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通過微波增強(qiáng)的多肽固相合成自動(dòng)合成首尾相連的環(huán)肽

檢測(cè)樣品:環(huán)肽

檢測(cè)項(xiàng)目:環(huán)肽合成

方案概述:使用LibertyBlue?和LibertyPRIME?多肽合成儀可以快速、高純度進(jìn)行頭尾環(huán)化肽的全自動(dòng)合成,。微波增強(qiáng)的多肽固相合成不僅有利于線性組裝,,而且有利于隨后的環(huán)化步驟,在各種困難的生物學(xué)重要肽上實(shí)現(xiàn)了純度合成,。

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更新時(shí)間2022年08月26日

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摘要

使用 Liberty Blue™ 和 Liberty PRIME™ 多肽合成儀可以快速,、高純度進(jìn)行頭尾環(huán)化肽的全自動(dòng)合成。微波增強(qiáng)的多肽固相合成(SPPS)不僅有利于線性組裝,,而且有利于隨后的環(huán)化步驟,,在各種困難的生物學(xué)重要肽上實(shí)現(xiàn)了ji高的純度合成。Liberty PRIME 上使用的一鍋法 Fmoc SPPS 循環(huán)進(jìn)一步改善合成時(shí)間,、減少浪費(fèi),。

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表1 :全自動(dòng)合成首尾相連的環(huán)化肽

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表2:Liberty Blue 和 Liberty PRIME 合成 Cyclorasin A1


引言

環(huán)肽能夠橋接小分子和抗體之間的化學(xué)空間間隙,允許設(shè)計(jì)具有高結(jié)合親和力,、顯著選擇性,、低毒性和進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)靶點(diǎn)的能力的分子2。因此,,大環(huán)肽作為靶向傳統(tǒng)上無法成藥的生物靶點(diǎn)的治療劑具有相當(dāng)大的前景3,。截至 2017 年,超過 40 種環(huán)肽用于臨床4,。環(huán)肽作為候選藥物開發(fā)的這一令人鼓舞的趨勢(shì),,為發(fā)展更穩(wěn)健的制備方法提供了動(dòng)力。

SPPS 可以通過使用 Fmoc-Glu-ODmab 作為 C 端氨基酸 (圖 1) 制備首尾相連環(huán)化肽,。在合成線性肽骨架后,,可以使用稀肼溶液選擇性地去保護(hù) Dmab 基團(tuán)。之后,,可以使用微波增強(qiáng)偶聯(lián)實(shí)現(xiàn)首尾環(huán)化,。將微波能量應(yīng)用于首尾環(huán)化肽的合成可以實(shí)現(xiàn)更有效的偶聯(lián),從而加快合成時(shí)間和提高純度 (CarboMAX™)5,。

 

通過圖1.png

圖 1:Fmoc-Glu-ODmab ( 左 ); 

Fmoc-Glu(Wang resin LL)- ODmab (右)

 

材料與方法

試劑

以下含有zhi定的側(cè)鏈保護(hù)基團(tuán) Fmoc 氨基酸購(gòu)自 CEM Corporation (Matthews, NC) 并:Ala,、Arg (Pbf),、Gly、His (Boc),、Ile,、Leu、Lys (Boc),、Thr (tBu) ),、Trp (Boc)、Tyr (tBu) 和 Val,。Rink Amide ProTideTM LL 樹脂也購(gòu)自 CEM Corporation,。Fmoc-Glu-ODmab、Fmoc-Glu(Wang)-ODmab LL 樹脂,、FmocD-Ala- OH 和 Fmoc-4-氟-L-苯丙氨酸購(gòu)自 EMD Millipore (Burlington, MA),。Fmoc-D-2-Nal-OH、FmocD-Nle-OH 和 Fmoc-N-甲基-L-苯丙 氨酸購(gòu)自 Bachem (T orrance, CA),。Fmoc-N-甲基-異亮氨酸-OH 購(gòu)自 Advanced ChemTech (Louisville, KY)。FmocN-甲基-亮氨酸-OH 購(gòu)自 Alfa Aesar (Haverhill, MA),。水合肼,、N,N-二異丙基乙胺(DIEA)、Fmoc-N-甲基-甘氨酸-OH,、N,N'-二異丙基碳二亞胺 (DIC),、哌啶、吡咯烷,、三fu乙suan (TFA),、3,6-dioxa-1、 8 辛二硫醇(DODT) 和三異丙基硅烷 (TIS) 購(gòu)自 Sigma-Aldrich (St. Louis, MO),。N,N-二甲基甲酰胺 (DMF),、無水乙mi (Et2O) 和乙酸購(gòu)自 VWR (Radnor, PA)。LC-MS 級(jí)水 (H2O) 和 LC-MS 級(jí)乙腈 (MeCN) 購(gòu)自 Fisher Scientific (Hampton, NH) ,。

多肽合成:CEM 7-mer, cyclo-[GVYLHIE] 

