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細菌總蛋白和膜蛋白提取方法

閱讀:686      發(fā)布時間:2013-09-04
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 驗試劑

裂解液(pH 8.5-9.0):50 mM Tris-HCl,,2 mM EDTA, 100 mM NaCl,,0.5% Triton X-100,調(diào)pH8.5-9.0備用,;

溶菌酶,;蛋白酶抑制劑PMSF1% SDS溶液,;Trizol裂解液,;無水乙醇;異丙醇,;0.3M鹽酸胍,;

疏水性蛋白提取液(非裂解液):1% Triton X-114150mM NaCl, 10mM Tris-HCl,,1mM EDTA,,調(diào)pH8.0備用。

實驗設(shè)備
高速離心機,;超聲儀,;透析袋,;EP管;渦旋儀,;水浴鍋等。
實驗步驟
1. 從新鮮樣品中提取總蛋白(簡易法)

   1) 自配裂解液(pH 8.5-9.0):50 mM Tris-HCl,,2 mM EDTA, 100 mM NaCl,,0.5% Triton X-100,調(diào)pH8.5-9.0備用,;用前加入100 μg/ml 溶菌酶,,1μl/ml 的蛋白酶抑制劑PMSF。該裂解液用量為10-50ml 裂解液/1g濕菌體,。

   2) 40ml 菌液在12000g,,4下離心15分鐘收集菌體,沉淀用PBS懸浮洗滌2遍,,沉淀加入1ml裂解液懸浮菌體,。
3) 超聲粉碎,采用300w,,10s超聲/10s間隔,,超聲20min,反復(fù)凍融超聲3次菌液變清或者變色,。
   4) 1000g離心去掉大碎片,,上清可直接變性后PAGE電泳檢測,或者用1% SDS溶液透析后凍存,。
缺點:Western blotting結(jié)果表明,,疏水性跨膜蛋白提取效率有限。
2. Trizol裂解液中分離總蛋白
   1) Trizol溶解的樣品研磨破碎后,,加氯仿分層,,2-810000g離心15min,上層水相用于RNA提取,,體積約為總體積的60%,。
   2) 用乙醇沉淀中間層和有機相中的DNA。每使用1ml Trizol加入0.3ml無水乙醇混勻,,室溫放置3min,,2-8不超過2000g離心5min
   3) 將上清移新的EP管中,,用異丙醇沉淀蛋白質(zhì),。每使用1ml Trizol加入1.5ml異丙醇,室溫放置10min,,2-812000g離心10min,,棄上清,。

   4) 用含有0.3M鹽酸胍的95%乙醇洗滌。每1ml Trizol加入2ml洗液,,室溫放置20min,, 2-87500g離心5min,棄上清,,重復(fù)洗滌2次,。后加入2ml無水乙醇,渦旋后室溫放置20min,,2-87500g離心5min,,棄上清。

   5) 冷凍干燥5-10min,,1%SDS溶液溶解,,反復(fù)吹打,50溫浴使其*溶解,,2-810000g離心10min去除不溶物,。
   6) 替代方案:將3中的酚醇上清液移小分子量透析袋中,在2-81% SDS溶液中透析3次,,1000g離心10min去除沉淀,,上清可直接用于蛋白實驗。
3. 從新鮮樣品中提取疏水性膜蛋白(Triton X-114去污劑法)
   1) 配制疏水性蛋白提取液(非裂解液):1% Triton X-114,,150mM NaCl, 10mM Tris-HCl,,1mM EDTA,調(diào)pH8.0備用,。
   2) 菌液于4條件下15000g離心15min收集菌體,;用1ml 含有5mM MgCl2 PBS洗滌3次,后于4條件下15000g離心15min收集菌體,。
   3) 菌體沉淀加入1ml冷提取液,,于4條件下放置2h17000g離心10min,,去除沉淀取上清,。

   4) 將上述上清中的Triton X-114含量增加到2%,再加入20mMCaCl2抑制部分蛋白酶活性,,37條件下放置10min使其分層,。室溫下1000g離心10min使液相和去污相充分分層。

   5) 將液相和去污相分開,,分別用10倍體積的冷丙酮在冰上沉淀45min,。
   6) 4條件下17000g離心30min,用去離子水洗滌沉淀3次,。
   7) 將沉淀溶解在1% SDS溶液中,,測定蛋白濃度,,比較液相和去污相中蛋白提取效率,一般是去污相中疏水性膜蛋白較多,,適于進一步蛋白實驗,。
   8) SDS-PAGE進一步分析液相和去污相的蛋白圖譜。
 
 

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