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SNP檢測技術(shù)服務(wù)|實驗技術(shù)服務(wù)

時間:2015/7/1閱讀:231
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關(guān)鍵詞:SNP檢測技術(shù)服務(wù)|實驗技術(shù)服務(wù)
簡介:世界*品牌SNP檢測技術(shù)服務(wù)|實驗技術(shù)服務(wù)原裝,,質(zhì)量保證,*。
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測序?qū)嶒灹鞒蹋?br>該系統(tǒng)采用ABI 3730xl DNA測序儀,,分型準(zhǔn)確率≧99.9%,,分型成功率≧95%。和PCR重測序一樣,,SNaPshot分型也是SNP檢測的金標(biāo)準(zhǔn),。適合5-12個及以上的SNP位點的檢測。該檢測方法的主要原理為單堿基延伸技術(shù),。即在緊鄰SNP位點的地方設(shè)計引物,,反應(yīng)時加入SNP位點引物,擴增出的帶有SNP位點的PCR產(chǎn)物,,帶熒光標(biāo)記的ddNTP,,通過單堿基延伸后引物帶上SNP位點堿基相關(guān)的熒光,,隨后將反應(yīng)產(chǎn)物在ABI 3730xl核酸檢測儀上分析后,就能得到SNP位點的信息,。該方法一個反應(yīng)就能檢測5-12個SNP位點,,在充分利用測序法準(zhǔn)確直觀的優(yōu)點的同時,增加了一次反應(yīng)檢測的位點數(shù),,極大地降低了實驗成本,。
*檢測結(jié)果準(zhǔn)確率在99.9%以上,和測序法一樣是SNP檢測的金標(biāo)準(zhǔn),。
*一次檢測5-12個位點,96個樣品,,適合中到大型SNP分型項目,。
*應(yīng)用靈活??梢愿鶕?jù)需要靈活定制實驗方案,,檢測基因組中任意位置的SNP位點,甚至可以將不同物種的*基因組放在一起進行檢測,。
*檢測費用相對較低,。
CR-測序法:
zui經(jīng)典的方法,通過PCR擴增包含SNP位點的片段,,測序獲得SNP位點信息,,適于調(diào)查未知SNP位點和連續(xù)分布(1kb以內(nèi))的SNP位點信息。
PCR-限制性酶切,;
如果某個SNP位點恰好是限制性酶切位點,,則通過PCR酶切再結(jié)合電泳分析不失為一種簡單經(jīng)濟的區(qū)分方法,適于單個的SNP位點分析,。
連接酶檢測反應(yīng)(LDR)分型方法:
連接酶只能連接與模板*互補的兩個片段,,利用連接酶這一特性,通過對需檢測SNP位點上下游設(shè)計特異性標(biāo)記探針,在連接酶的作用下,當(dāng)特異性的寡核苷酸探針與互補靶序列DNA*配對時連接反應(yīng)得以順利進行,若寡核苷酸探針與其不*配對,則連接反應(yīng)不能進行,。zui后通過測序儀檢測標(biāo)記的寡核苷酸探針,,得到分型結(jié)果,是一種簡單的分型方法,,適于樣本量和位點數(shù)目都不大的SNP分析,。
HRM:
用熒光定量PCR中的染料法做出的高分辨率溶解曲線,區(qū)分只有單一堿基不同的PCR擴增片段,,只能在溫控均一度在±0.1℃的儀器中使用,。成本低,適合少數(shù)位點多樣品的SNP掃描,。
Taqman 探針法
應(yīng)用ABI7900,、ABI 7500型實時熒光定量PCR儀,,采用ABI合成探針或國產(chǎn)探針,完成SNP的檢測分析,,適用于位點少,,樣本通量高的檢測。
焦磷酸測序( Pyrosequencing )
應(yīng)用Qiagen公司PyroMark Q96 ID平臺,,可定量等位基因,,即使是低頻率等位基因;同時可檢測未知突變,;不同的應(yīng)用實驗可同時在一次運行中實現(xiàn),;
質(zhì)譜法
Sequnom質(zhì)譜法將穩(wěn)健的單堿基引物延伸反應(yīng)與靈敏可靠的MALDI-TOF質(zhì)譜檢測的優(yōu)點相結(jié)合,提供了高靈敏性低成本的SNP檢測服務(wù),。該檢測服務(wù)采用專業(yè)的引物設(shè)計和基因分型軟件,,可對95%以上已被證實的SNP進行實驗設(shè)計。一張芯片可平行完成384個樣本的實驗,,單個wellzui高可達40重反應(yīng),。
試驗設(shè)計,包括擴增區(qū)選擇和引物設(shè)計
試驗條件優(yōu)化以及驗證
高通量PCR擴增,,產(chǎn)物純化以及雙向DNA測序
測序結(jié)果分析(軟件和人工),,SNP位點的發(fā)現(xiàn).

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