GPF-DIA和Direct DIA：哪個更適合大規(guī)模蛋白定量,？檢測技術服務詳情介紹

在大規(guī)模dànbáizhì組學研究中,，數(shù)據(jù)獨立采集（DIA, Data-Independent Acquisition）技術因其高通量、高重現(xiàn)性和數(shù)據(jù)完整性,，已成為主流。然而,，DIA的發(fā)展也催生了多種策略,，其中以GPF-DIA（Gas Phase Fractionation DIA）與Direct DIA（直接DIA）zuì為常見。兩者在譜圖庫構建方式,、實驗流程與適用場景上存在顯著差異。本文將系統(tǒng)比較這兩種DIA策略,，幫助科研人員在不同研究需求下作出科學選擇。

一,、什么是GPF-DIA？

GPF-DIA是一種通過氣相分級提升譜圖庫質量的DIA策略,。研究人員將混合樣本在質譜m/z維度進行分段采集（如每次覆蓋一個100–150 m/z的窗口），從而獲得更高的MS/MS覆蓋度,。隨后,，以這些高覆蓋度數(shù)據(jù)構建實驗樣本特異性的DIA譜圖庫,，用于后續(xù)大批量樣本的定量分析。

? GPF-DIA的特點：

• 蛋白鑒定更深：適合發(fā)掘低豐度,、差異性蛋白

• 譜圖庫質量更高：針對目標樣本構建，具有高度代表性

• 定量準確性更優(yōu)：尤其適合機制研究與生物標志物挖掘

• 實驗成本較高：需額外運行多個氣相分級樣本,，增加儀器時間與樣本消耗

二,、什么是Direct DIA？

Direct DIA則wánquán跳過譜圖庫構建步驟,，直接利用軟件算法（如DIA-NN,、Spectronaut）從原始DIA數(shù)據(jù)中進行蛋白鑒定與定量,。這種“譜庫自由”方式顯著簡化了實驗流程，并具備良好的通量擴展性,。

? Direct DIA的特點：

• 流程更簡潔：無需分級與譜圖庫采集

• 更適合高通量項目：如臨床隊列研究,、藥物篩選等

• 對樣本量要求低：適合樣本寶貴或難以批量制備的項目

• 鑒定深度略遜：對極低豐度蛋白的識別能力有限

三,、GPF-DIA vs Direct DIA：核心指標對比

四,、如何選擇更適合的DIA策略,？

選擇DIA策略的核心在于研究目標與資源配置：

• 如果您關注的是蛋白鑒定深度與定量精度，如疾病機制解析,、功能蛋白篩選或圖譜構建，GPF-DIA更具優(yōu)勢,。

• 若研究更強調樣本通量,、數(shù)據(jù)處理效率與自動化能力,，如大型臨床樣本隊列、藥效評估或多時間點干預實驗,，Direct DIA是更高效的選擇,。

科學地根據(jù)項目需求選用DIA策略,，不僅提升數(shù)據(jù)質量，也能顯著優(yōu)化成本效益比,。百泰派克生物科技提供多樣化DIA策略支持,，滿足從基礎科研到臨床轉化的廣泛需求,。不論您的研究聚焦于生物機制探索，還是臨床應用開發(fā),，我們都可為您提供定制化蛋白組學解決方案。了解更多DIA策略選擇建議或獲取典型項目案例,，歡迎聯(lián)系我們,！

百泰派克生物科技特色項目

一,、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務,，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析,，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,，對蛋白序列進行分析,。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上先進的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響,。

二,、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學,、靶向dànbáizhì組學、多肽組學,、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,，助力微量樣本蛋白組學,、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,，適用于分析組織,、細胞,、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高,，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白,，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三,、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統(tǒng)進行單細胞質譜流式技術分析,，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子,，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜,，zuì后將原子質量譜數(shù)據(jù)轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量,。

※服務優(yōu)勢：

1.技術先進,，填補技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題,?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征,，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大,，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞,，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,，在臨床診斷,、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景,；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外,，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾,；

③可檢測細胞存活率,、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等,。

四,、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案,。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量,。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥,、免疫疾病及傳染病的解決方案,，深入挖掘未知的靶標,。

五,、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術,，MALDI TOF，高效色譜分離技術,，提供一系列完善的生物藥物分析方案,，從dànbáizhì、多肽,、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,，到產品變異性和純度分析,。旨在提供優(yōu)質生物藥物分析服務，幫助生物醫(yī)藥生產商提高生物藥物品質,。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優(yōu)質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務,。公司實驗室遵循NMPA、ICH,、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則,，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系,，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,，設備定期計量/期間核查,，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務,，支持新藥研發(fā),、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系,，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可,，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質量研究服務,；

3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學,、多肽組學、代謝組學,、生物藥物表征,、單細胞分析,、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等,；

4.七大質量控制檢測平臺,，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業(yè),，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質的生物質譜分析服務!

GPF-DIA和Direct DIA：哪個更適合大規(guī)模蛋白定量,？檢測技術服務詳情介紹