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根據(jù)探針的標(biāo)記物是否直接被檢測,,原位雜交又可分為直接法和間接法兩類,。直接法主要用放射性同位素、熒光及某些酶標(biāo)記的探針與靶核酸進(jìn)行雜交,,雜交后分別通過放射自顯影,、熒光顯微鏡術(shù)或成色酶促反應(yīng)直接顯示。間接法一般用半抗原標(biāo)記探針,,zui后通過免疫組織化學(xué)法對半抗原定位,,間接地顯示探針與靶核酸形成的雜交體。
原位雜交zui初是以同位素標(biāo)記探針進(jìn)行的,。盡管同位素標(biāo)記(如35S,,3H,32P等)仍然廣泛使用,,但非同位素標(biāo)記探針的迅速發(fā)展(尤其是生物素標(biāo)記探針和地高辛標(biāo)記探針),,更引起科技工作者的極大興趣。
雜交液:
雜交液內(nèi)除含一定濃度的標(biāo)記探針外,,還含有較高濃度的鹽類、甲酰胺、硫酸葡聚糖,、牛血清白蛋白及載體DNA或RNA等,。
雜交液中含有較高濃度的Na+可使雜交率增加,可以減低探針與組織標(biāo)本之間的靜電結(jié)合,。甲酰胺可使Tm降低,,雜交液中含每1%的甲酰胺可分別使RNA:RNA,,RNA:DNA,,DNA:DNA的雜交溫度降低0.35℃,0.5℃和0.65℃,。
所以,,雜交液中加入適量的甲酰胺,可避免因雜交溫度過高而引起的組織形態(tài)結(jié)構(gòu)的破壞以及標(biāo)本的脫落,。硫酸葡聚糖能與水結(jié)合,,從而減少雜交液的有效容積,提高探針有效濃度,,以達(dá)到提高雜交率的目的(尤其對雙鏈核酸探針),。
在雜交液中加入牛血清白蛋白及載體DNA或RNA等,都是為了阻斷探針與組織結(jié)構(gòu)成分之間的非特異性結(jié)合,,以減低背景,。
探針的濃度:
探針濃度依其種類和實(shí)驗(yàn)要求略有不同,一般為0.5~5.0 μg/ml(0.5~5.0 ng/μl),。zui適宜的探針濃度要通過實(shí)驗(yàn)才能確定,。
探針的長度:
一般應(yīng)在50-300個堿基之間,zui長不宜超過400個堿基,。探針短易進(jìn)入細(xì)胞,,雜交率高,雜交時間短,。
二,、試劑準(zhǔn)備
1. 0.1 M PBS (pH7.2):Na2HPO4•12 H2O 61.6 g、NaH2PO4•2 H2O 5.6 g,、NaCl 9 g,,加ddH2O至2000 ml,高壓滅菌,。
2. 0.2 M PB ((pH7.2):Na2HPO4•12 H2O 61.6 g,、NaH2PO4•2 H2O 5.6 g 加ddH2O至1000 ml,高壓滅菌,。
3. 0.1 M甘氨酸:0.75g甘氨酸溶于0.1 M PBS,,定容至100 ml,高壓滅菌。
4. 4%多聚甲醛:多聚甲醛40 g加ddH2O 400 ml,,加熱至70℃左右,,用1 M NaOH調(diào)pH至7.0,用ddH2O定容至500 ml,,再加0.2 M PBS 500 ml,,總體積為1000 ml。
5. 16×Denhardt溶液:聚乙烯吡咯酮0.4 g,、小牛血清白蛋白(BSA) 0.4 g,、聚蔗糖0.4 g,加dd H2O至10 ml,,無菌抽濾,、分裝, -20℃保存?zhèn)溆谩?br />6. 預(yù)雜交液:去離子甲酰胺10 ml,、50%硫酸葡聚糖4 ml,,于50℃促溶后,再依次加入16×Denhardt液0.2 ml,、1 M Tris-HCl(pH 8.0) 0.2 ml,、5 M NaCl 1.2 ml、0.5 M EDTA(pH 8.0) 0.04 ml,、0.1 M 二硫蘇糖醇 2 ml,、ddH2O 2.21 ml,總體積為10 ml,。無菌抽濾,、分裝,-20℃保存?zhèn)溆?。臨用前加入50 mg/ml 變性鮭魚精DNA 75 μl/ml,。
7. 20×SSC: NaCl 175.3 g、檸檬酸三鈉88.2 g,,加水至800 ml,,用2 N NaOH調(diào)pH至7.0,再用ddH2O定容至1000 ml,。
8. 抗體稀釋液:Triton X-100 80 μl,、BSA 0.2 g,以0.05 M PBS定容至20 ml,。
9. TSM1:1 M Tris-HCl(pH 8.0)10 ml,、5 M NaCl 2 ml、1 M MgCl2 1ml,,加ddH2O 100 ml,。
TSM2(新鮮配制):1 M Tris-HCl(pH 9.5)10 ml,、5 M NaCl 2 ml、1 M MgCl2 1 ml,,加ddH2O至100 ml,。
顯色液(臨用前現(xiàn)配):5 ml TSM2 加顯色液原液(NBT/BCIP)150 μl,并加適量左旋咪唑使其終濃度為0.24 μg/ml,,避光,。