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多肽合成技術(shù)服務(wù)|實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)

時(shí)間:2015/5/15閱讀:244
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測(cè)序?qū)嶒?yàn)流程:
多肽是一種與生物體內(nèi)各種細(xì)胞功能都相關(guān)的生物活性物質(zhì),,它的分子結(jié)構(gòu)介于氨基酸和蛋白質(zhì)之間,是由多種氨基酸按照一定的排列順序通過肽鍵結(jié)合而成的化合物,。多肽是涉及生物體內(nèi)各種細(xì)胞功能的生物活性物質(zhì)的總稱,,常常被應(yīng)用于功能分析、抗體研究,、尤其是藥物研發(fā)等領(lǐng)域,。
具體合成由下列幾個(gè)循環(huán)組成:
1) 去保護(hù):Fmoc保護(hù)的柱子和單體必須用一種堿性溶劑(piperidine)去 除氨基的保護(hù)基團(tuán)。
2) 激活和交聯(lián):下一個(gè)氨基酸的羧基被一種活化劑所活化,?;罨膯误w與游離的氨基反應(yīng)交聯(lián),形成肽鍵,。在此步驟使用大量的超濃度試劑驅(qū)使反應(yīng)完成,。循環(huán):這兩步反應(yīng)反復(fù)循環(huán)直到合成完成。
3) 洗脫和脫保護(hù):多肽從柱上洗脫下來,,其保護(hù)基團(tuán)被一種脫保護(hù)劑(TFA) 洗脫和脫保護(hù),。
試劑檢測(cè):沒有選購在線檢測(cè)附件的多肽合成儀用戶,也可以采用試劑檢測(cè)方法做基本的耦合效果測(cè)定實(shí)驗(yàn),。
固相多肽合成中,,主要是通過檢測(cè)樹脂上游離氨基來判斷連接效率,檢測(cè)方法稱為Kaiser方法,,其檢測(cè)結(jié)果,,如果有游離氨基的時(shí)候,顯示蘭色,,或紅褐色(pro,,ser,,His)。
Kaiser試劑包括:A,,6% 茚三酮的乙醇溶液,;B,80% 苯酚的乙醇溶液,;C,,2% 0.001M KCN的吡啶溶液
配制中的吡啶需要經(jīng)過茚三酮處理后,重蒸后再使用,。檢測(cè)過程,,取少量樹脂,加入A,,B,,C各2-3滴,100℃下加熱1-2min,,如果溶液有蘭色,,或樹脂出現(xiàn)蘭色,紅褐色,,表明還有游離氨基,,否則說明連接*。
其它檢測(cè)游離氨基的方法:三硝基苯磺酸法,,苦味酸法,,溴芬蘭法等.
氨基酸保護(hù)基 
20種常見氨基酸,根據(jù)側(cè)鏈可以分為幾類:脂肪族氨基酸(Ala,,Gly,Val,,Leu,,Ile,),,芳香族氨基酸(Phe,,Tyr,Trp,,His),,酰胺或羧基側(cè)鏈氨基酸(Asp,Glu,,Asn,,Gln),堿性側(cè)鏈氨基酸(Lys,,Arg),,含硫氨基酸(Cys,,Met),含醇氨基酸(Ser,,Thr),,亞氨型基酸(Pro)。多肽化學(xué)合成中氨基酸的保護(hù)非常關(guān)鍵,,直接決定了合成能夠成功的關(guān)鍵,。因?yàn)槌R姷?0中氨基酸中有很多都是帶有活性側(cè)鏈的,需要進(jìn)行保護(hù),,一般要求,,這些保護(hù)基在合成過程中穩(wěn)定,無副反應(yīng),,合成結(jié)束后可以*定量的脫除,。