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多肽合成服務(wù)|實驗技術(shù)服務(wù)

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測序?qū)嶒灹鞒蹋?br>多肽是一種與生物體內(nèi)各種細胞功能都相關(guān)的生物活性物質(zhì),它的分子結(jié)構(gòu)介于氨基酸和蛋白質(zhì)之間,,是由多種氨基酸按照一定的排列順序通過肽鍵結(jié)合而成的化合物,。多肽是涉及生物體內(nèi)各種細胞功能的生物活性物質(zhì)的總稱,常常被應(yīng)用于功能分析,、抗體研究,、尤其是藥物研發(fā)等領(lǐng)域。
具體合成由下列幾個循環(huán)組成:
1) 去保護:Fmoc保護的柱子和單體必須用一種堿性溶劑(piperidine)去 除氨基的保護基團,。
2) 激活和交聯(lián):下一個氨基酸的羧基被一種活化劑所活化,。活化的單體與游離的氨基反應(yīng)交聯(lián),,形成肽鍵,。在此步驟使用大量的超濃度試劑驅(qū)使反應(yīng)完成。循環(huán):這兩步反應(yīng)反復(fù)循環(huán)直到合成完成,。
3) 洗脫和脫保護:多肽從柱上洗脫下來,,其保護基團被一種脫保護劑(TFA) 洗脫和脫保護。
試劑檢測:沒有選購在線檢測附件的多肽合成儀用戶,,也可以采用試劑檢測方法做基本的耦合效果測定實驗,。
固相多肽合成中,主要是通過檢測樹脂上游離氨基來判斷連接效率,,檢測方法稱為Kaiser方法,,其檢測結(jié)果,如果有游離氨基的時候,,顯示蘭色,,或紅褐色(pro,ser,,His),。
Kaiser試劑包括:A,6% 茚三酮的乙醇溶液,;B,,80% 苯酚的乙醇溶液;C,,2% 0.001M KCN的吡啶溶液
配制中的吡啶需要經(jīng)過茚三酮處理后,,重蒸后再使用。檢測過程,,取少量樹脂,,加入A,B,,C各2-3滴,,100℃下加熱1-2min,,如果溶液有蘭色,,或樹脂出現(xiàn)蘭色,,紅褐色,表明還有游離氨基,,否則說明連接*,。
其它檢測游離氨基的方法:三硝基苯磺酸法,苦味酸法,,溴芬蘭法等.
氨基酸保護基 
20種常見氨基酸,,根據(jù)側(cè)鏈可以分為幾類:脂肪族氨基酸(Ala,Gly,,Val,,Leu,Ile,,),,芳香族氨基酸(Phe,Tyr,,Trp,,His),酰胺或羧基側(cè)鏈氨基酸(Asp,,Glu,,Asn,Gln),,堿性側(cè)鏈氨基酸(Lys,,Arg),含硫氨基酸(Cys,,Met),,含醇氨基酸(Ser,Thr),,亞氨型基酸(Pro),。多肽化學(xué)合成中氨基酸的保護非常關(guān)鍵,直接決定了合成能夠成功的關(guān)鍵,。因為常見的20中氨基酸中有很多都是帶有活性側(cè)鏈的,,需要進行保護,一般要求,,這些保護基在合成過程中穩(wěn)定,,無副反應(yīng),合成結(jié)束后可以*定量的脫除,。合成中需要進行保護的氨基酸包括:Cys,,Asp,,Glu,His,,Lys,,Asn,Gln,,Arg,,Ser,Thr,,Trp,,Tyr。需要進行保護的基團:羥基,,羧基,,巰基,氨基,,酰胺基,,胍基,吲哚,,咪唑等,。其中Trp也可以不保護,因為吲哚性質(zhì)比較穩(wěn)定,。當然在特殊的情況下,,有些氨基酸也可以不保護,象,,Asn,,Gln ,Thr,,Tyr,。
多肽縮合試劑 
目前多肽合成中,主要采用羧基活化方法來完成接肽反應(yīng),,zui早使用的是將氨基酸活化為酰氯,,疊氮,對稱酸酐以及混合酸酐的方法,,但是由于這些條件下,,存在氨基酸消旋,以及反應(yīng)試劑危險以及制備比較復(fù)雜,,逐漸被后來的縮合試劑取代,,按照其結(jié)構(gòu)可以分為兩種:縮合試劑主要有:碳二亞胺型,鎓鹽型(Uronium)。 
