間接法一般用半抗原標記探針，zui后通過免疫組織化學法對半抗原定位,，間接地顯示探針與靶核酸形成的雜交體,。
原位雜交zui初是以同位素標記探針進行的。盡管同位素標記（如35S,，3H,，32P等）仍然廣泛使用，但非同位素標記探針的迅速發(fā)展（尤其是生物素標記探針和地高辛標記探針）,，更引起科技工作者的極大興趣,。
一、基本要求
1. 組織取材：組織取材應盡可能新鮮,。由于組織RNA降解較快,，所以新鮮組織和培養(yǎng)細胞在30 min 內固定。
2. 固定目的是：
（1）保持細胞結構,；
（2）zui大限度地保持細胞內DNA或RNA的水平,；
（3）使探針易于進入細胞或組織。
zui常用的固定劑是多聚甲醛,，與其它醛類固定劑（如戊二醛）不同,，多聚甲醛不會與蛋白質產生廣泛的交叉連接，因而不會影響探針穿透入細胞或組織,。
3. 增強組織的通透性和核酸探針的穿透性：
（1）稀酸處理和酸酐處理：為防止探針與組織中堿性蛋白之間的靜電結合,，以降低背景，雜交前標本可用0.25%乙酸酐處理10 min,，經乙酸酐處理后,，組織蛋白中的堿性基團通過乙酰化而被阻斷,。組織和細胞標本亦可用0.2 M HCl處理10 min，稀酸能使堿性蛋白變性,，結合蛋白酶消化,，容易將堿性蛋白移除。
（2）去污劑處理：去污劑處理的目的是增加組織的通透性,，利于雜交探針進入組織細胞,，zui常應用的去污劑是Triton X-100。注意：過度的去污劑處理不僅影響組織的形態(tài)結構,，而且還會引起靶核酸的丟失,。
（3） 蛋白酶處理：蛋白酶消化能使經固定后被遮蔽的靶核酸暴露，以增加探針對靶核酸的可及性,。常用的蛋白酶有蛋白酶K（proteinase K）,，還有鏈霉蛋白酶（pronase）和胃蛋白酶（pepsin）等,。
4. 雜交緩沖液孵育：
雜交前用不含探針的雜交緩沖液在雜交溫度下孵育2 hr，以阻斷玻片和標本中可能與探針產生非特異性結合的位點,，達到減低背景的目的,。
5. 防止污染：
由于在手指皮膚及實驗室用玻璃器皿上均可能含有RNA酶，為防止其污染影響實驗結果,，在整個雜交前處理過程中都需要戴消毒手套,，實驗所用玻璃器皿及鑷子都應于實驗前一日置高溫烘烤（180℃）以達到消除RNA酶的目的。雜交前及雜交時所用的溶液均需經高壓消毒處理,。
6. 雙鏈DNA探針和靶DNA的變性：
雜交反應進行時,，探針和靶核酸都必須是單鏈的。如果用雙鏈DNA探針進行雜交（包括檢測RNA時）,，雙鏈DNA探針在雜交前必須進行變性,。探針變性后要立即進行雜交反應，不然解鏈的探針又會重新復性,。
雜交液：
雜交液內除含一定濃度的標記探針外,，還含有較高濃度的鹽類、甲酰胺,、硫酸葡聚糖,、牛血清白蛋白及載體DNA或RNA等。
雜交液中含有較高濃度的Na+可使雜交率增加,，可以減低探針與組織標本之間的靜電結合,。甲酰胺可使Tm降低，雜交液中含每1%的甲酰胺可分別使RNA：RNA,，RNA：DNA,，DNA：DNA的雜交溫度降低0.35℃，0.5℃和0.65℃,。
所以,，雜交液中加入適量的甲酰胺，可避免因雜交溫度過高而引起的組織形態(tài)結構的破壞以及標本的脫落,。硫酸葡聚糖能與水結合,，從而減少雜交液的有效容積，提高探針有效濃度,，以達到提高雜交率的目的（尤其對雙鏈核酸探針）,。
在雜交液中加入牛血清白蛋白及載體DNA或RNA等，都是為了阻斷探針與組織結構成分之間的非特異性結合,，以減低背景,。
探針的濃度：
探針濃度依其種類和實驗要求略有不同，一般為0.5~5.0 μg/ml（0.5~5.0 ng/μl）,。zui適宜的探針濃度要通過實驗才能確定,。
探針的長度：
一般應在50-300個堿基之間,，zui長不宜超過400個堿基。探針短易進入細胞,，雜交率高,，雜交時間短。
二,、試劑準備
1. 0.1 M PBS （pH7.2）：Na2HPO4•12 H2O 61.6 g,、NaH2PO4•2 H2O 5.6 g、NaCl 9 g,，加ddH2O至2000 ml,，高壓滅菌。
2. 0.2 M PB （（pH7.2）：Na2HPO4•12 H2O 61.6 g,、NaH2PO4•2 H2O 5.6 g 加ddH2O至1000 ml,，高壓滅菌。
3. 0.1 M甘氨酸：0.75g甘氨酸溶于0.1 M PBS,，定容至100 ml,，高壓滅菌。
4. 4%多聚甲醛：多聚甲醛40 g加ddH2O 400 ml,，加熱至70℃左右,，用1 M NaOH調pH至7.0，用ddH2O定容至500 ml,，再加0.2 M PBS 500 ml,，總體積為1000 ml。
5. 16×Denhardt溶液：聚乙烯吡咯酮0.4 g,、小牛血清白蛋白（BSA） 0.4 g,、聚蔗糖0.4 g，加dd H2O至10 ml,，無菌抽濾,、分裝， -20℃保存?zhèn)溆谩?br />6. 預雜交液：去離子甲酰胺10 ml,、50%硫酸葡聚糖4 ml,，于50℃促溶后，再依次加入16×Denhardt液0.2 ml,、1 M Tris-HCl（pH 8.0） 0.2 ml、5 M NaCl 1.2 ml,、0.5 M EDTA（pH 8.0） 0.04 ml,、0.1 M 二硫蘇糖醇 2 ml、ddH2O 2.21 ml,，總體積為10 ml,。無菌抽濾,、分裝，-20℃保存?zhèn)溆?。臨用前加入50 mg/ml 變性鮭魚精DNA 75 μl/ml,。
7. 20×SSC: NaCl 175.3 g、檸檬酸三鈉88.2 g,，加水至800 ml,，用2 N NaOH調pH至7.0，再用ddH2O定容至1000 ml,。
8. 抗體稀釋液：Triton X-100 80 μl,、BSA 0.2 g，以0.05 M PBS定容至20 ml,。
9. TSM1：1 M Tris-HCl（pH 8.0）10 ml,、5 M NaCl 2 ml、1 M MgCl2 1ml,，加ddH2O 100 ml,。
TSM2（新鮮配制）：1 M Tris-HCl（pH 9.5）10 ml、5 M NaCl 2 ml,、1 M MgCl2 1 ml,，加ddH2O至100 ml。
顯色液（臨用前現配）：5 ml TSM2 加顯色液原液（NBT/BCIP）150 μl,，并加適量左旋咪唑使其終濃度為0.24 μg/ml,，避光。