使用 CEM Liberty Blue 自動(dòng)微波多肽合成儀,,在 Fmoc- Glu(Wang)- ODmab 樹脂(離子交換容量:0.025 meq/g)上,以 0.10 mmol 的規(guī)模合成(Dmab 脫保護(hù)以0.05 mmol 規(guī)模進(jìn)行,,首尾環(huán)化以 0.025 mmol的規(guī)模進(jìn)行),。使用 DMF 中的哌啶進(jìn)行脫保護(hù)。

偶聯(lián)反應(yīng)在5倍量的Fmoc氨基酸,DIC和Oxyma Pure(CarboMAX)中進(jìn)行,。使用肼的 DMF 溶液進(jìn)行 ODmab 基團(tuán)的脫保護(hù),。首尾環(huán)化反應(yīng)使用 DMF 中的 DIC/HOBt 進(jìn)行。在 CEM RazorTM 高通量多肽切割系統(tǒng)中使用 TFA/H2O/TIS/DODT 進(jìn)行切割,。裂解后無水乙mi沉淀肽并過夜凍干,。

通過圖片2.png

 

圖2:CEM 7-mer

 

多肽合成:Cyclorasin A, cyclo-[WTaRRR-nal-R-Fpa-nle-Q] (Liberty Blue)

使 用 CEM Liberty Blue 自 動(dòng) 微 波 多 肽 合 成 儀 , 在 Rink Amide ProTide LL 樹脂 (離子交換容量:0.19 meq/g )上,以 0.05 mmol 的規(guī)模合成(Dmab脫保護(hù)以 0.05 mmol 的規(guī)模進(jìn)行,,首尾環(huán)化以 0.025 mmol 的規(guī)模進(jìn)行),。使用 DMF 中的哌啶進(jìn)行脫保護(hù)。偶聯(lián)反應(yīng)在5倍Fmoc氨基酸,、DIC和Oxyma Pure(CarboMAX)5中進(jìn)行,。Fmoc-Glu-ODmab 用做第一個(gè)氨基酸(Q)。使用肼的 DMF 溶液進(jìn)行 ODmab 基團(tuán)的脫保護(hù),。首尾環(huán)化反應(yīng)使用 DMF 中的 DIC/HOBt 進(jìn)行,。在 CEM RazorTM 高通量多肽切割系統(tǒng)中使用 TFA/H2O/TIS/DODT 進(jìn)行切割。裂解后用無水乙mi沉淀肽并過夜凍干,。

多肽合成:Cyclorasin A, cyclo-[WTaRRR-nal-R-Fpa-nle-Q](Liberty PRIME)

使用 CEM Liberty PRIME 自動(dòng)微波多肽合成儀,,在  Rink Amide ProTide LL 樹脂(離子交換容量:0.19 meq/g)上,以 0.05 mmol 規(guī)模合成(Dmab脫保護(hù)以 0.05 mmol 的規(guī)模進(jìn)行,,首尾環(huán)化以 0.025 mmol 的規(guī)模進(jìn)行),。使用 DMF 中的吡咯烷進(jìn)行脫保護(hù)。偶聯(lián)反應(yīng)在5倍 Fmoc 氨基酸,、DIC和Oxyma Pure(CarboMAX)5中進(jìn)行,。Fmoc-Glu-ODmab 用做第一個(gè)氨基酸(Q)。使用肼的 DMF 溶液進(jìn)行 ODmab 基團(tuán)的脫保護(hù),。使用肼的 DMF 溶液進(jìn)行 ODmab 基團(tuán)的脫保護(hù),。首尾環(huán)化反應(yīng)使用 DMF 中的 DIC/HOBt 進(jìn)行。在 CEM RazorTM 高通量多肽切割系統(tǒng)中使用 TFA/H2O/TIS/ DODT 進(jìn)行切割,。裂解后用無水乙mi沉淀肽并凍干過夜,。

通過圖片3.png

圖3:Cyclorasin A

 

多肽合成:N-MethylCyclorasinAnalog, cyclo-[WTaR-NMeGly- NMePhe-nal-NMeGly-Fpa-nle-E]

使用 CEM Liberty PRIME 自動(dòng)微波肽合成儀在 Fmoc-Glu (Wang ) -ODmab 樹脂(離子交換容量:0.25 meq/g )上以 0.05 mmol 的 規(guī)模合成(Dmab 脫保護(hù)以 0.05 mmol 規(guī)模進(jìn)行,首尾環(huán)化以 0.025 mmol 的規(guī)模進(jìn)行),。使用 DMF 中的吡咯烷進(jìn)行脫保護(hù),。偶聯(lián)反應(yīng)在5倍 Fmoc 氨基酸、DIC和Oxyma Pure(CarboMAX)5中進(jìn)行,。使用肼的 DMF 溶液進(jìn)行 ODmab 基團(tuán)的脫保護(hù),。首尾環(huán)化反應(yīng)使用 DMF 中的 DIC/HOBt 進(jìn)行。在CEM RazorTM高通量多肽切割系統(tǒng)中使用 TFA/H2O/TIS/DODT 進(jìn)行切割,。裂解后用無水乙mi沉淀肽 并凍干過夜,。

通過圖片4.png

圖4:N-Methyl Cyclorain Analog

 

多肽合成:Poly N-Methyl Peptide, cyclo-[KA-NMeIle-NMeGly-NMeLeu-A-NMeGly-NMeGly-E]