液相多肽合成(solution phase synthesis) 
液相多肽合成現(xiàn)在仍然廣泛的使用,,在合成短肽和多肽片段上具有合成規(guī)模大,,合成成本低的顯著優(yōu)點,而且由于是在均相中進行反應(yīng),,可以選擇的反應(yīng)條件更加豐富,,象一些催化氫化,堿性水解等條件,,都可以使用,,這在固相中,,使用卻由于反應(yīng)效率低,,以及副反應(yīng)等原因,無法應(yīng)用,。液相多肽合成中主要采用BOC和Z兩種反應(yīng)策略,。 
合成多肽分析鑒定方法 
多肽的分析鑒定方法有多肽一級結(jié)構(gòu),二級結(jié)構(gòu)鑒定,,多肽一級結(jié)構(gòu)包括:質(zhì)譜分析,,氨基酸組成分析,氨基酸序列分析,。二級結(jié)構(gòu)包括:圓二色譜(CD),,NMR,X-衍射等方法,。 
純度分析 
多肽的純度分析,,一般都采用HPLC進行分析,選擇RP-C18,,粒徑5μm,,孔徑300A,4.6×150mm,,流動相:A,,0.1% TFA/H2O;B,,0.1% TFA/ACN,,洗脫梯度,5%B--65%B,,時間30min,。也有些多肽,特別是短肽,,由于親水性強,,在C18上保留很弱,需要改變條件,這里主要有兩種方法:一個改變分析梯度,,可以將起始梯度改為2%,,等度或小梯度洗脫;另外一個方法是在流動相中加入強離子對試劑,,如七氟丁酸,,十八烷基磺酸鈉等。 
質(zhì)譜分析 
質(zhì)譜分析的目的主要是確證分子量,,當然采用MS/MS可以部分的了解多肽序列的信息,,但是這個需要比較全的數(shù)據(jù)庫作為基礎(chǔ),分析才能比較準確,。由于多肽性質(zhì)不穩(wěn)定,,需要采用軟電離技術(shù),目前多肽分析主要使用了電噴霧(ESI-MS),,基質(zhì)輔助激光解吸(MALDI-MS),。其中ESI-MS通常會給出多電荷峰,電荷數(shù)目和多肽序列上氨基,,胍基,,咪唑基的數(shù)目有關(guān),因此,,經(jīng)常給出了雙電荷,,三電荷等離子峰。MALDI-MS可以分析蛋白大分子,,而且通常情況下很少帶多電荷,,因此數(shù)據(jù)直接對應(yīng)了分子離子峰,容易分析,。此外,,通常在分析長肽或蛋白過程中,需要添加NH4,,Na,,K等離子,提高靈敏度,,所以一般在 MS中出現(xiàn)一組峰,,分別對應(yīng):(M+H)+,(M+NH4)+,,(M+Na)+,,(M+K)+。 
氨基酸組成分析 
氨基酸組成分析一般需要產(chǎn)品的純度較高,,它可以給出多肽中氨基酸的種類,,數(shù)目,。分析過程首先通過酸水解破壞肽鍵,典型酸水解的條件是:真空條件下,,110℃,,用6M鹽酸水解16至72小時。酸水解雖然很有用,,但酸水解條件下不能獲得完整的氨基酸分析,,因為天冬酰胺和谷氨酰胺的側(cè)鏈含有酰胺鍵,用于切斷蛋白質(zhì)肽鍵的酸也可以將天冬酰胺轉(zhuǎn)換為天冬氨酸,,谷氨酰胺轉(zhuǎn)換為谷氨酸,。由于水解溫度比較高,色氨酸的吲哚環(huán)容易被空氣氧化,,即使在密封的管中,,色氨酸的吲哚環(huán)也幾乎都被破壞了。因此蛋白質(zhì)的色氨酸含量往往是通過它的紫外吸收光譜估計的,,也可以通過堿水解分析色氨酸的含量,。半胱氨酸在酸水解中也不能測定,,要測量需要在蛋白質(zhì)水解之前進行氧化或羧甲基化,,形成的衍生物在酸水解之后才能定量。
 

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