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志賀氏菌屬(Shigella.spp)熒光定量PCR檢測(cè)試劑盒說(shuō)明書

閱讀:2646      發(fā)布時(shí)間:2010-12-30
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本試劑盒采用TaqMan探針法實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù),,用于志賀氏菌的PCR體外特異性檢測(cè)。檢測(cè)靈敏度為100拷貝/mL,。定量檢測(cè)線性范圍為:10-1010拷貝/mL,。

規(guī)格
48次檢測(cè)
DNA提取液
3mL/管
志賀氏菌PCR反應(yīng)液
1100µL/管
Taq酶(5U/µL)
24µL /管
志賀氏菌陽(yáng)性對(duì)照
100µL/管
志賀氏菌陰性對(duì)照
100µL/管
說(shuō)明書
1份

貯存與運(yùn)輸條件
本試劑盒必須在-20℃下避光保存,有效期為6個(gè)月,。
實(shí)驗(yàn)操作步驟
1.         DNA提?。?/b>取增菌液1mL加到1.5mL無(wú)菌離心管中,10,000rpm離心5min,,棄去上清,;加入50µL DNA提取液,充分混勻后沸水浴5 min,,13,000rpm離心5min,,取上清液進(jìn)行檢測(cè)或保存于-20℃以待檢測(cè)。
2.         擴(kuò)增試劑準(zhǔn)備(在試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)完成
2.1.        從試劑盒中取出PCR反應(yīng)液,,冰盒上融化后混勻,。試劑在使用前2000rpm離心20s備用。
2.2.        設(shè)需要的PCR反應(yīng)管管數(shù)為N(N = 待檢樣本數(shù)+ 1管陰性對(duì)照 +1管陽(yáng)性對(duì)照),。
2.3.        混合液的配制:先吸取體積為22.6(µL)×N反應(yīng)液1.5mL滅菌離心管,,再加入Taq DNA聚合酶0.4 (µL)×N,混勻后2000rpm離心20s,,然后向N 個(gè)0.2mL PCR反應(yīng)管中分裝已加入Taq酶的混合液23µL/每管,蓋緊管蓋,。
2.4.        注意:陰性對(duì)照管建議在此區(qū)中加入2µL陰性對(duì)照樣品,。
3.         加樣(在樣品制備區(qū)完成)
3.1.        陽(yáng)性對(duì)照取出解凍,使用前2000rpm 離心20s,。
3.2.        將保存在-20℃的核酸提取物置室溫解凍,,以13,000rpm離心5min;向N個(gè)PCR管中分別加入待檢樣本DNA(包括陽(yáng)性對(duì)照)2µL,,蓋緊管蓋,,2000rpm離心20s,將PCR反應(yīng)管轉(zhuǎn)移核酸擴(kuò)增區(qū),。注意做好樣品號(hào)標(biāo)記,。
4.         PCR擴(kuò)增(在核酸擴(kuò)增區(qū)完成)
4.1.        上機(jī)前應(yīng)檢查各反應(yīng)管是否蓋緊。
4.2.        反應(yīng)體系設(shè)為25µL;熒光信號(hào)采集設(shè)定在退火溫度,。對(duì)于多通道熒光PCR儀,,選擇熒光素FAM為信號(hào)采集通道。
4.3.       PCR循環(huán)參數(shù)為:*階段,,95℃  3 min預(yù)變性,;
第二階段,[95℃ 10s,;60℃ 40s] × 40次循環(huán),。
注意:在的LightCycler上使用,變性溫度95℃改為93℃,,其他不變,。
5.1   綜合分析儀器給出的各項(xiàng)數(shù)據(jù)及擴(kuò)增曲線,設(shè)定合理的閾值(Threshold)和基線(Baseline),,使儀器給出正確的結(jié)果,。
5.2   陰性對(duì)照CT值應(yīng)顯示為0或≥40.0,陽(yáng)性對(duì)照的CT值應(yīng)≤30.0,,否則視實(shí)驗(yàn)失敗,,需重做。
5.3   檢測(cè)樣品CT≤35.0,,結(jié)果有效,,可直接報(bào)告樣品陽(yáng)性。
5.4   檢測(cè)樣品35.0<CT>40.0,,需進(jìn)行一次重復(fù)實(shí)驗(yàn),,若CT仍介于35.0和40.0之間,且曲線有明顯的指數(shù)增長(zhǎng)特性,,同時(shí)陰性對(duì)照Ct值為零,,可報(bào)告樣品陽(yáng)性,否則報(bào)告樣品陰性,。
5.5   檢測(cè)樣品CT值為零,,報(bào)告樣本陰性。
適用熒光PCR儀品牌與型號(hào)
l         Cepheid公司的SmartCycler
l         ABI公司的Prism7000,、7700,、7500、9600系列
l         Stratagene公司的MX3000,、MX4000
l         Corbett Research公司的Rotor-Gene 3000
l         Bio-Rad公司的iCycler系列,、MJ opticon2
l         公司的LightCycler等
注意事項(xiàng)
1.         本試劑盒僅用于體外檢測(cè)使用,操作人員必須經(jīng)過(guò)培訓(xùn)并具有一定的經(jīng)驗(yàn),,試劑盒使用前請(qǐng)仔細(xì)閱讀說(shuō)明書全文,。
2.         請(qǐng)嚴(yán)格按照基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室的管理規(guī)范進(jìn)行實(shí)驗(yàn)操作,。
3.         PCR實(shí)驗(yàn)嚴(yán)格分區(qū)操作;各區(qū)應(yīng)有的手套,、移液器等,,不得交叉使用,避免污染,;工作人員應(yīng)遵循從一區(qū)到二區(qū)的單方向工作原則,,各工作區(qū)相對(duì)隔離;進(jìn)行PCR實(shí)驗(yàn)的工作桌面和及相關(guān)物品應(yīng)定期用1%次氯酸鈉,、75%酒精,、1mol/L鹽酸或紫外燈進(jìn)行滅菌和消毒。
4.         試劑盒中各試劑充分融化后請(qǐng)短暫離心,。反應(yīng)液分裝時(shí)應(yīng)盡量避免產(chǎn)生氣泡,。上機(jī)前應(yīng)注意檢查各反應(yīng)管是否蓋緊,以免污染儀器,。
 

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