合成中需要進(jìn)行保護(hù)的氨基酸包括:Cys,Asp,,Glu,,His,Lys,,Asn,,Gln,Arg,,Ser,,Thr,Trp,,Tyr,。需要進(jìn)行保護(hù)的基團(tuán):羥基,羧基,,巰基,,氨基,酰胺基,,胍基,,吲哚,咪唑等,。其中Trp也可以不保護(hù),,因?yàn)檫胚嵝再|(zhì)比較穩(wěn)定。當(dāng)然在特殊的情況下,,有些氨基酸也可以不保護(hù),,象,Asn,Gln ,,Thr,,Tyr。
多肽縮合試劑 
目前多肽合成中,,主要采用羧基活化方法來完成接肽反應(yīng),,zui早使用的是將氨基酸活化為酰氯,疊氮,,對(duì)稱酸酐以及混合酸酐的方法,,但是由于這些條件下,存在氨基酸消旋,,以及反應(yīng)試劑危險(xiǎn)以及制備比較復(fù)雜,,逐漸被后來的縮合試劑取代,按照其結(jié)構(gòu)可以分為兩種:縮合試劑主要有:碳二亞胺型,,鎓鹽型(Uronium),。 
液相多肽合成(solution phase synthesis) 
液相多肽合成現(xiàn)在仍然廣泛的使用,在合成短肽和多肽片段上具有合成規(guī)模大,,合成成本低的顯著優(yōu)點(diǎn),,而且由于是在均相中進(jìn)行反應(yīng),可以選擇的反應(yīng)條件更加豐富,,象一些催化氫化,,堿性水解等條件,都可以使用,,這在固相中,,使用卻由于反應(yīng)效率低,以及副反應(yīng)等原因,,無法應(yīng)用,。液相多肽合成中主要采用BOC和Z兩種反應(yīng)策略。 
合成多肽分析鑒定方法 
多肽的分析鑒定方法有多肽一級(jí)結(jié)構(gòu),,二級(jí)結(jié)構(gòu)鑒定,,多肽一級(jí)結(jié)構(gòu)包括:質(zhì)譜分析,氨基酸組成分析,,氨基酸序列分析,。二級(jí)結(jié)構(gòu)包括:圓二色譜(CD),,NMR,,X-衍射等方法。 
純度分析 
多肽的純度分析,,一般都采用HPLC進(jìn)行分析,,選擇RP-C18,粒徑5μm,孔徑300A,,4.6×150mm,,流動(dòng)相:A,0.1% TFA/H2O,;B,,0.1% TFA/ACN,洗脫梯度,,5%B--65%B,,時(shí)間30min。也有些多肽,,特別是短肽,,由于親水性強(qiáng),在C18上保留很弱,,需要改變條件,,這里主要有兩種方法:一個(gè)改變分析梯度,可以將起始梯度改為2%,,等度或小梯度洗脫,;另外一個(gè)方法是在流動(dòng)相中加入強(qiáng)離子對(duì)試劑,如七氟丁酸,,十八烷基磺酸鈉等,。 
質(zhì)譜分析 
質(zhì)譜分析的目的主要是確證分子量,當(dāng)然采用MS/MS可以部分的了解多肽序列的信息,,但是這個(gè)需要比較全的數(shù)據(jù)庫作為基礎(chǔ),,分析才能比較準(zhǔn)確。由于多肽性質(zhì)不穩(wěn)定,,需要采用軟電離技術(shù),,目前多肽分析主要使用了電噴霧(ESI-MS),基質(zhì)輔助激光解吸(MALDI-MS),。其中ESI-MS通常會(huì)給出多電荷峰,,電荷數(shù)目和多肽序列上氨基,胍基,,咪唑基的數(shù)目有關(guān),,因此,經(jīng)常給出了雙電荷,,三電荷等離子峰,。MALDI-MS可以分析蛋白大分子,而且通常情況下很少帶多電荷,,因此數(shù)據(jù)直接對(duì)應(yīng)了分子離子峰,,容易分析,。此外,通常在分析長肽或蛋白過程中,,需要添加NH4,,Na,K等離子,,提高靈敏度,,所以一般在 MS中出現(xiàn)一組峰,分別對(duì)應(yīng):(M+H)+,,(M+NH4)+,,(M+Na)+,(M+K)+,。 
