科研狗起早摸黑做了幾天分子克隆實驗,
本想著拖了好幾個星期的實驗終于要做完啦,!瞬間覺得自己棒棒噠,!
但是最后看實驗結(jié)果!??! 原地裂開
排查實驗試劑,沒問題,!
排查實驗操作,,沒問題!
排查儀器,,沒問題,!
那么問題到底出在哪呢?
其實問題有可能出現(xiàn)在樣本保存與前處理步驟中哦,。生物樣本中的核酸(DNA/RNA)會因為核酸酶,、溫度、pH值,、微生物,、自身化學(xué)性質(zhì)等因素而發(fā)生被動或主動降解,從而導(dǎo)致分子實驗結(jié)果不盡人意,。目前針對不同科研的需求,,更多的樣本保存方式也相繼問世,小愛為大家匯總了各類樣本保存的步驟,、注意事項,、以及樣本保存耗材或保存液的推薦。
一,、實驗樣本主要類型:
分子實驗中主要的樣本類型有:純核酸類,、組織類、細胞類及環(huán)境類,。不同樣本具有不同的保存方式以及操作注意事項,。
圖1 常見的實驗樣本類型
表1 不同類型樣本核酸保存方法及穩(wěn)定性
類型 | 檢測目標(biāo) | 穩(wěn)定性及保存注意事項 |
組織 | DNA/RNA | 新鮮組織應(yīng)盡快加入到含有核酸保護劑的管中,,放置于冰上運輸至實驗室;石蠟包埋組織中的核酸在室溫即可保持穩(wěn)定,。 |
血液 | 全血的DNA/RNA | DNA:全血室溫可穩(wěn)定保存24h,,2-8℃穩(wěn)定保存72h,-20℃可長期保存 RNA:室溫不建議保存,,樣本應(yīng)至于含有核酸穩(wěn)定劑的管中,,放置于冰上運輸至實驗室。 |
血清/血漿的cfDNA/ctDNA/病毒DNA/病毒RNA | cfDNA:2-8℃,,8h內(nèi)分離血漿,,-20℃或更低溫度穩(wěn)定保存; ctDNA:抽血后4-5h內(nèi)即需要完成核酸提??; 病毒DNA:2-8℃穩(wěn)定一周,-20℃穩(wěn)定一年以上,; 病毒RNA:2-8℃,,6h內(nèi)分離血漿,-20℃或更低溫度保存 | |
干血片的DNA | 室溫穩(wěn)定保存19個月,,需要注意防潮,。 | |
細胞 | DNA/RNA | 37℃保持細胞活力即可。 |
骨髓 | RNA | 必須在采集后立即至于RNA穩(wěn)定劑中,,或者于液氮中速凍 |
胸水,、腦水、腦脊液等其他生物體液樣本 | DNA | 低溫(2-8℃)保存,,盡快提取檢測,。 |
二、實驗樣本前處理步驟及注意事項
1,、組織樣本:
塊狀組織樣本短時間內(nèi)無法充分裂解,,一般需要進行樣本預(yù)處理。組織取材在組織離體30min內(nèi)完成,,取樣的動作要盡量快速利索,,將組織按任一方向切成黃豆粒大小。
組織DNA提?。?/strong>新鮮組織樣本用生理鹽水清洗2次,,即刻進行實驗,。如若不立即進行實驗,,可用液氮速凍,-80℃凍存,。
組織RNA提?。?/strong>將動物或植物組織切成小塊,,在液氮中磨碎或用勻漿器勻漿處理,快速轉(zhuǎn)入裝有1mL Trizol(abs60154)的2mL離心管中,立即進行實驗,。若后期再進行實驗,,盡量保存時將樣本浸入RNA樣品保存液(abs9268)后置4℃冰箱過夜(4℃過夜是必需的,這樣可使RNA樣品保存液滲入到組織中),,然后轉(zhuǎn)移到-20℃冰箱,。或者液氮研磨組織,,加入Trizol,,放入-80℃保存。
圖2 組織樣本RNA提取流程圖
2,、細胞樣本:
DNA提?。?/strong>細胞收集沉淀后,進行液氮速凍,,-80℃保存,。
RNA提取:
1)貼壁細胞:吸盡培養(yǎng)液,,每10cm2培養(yǎng)面積加入1mL Trizol,,用加樣器吹打數(shù)次,以確保細胞裂解,,然后轉(zhuǎn)移至離心管中,。注:貼壁細胞Trizol的使用量應(yīng)由培養(yǎng)皿表面積決定,而非由細胞數(shù)目決定,。Trizol量不足可能導(dǎo)致提取的RNA中有DNA污染,;
