生命起源于海洋,,地球上的氧氣約有一半由海洋光合作用所產(chǎn)生,,而葉綠素是光合作用光能捕捉與化學(xué)能產(chǎn)生所需的關(guān)鍵分子,,光合生命進(jìn)化出復(fù)雜的捕光機(jī)制,。
海洋真核藻類在大小,、顏色和形態(tài)上各不相同,,但它們的捕光色素-蛋白復(fù)合體中大多采用了一種陸地植物所缺乏的,、名為葉綠素c的分子,。葉綠素c是一類在海洋浮游生物中廣泛存在的葉綠素,,它的吸收光譜主要集中在藍(lán)綠色光區(qū)域,能夠吸收波長(zhǎng)較短的光線,,因此在海洋中發(fā)揮了重要的作用,。
2023年11月24-28日,青島召開的全國(guó)海洋微生物學(xué)學(xué)術(shù)研討會(huì)上,,來(lái)自西湖大學(xué)的李小波團(tuán)隊(duì)發(fā)表了他在藻類光合作用的代謝合成酶(包括葉綠素,、類胡蘿卜素),以及在缺氮等逆境條件下,,這些色素含量和組成的變化,。
▲藻華漩渦。2021年南大西洋的浮游植物藻華漩渦 (綠色和淺藍(lán)色),。
早在2023年10月,,李小波團(tuán)隊(duì)就在Science發(fā)表題為“A chlorophyll c synthase widely co-opted by phytoplankton”(一種被浮游植物廣泛選擇的葉綠素c合成酶)的文章,揭示了葉綠素c合成酶編碼基因及該酶作用機(jī)制,,挖掘了葉綠素c的生理功能,,討論了該基因的演化形成與轉(zhuǎn)移。
▲從藻類中提取的各類色素(作者:李小波教授研究團(tuán)隊(duì))
綠藻在缺氮脅迫下的光合適應(yīng) /
萊茵衣藻
萊茵衣藻,,是一種單細(xì)胞藻類,,在缺氮條件下,,氮轉(zhuǎn)運(yùn)能力上調(diào),甘油三酯等脂質(zhì)積累,,可以作為生物能源的前體,,為了持續(xù)產(chǎn)生甘油三酯,需要有持續(xù)的光合作用,,但是缺氮會(huì)導(dǎo)致黃化,,葉綠素降低及能量猝滅。了解這其中的機(jī)制后,,就可以讓藻類在逆境條件下繼續(xù)光合作用,,把能量保持在特定的產(chǎn)物中,來(lái)保持產(chǎn)量,。
為了尋找這個(gè)過(guò)程中的基因,,因?yàn)槭菃伪扼w,,通過(guò)隨機(jī)插入突變,,不需要自交就可以看表型,將抗性基因的DNA轉(zhuǎn)入到萊茵衣藻,,在抗性培養(yǎng)基上做篩選,,產(chǎn)生76000個(gè)突變體。
PIXL&ROTOR+ /
自動(dòng)化
人工進(jìn)行篩選肯定不現(xiàn)實(shí),,為了提高效率,,采用自動(dòng)化的方式來(lái)識(shí)別和篩選菌落,并進(jìn)行隨機(jī)挑取菌落,,將其接種成384陣列,,為了維持這個(gè)文庫(kù),使用384針在瓊脂之間復(fù)制,,可以保存文庫(kù),,也可以將文庫(kù)復(fù)制到篩選平板上,看表型變化,,記錄突變體陣列的大小,、顏色、熒光等表型,。
▲ROTOR+高通量菌落篩選可短時(shí)間內(nèi)操作酵母,、真菌、細(xì)菌,、微藻的高密度陣列,,使用無(wú)菌復(fù)制針板,進(jìn)行84,、384,、1536、6144密度的高通量篩選,不同密度的文庫(kù)保存等,,PILX自動(dòng)挑菌設(shè)備采用Pinpoint挑取技術(shù),,通過(guò)超聲波自動(dòng)探測(cè)瓊脂高度,對(duì)每次挑菌進(jìn)行瓊脂表面壓力探測(cè)挑取隨機(jī)菌落,。
實(shí)驗(yàn)篩選了384密度菌落陣列,,大約有七萬(wàn)多個(gè)突變,可以覆蓋微藻一萬(wàn)多個(gè)基因和絕大多數(shù)非必須基因,,獲得大約500個(gè)突變體有表型特異性,,用于后期研究。
結(jié)果顯示有的黃化慢一點(diǎn),,一直保持綠色,,有的黃化快一點(diǎn),還有能量猝滅,,很多突變體無(wú)法在缺氮的培養(yǎng)基上生存,,有些持續(xù)保持綠色的細(xì)胞,可能黃化對(duì)細(xì)胞的生存有保護(hù)作用,,從突變體中鑒定了很多基因,,一部分跟電子傳遞鏈相關(guān),也有只知道是個(gè)激酶,,但作用途徑不清楚,。
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