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半定量RT-PCR|實驗技術(shù)服務(wù)

時間:2015/5/15閱讀:290
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關(guān)鍵詞:半定量RT-PCR|實驗技術(shù)服務(wù)
簡介:世界*品牌半定量RT-PCR|實驗技術(shù)服務(wù)原裝,,質(zhì)量保證,*,。
半定量RT-PCR|實驗技術(shù)服務(wù)——pCzn1質(zhì)粒+Arctic Express宿主菌低溫表達體系,。
我們具備豐富的蛋白表達設(shè)計經(jīng)驗及實驗操作技巧,,承諾客戶不成功不收費,。在獲得重組蛋白產(chǎn)品的同時,,我們也會提供相應(yīng)的原始數(shù)據(jù)和原始圖片,不需要再額外花費精力重復(fù)實驗。另一方面,,我們所有的實驗數(shù)據(jù)真實可信,,我們提供原始的表達菌株和克隆質(zhì)粒,客戶可以依據(jù)我們的實驗報告重復(fù)我們的實驗結(jié)果,。
產(chǎn)品品牌:   http://www.,。,。com/goodsid/fenleiyi/2868603/1.html    
測序?qū)嶒灹鞒蹋?br>RT-PCR將以RNA為模板的cDNA合成同PCR結(jié)合在一起,提供了一種分析基因表達的快速靈敏的方法,。RT-PCR用于對表達信息進行檢測或定量,。另外,這項技術(shù)還可以用來檢測基因表達差異或不必構(gòu)建cDNA文庫克隆cDNA,。RT-PCR比其他包括Northern印跡,、RNase保護分析、原位雜交及S1核酸酶分析在內(nèi)的RNA分析技術(shù),,更靈敏,,更易于操作。
1 樣品RNA的抽提
①取凍存已裂解的細(xì)胞,,室溫放置5分鐘使其*溶解,。
②兩相分離 每1ml的TRIZOL試劑裂解的樣品中加入0.2ml的氯仿,蓋緊管蓋,。手動劇烈振蕩管體15秒后,,15到30℃孵育2到3分鐘。4℃下12000rpm離心15分鐘,。離心后混合液體將分為下層的紅色酚氯仿相,,中間層以及無色水相上層。RNA全部被分配于水相中,。水相上層的體積大約是勻漿時加入的TRIZOL試劑的60%,。
③RNA沉淀 將水相上層轉(zhuǎn)移到一干凈無RNA酶的離心管中。加等體積異丙醇混合以沉淀其中的RNA,,混勻后15到30℃孵育10分鐘后,,于4℃下12000rpm 離心10分鐘。此時離心前不可見的RNA沉淀將在管底部和側(cè)壁上形成膠狀沉淀塊,。
④RNA清洗 移去上清液,,每1mlTRIZOL試劑裂解的樣品中加入至少1ml的75%乙醇(75%乙醇用DEPCH2O配制),清洗RNA沉淀,?;靹蚝螅?℃下7000rpm離心5分鐘,。
⑤RNA干燥 小心吸去大部分乙醇溶液,,使RNA沉淀在室溫空氣中干燥5-10分鐘。
⑥溶解RNA沉淀 溶解RNA時,,先加入無RNA酶的水40μl用槍反復(fù)吹打幾次,,使其*溶解,獲得的RNA溶液保存于-80℃待用,。
2 RNA質(zhì)量檢測
1)紫外吸收法測定
先用稀釋用的TE溶液將分光光度計調(diào)零,。然后取少量RNA溶液用TE稀釋(1:100)后,,讀取其在分光光度計260nm和280nm處的吸收值,測定RNA溶液 濃度和純度,。
① 濃度測定
A260下讀值為1表示40 μg RNA/ml,。樣品RNA濃度(μg/ml)計算公式為:A260 ×稀釋倍數(shù)× 40 μg/ml。具體計算如下:
RNA溶于40 μl DEPC水中,,取5ul,,1:100稀釋至495μl的TE中,測得A260 = 0.21
RNA 濃度= 0.21 ×100 ×40 μg/ml = 840 μg/ml 或 0.84 μg/μl
取5ul用來測量以后,,剩余樣品RNA為35 μl,,剩余RNA總量為:
35 μl × 0.84 μg/μl = 29.4 μg
②純度檢測
RNA溶液的A260/A280的比值即為RNA純度,比值范圍1.8到2.1,。
2)變性瓊脂糖凝膠電泳測定
①制膠
1g瓊脂糖溶于72ml水中,,冷卻至60℃,10 ml的10× MOPS電泳緩沖液和18 ml的37% 甲醛溶液(12.3 M),。
10×MOPS電泳緩沖液
濃度  成分
0.4M  MOPS,,pH 7.0
0.1M  乙酸鈉
0.01M  EDTA
灌制凝膠板,預(yù)留加樣孔至少可以加入25 μl溶液,。膠凝后取下梳子,,將凝膠板放入電泳槽內(nèi),加足量的1×MOPS電泳緩沖液至覆蓋膠面幾個毫米,。
②準(zhǔn)備RNA樣品
取3μgRNA,,加3倍體積的甲醛上樣染液,加EB于甲醛上樣染液中至終濃度為10μg/ml,。加熱至70℃孵育15分鐘使樣品變性。
③電泳
上樣前凝膠須預(yù)電泳5min,,隨后將樣品加入上樣孔,。5–6V/cm電壓下2h,電泳至溴酚蘭指示劑進膠至少2–3cm,。
④紫外透射光下觀察并拍照
28S和18S核糖體RNA的帶非常亮而濃(其大小決定于用于抽提RNA的物種類型),,上面一條帶的密度大約是下面一條帶的2倍。還有可能觀察到一個更小稍微擴散的帶,,它由低分子量的RNA(tRNA和5S核糖體RNA)組成,。在18S和28S核糖體帶之間可以看到一片彌散的EB染色物質(zhì),可能是由mRNA和其它異型RNA組成,。RNA制備過程中如果出現(xiàn)DNA污染,,將會在28S核糖體RNA帶的上面出現(xiàn),即更高分子量的彌散遷移物質(zhì)或者帶,,RNA的降解表現(xiàn)為核糖體RNA帶的彌散,。用數(shù)碼照相機拍下電泳結(jié)果,。
3,待測樣品的待測基因?qū)崟r定量PCR
①所有cDNA樣品分別配置實時定量 PCR反應(yīng)體系。
體系配置如下:
序號  反應(yīng)物  劑量
1  SYBR Green 1 染料   10 ul
2  上游引物  1ul
3  下游引物  1ul
4  dNTP   1ul
5  Taq聚合酶  2ul
6  待測樣品cDNA  5ul
7  ddH2O   30ul
8  總體積  50 ul
輕彈管底將溶液混合,,6000rpm短暫離心,。
②將配制好的PCR反應(yīng)溶液置于Realtime PCR儀上進行PCR擴增反應(yīng)。反應(yīng)條件為:93℃2分鐘預(yù)變性,,然后按93℃ 1分鐘,,55℃1分鐘,72℃1分鐘,,共40做個循環(huán),,zui后72℃7分鐘延伸。
4, 實時定量PCR使用引物列表
引物設(shè)計軟件:Primer Premier 5.0,,并遵循以下原則:引物與模板的序列緊密互補,;引物與引物之間避免形成穩(wěn)定的二聚體或發(fā)夾結(jié)構(gòu);引物不在模板的非目的位點引發(fā)DNA 聚合反應(yīng)(即錯配),。

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