2)懸浮細胞:離心收集細胞,吸盡液體,,每5-10×106動植物或酵母細胞,,或每1×107細菌細胞加入1mL Trizol,用加樣器吹打,,使其裂解,,然后轉(zhuǎn)移至離心管中。 注:添加Trizol前切勿洗滌細胞,,以免RNA降解,。必要時可以用勻漿器來裂解某些細菌或者酵母細胞。若后期再進行RNA提取實驗,,細胞用液氮速凍,,-80℃凍存。
3、血液樣本:
采用含有抗凝劑的真空采血管保存即可,。但采血管中的抗凝劑種類多樣,,抗凝劑的種類也會直接影響后續(xù)檢測結(jié)果,面對這么多的采血管如何進行選擇,?我們建議使用EDTA或枸櫞酸鈉抗凝管,,不建議使用肝素抗凝管(因肝素在后面的核酸提取過程中很難去除,且肝素對PCR反應(yīng)有很強的抑制作用,,因此不建議使用肝素抗凝管),。采集完血液,顛倒混勻備用,。另外冰凍血液溶解過程中會有破碎的細胞釋放RNA酶,,因此在冰凍前加入Trizol,切勿直接凍存新鮮血液,,保存好的血液應(yīng)避免反復(fù)凍融,。
4、血清/血漿樣本:
全血不加抗凝劑分離的上清是血清,,加入抗凝劑分離的上清是血漿,。取全血后,靜止1-2h,,置于離心機3000rpm離心15min即可獲得血清或血漿,。
三、樣本前處理利器—RNA樣品保存液(abs9268)
RNA樣品保存液是一種無毒的可直接使用的樣品儲存液,,能使細胞內(nèi)的RNA與RNA酶分離,,防止樣本中RNA表達譜發(fā)生變化。加入樣本保存液的樣本中RNA在室溫可以保存7天,,4℃可以保存4周,,-20℃、-80℃標(biāo)本可以長期保存,。在RNA樣品保存液中保存的標(biāo)本,,反復(fù)凍融至室溫20次不影響RNA的質(zhì)量。
操作步驟:
1)計算保存液用量:根據(jù)要保存的各樣本的體積,,計算出所需RNA樣品保存液用量,;a:RNA樣品保存液的用量應(yīng)當(dāng)是組織體積的10倍(100mg組織約用1mL RNA樣品保存液);b:離心收集2×107細胞RNA樣品保存液的用量是1mL,;
2)分裝:將RNA樣品保存液按需要量分裝入自備保存管中,;
3)切片:快速將較大的組織切成厚度<0.5cm的任意片狀,較小的組織直接取下,,立即浸入RNA樣品保存液中,;
4)保存:保存時先將樣本浸入RNA樣品保存液后置4℃冰箱過夜,然后轉(zhuǎn)移到-20℃冰箱或繼續(xù)轉(zhuǎn)移至-80℃冰箱。
四,、本期小愛產(chǎn)品推薦
貨號 | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 |
abs9268 | RNA樣品保存液 | 100mL |
abs9474 | 組織保存液 | 100mL |
abs60150 | RNA酶抑制劑 | 2000U |
abs60154 | Trizol | 100mL |
abs9259 | 無酶無菌水(DEPC水) | 500mL |
Absin特色產(chǎn)品線:
WB相關(guān):ECL發(fā)光液、預(yù)染marker,、預(yù)制膠,;IHC相關(guān):二抗試劑盒、組化筆,;IP/CoIP試劑盒,;激動劑/抑制劑;血清,、BSA,、蛋白酶K、CTB,、TTX,、CEE;凋亡試劑盒,;呼吸爆發(fā)試劑盒,;ELISA試劑盒;重組蛋白,;抗體: 二抗,、標(biāo)簽抗體、對照抗體,;定制服務(wù)(抗體/多肽/蛋白/標(biāo)記/檢測)...
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