氨基酸組成分析 
氨基酸組成分析一般需要產(chǎn)品的純度較高,,它可以給出多肽中氨基酸的種類,數(shù)目,。分析過程首先通過酸水解破壞肽鍵,,典型酸水解的條件是:真空條件下,110℃,,用6M鹽酸水解16至72小時(shí),。酸水解雖然很有用,但酸水解條件下不能獲得完整的氨基酸分析,,因?yàn)樘於0泛凸劝滨0返膫?cè)鏈含有酰胺鍵,,用于切斷蛋白質(zhì)肽鍵的酸也可以將天冬酰胺轉(zhuǎn)換為天冬氨酸,谷氨酰胺轉(zhuǎn)換為谷氨酸,。由于水解溫度比較高,,色氨酸的吲哚環(huán)容易被空氣氧化,即使在密封的管中,,色氨酸的吲哚環(huán)也幾乎都被破壞了,。因此蛋白質(zhì)的色氨酸含量往往是通過它的紫外吸收光譜估計(jì)的,也可以通過堿水解分析色氨酸的含量,。半胱氨酸在酸水解中也不能測(cè)定,,要測(cè)量需要在蛋白質(zhì)水解之前進(jìn)行氧化或羧甲基化,形成的衍生物在酸水解之后才能定量,。
多肽要在幾分鐘內(nèi)高度被分析,。
HPLC分兩類:離子交換和反相。離子交換HPLC依靠多肽和固相間的直接電荷相互作用,。柱子在一定PH范圍帶有特定電荷衍變成一種離子體,,而多肽或多肽混合物,由其氨基酸組成表現(xiàn)出相反電荷,。 分離是一種電荷相互作用,,通過可變PH, 離子強(qiáng)度,, 或兩者洗脫出多肽,,通常,先用低離子強(qiáng)度的溶液,,以后逐漸加強(qiáng)或一步一步加強(qiáng),,直到多肽從柱中洗脫出。離子交換分離的一個(gè)例子使用強(qiáng)陽離子交換柱,。如sulfoethylaspartimide通過酸性PH中帶正電來分離,。
反相HPLC條件與正常層析正相反。多肽通過疏水作用連到柱上,,用降低離子強(qiáng)度洗脫,,如增加洗脫劑的疏水性。通常柱子由共價(jià)吸附到硅上的碳?xì)渫殒湗?gòu)成,,這種鏈長度為G4-G8碳原子,。由于洗脫是一種疏水作用。大的疏水肽用短鏈柱洗脫好,。 然而,,總體實(shí)踐中, 這兩類柱互變無多少顯著差別,,別類載體由碳水化合物構(gòu)成,, 比如苯基。
典型的操作常由兩綬沖劑組成,,0.1%TFA-H2o和80% acetonitrile0.1%TFA--H2o稀acetonitrile,。用線型梯變以每分鐘0.5%到1.0%改變的速度混合。常見分析和純化用柱為4.6×250mm(3-10μ m)和22×250mm(10μ m). 如果用徑向填柱,,那么大小是8×100(3-10μm)和25×250mm(10μ m),。
大量各種緩沖劑含許多不同試劑,比如heptafluorobutyric酸,,0.1%磷酸,,稀He formic酸(5-6%, pH2-4), 10-100mM NH4HCO3,醋酸鈉/氨,TFA/TEA,,磷酸鈉或鉀,,異戊酚。這樣許多不同組合可形成緩沖劑,,但要注意一點(diǎn):硅反相柱料不能長時(shí)間暴露于高pH,,甚至微堿pH,因?yàn)檫@樣會(huì)破壞柱子,。

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