使 用 CEM Liberty PRIME 自 動(dòng) 微 波 肽 合 成 儀 在 Fmoc-Glu (Wang )-ODmab 樹脂(離子交換容量:0.25 meq/g )上以 0.1 mmol 的規(guī)模合成(Dmab 脫保護(hù)以 0.05 mmol 規(guī)模進(jìn)行,首尾環(huán)化以 0.025 mmol 的規(guī)模進(jìn)行),。使用 DMF 中的吡咯烷進(jìn)行脫保護(hù) ,。偶 聯(lián) 反 應(yīng) 在 5 倍 Fmoc 氨 基 酸 、 DIC和Oxyma Pure(CarboMAX)5中進(jìn)行,。使用肼的 DMF 溶液進(jìn)行 ODmab 基團(tuán)的脫保護(hù),。首尾環(huán)化反應(yīng)使用 DMF 中的 DIC/HOBt 進(jìn)行,。在 CEM RazorTM 高通量多肽切割系統(tǒng)中使用 TFA/H2O/TIS/DODT 進(jìn)行切割。裂解后用無水乙mi沉淀肽并凍干過夜,。

通過圖片5.png

圖5: Poly N-Methyl Peptide

多肽分析

在配備有 PDA 檢測(cè)器的 Waters Acquity UPLC 系統(tǒng)上分析肽,, 該 檢 測(cè) 器 配 備 Acquity UPLC BEH C8 柱 (1.7 mm 和 2.1 x 100 mm)。UPLC 系統(tǒng)連接到 Waters 3100 Single Quad MS 用于結(jié)構(gòu)測(cè)定,。在 Waters MassLynx 軟件上進(jìn)行峰分析,。使用 (i) H2O 和 (ii) MeCN 中的 0.05% TFA 梯度洗脫進(jìn)行分離。

 

結(jié)果

在 Liberty Blue 自動(dòng)微波肽合成儀上 CEM 7-mer 的微波增強(qiáng)固相合成產(chǎn)生了純度為 78% 的目標(biāo)肽(圖 6),。

通過圖片6.png

圖6:CEM 7-mer 的UPLC色譜圖

 

在 LibertyBlue 自動(dòng)微波肽合成儀上的 Cyclorasin A的微波增強(qiáng),。

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圖7:Cyclorasin A (Liberty Blue)的UPLC的色譜圖

 

Liberty PRIME 自動(dòng)微波肽合成儀上的 Cyclorasin A 微波增強(qiáng)。

通過圖片8.png

圖8:Cyclorasin A (Liberty PRIME)的UPLC色譜圖

 

Liberty PRIME 自動(dòng)微波肽合成儀上的 Poly N-Methyl Peptide,。

通過圖片9.png

圖9:多聚N-甲基Peptide 的UPLC色譜圖

 

Liberty PRIME 自 動(dòng) 微 波 肽 合 成 儀 上 的 N-Methyl Cyclorasin Analog 的微波增強(qiáng)固相合成產(chǎn)生了純度為 66% 的目標(biāo)肽(圖10),。

通過圖片10.png

圖10:N-甲基 CyclorasinAnalog的UPLC色譜圖

 

結(jié)論

使用自動(dòng)微波增 SPPS 可以快速有效地合成首尾環(huán)肽。此外,,易于使用的 Liberty Blue 和 Liberty PRIME 軟件允許對(duì)肽序列進(jìn)行快速直接的編程,。使用 Liberty Blue 肽合成儀在 2 小時(shí) 13 分鐘內(nèi)合成了純度為 78% 的 7 聚體環(huán)肽。在 Liberty Blue 上在 3 小時(shí) 1 分鐘內(nèi)以高純度 (75%) 合成了 Cyclorasin A 環(huán)肽,。在 Liberty PRIME 上僅用了 2 小時(shí)就合成了相同的肽,,純度很高 (75%),浪費(fèi)大約 100 mL,。在 Liberty PRIME 上,微波增強(qiáng)的 SPPS 可在 2 小時(shí) 5 分鐘內(nèi)以 66% 的純度合成了具有綜合挑戰(zhàn)性的 N-methyl cyclorasin analog 環(huán)肽,。后,,在 Liberty PRIME 上以 73% 的純度在 2 小時(shí) 12 分鐘內(nèi)制備出多聚 N-甲 基化 11 聚體肽。 

 

參考文獻(xiàn)

[1] Upadhyaya, P.;Qian, Z.; Selner, N. G.; Clippinger, S. R.; Wu, Z.; Briesewitz, R.; Pei, D. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 2015, 54 (26), 7602–7606. 

[2] White, A. M.; Craik, D. J. Expert Opin. Drug Discov. 2016, 11 (12), 1151–1163.

[3] Hurtley, S. M. Science. 2018, 361 (6407), 1084.4-1085. (4) Zorzi, A.; Deyle, K.; Heinis, C. Curr. Opin. Chem. Biol. 2017, 38, 24–29. (5) CEM Application Note (AP0124) - “CarboMAX - Enhanced Peptide Coupling at Elevated Temperature.”

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