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簡單的質粒DNA提取實驗
在我們的細胞實驗中經常會用到質粒DNA，現在都用劑盒非常方便,，而且菌體培養(yǎng)后,，可以多管濃縮提取，提到的質粒量多,，可以-20℃保存,，以后用于酶切、轉化等實驗,，可以提前跑個膠,，只要不降解，就可以繼續(xù)用,，避免每次要用,，都要培養(yǎng)一遍再提取一遍。
質粒DNA的提取
質粒多為一些雙鏈,、環(huán)狀的DNA分子,，是獨立于細菌染色體之外進行復制和遺傳的輔助性遺傳單位,。質粒是進行分子生物學實驗操作，進行遺傳工程改良物種等工作時MAX主要的DNA載體,。
實驗步驟
1.搖菌培養(yǎng)
1）將鑒定測序正確的克隆菌液涂在LB固體平板,。
2）置于37℃恒溫培養(yǎng)箱，培養(yǎng)12-17h,，待長出菌落,。
3） 滅菌15ml離心管內加入5ml含抗生素的LB液體培養(yǎng)基，編號標記,。
4） 挑取單克隆菌團放置液體培養(yǎng)基,，每個培養(yǎng)基放置1個菌落。
5） 37℃,，180rpm,，振蕩培養(yǎng)過夜。
2.收獲細菌并裂解
1） 離心擴增好的菌液,，按說明書將菌液重懸,，轉入1.5ml離心管中。
2）用質粒小量抽提試劑盒,，按說明書要求提取質粒,。
3） 細菌高速離心1min,*去除上清。
4）加入250ulRB溶液,，振蕩器充分懸浮細菌,。
5）加入250ulLB溶液。立即上下顛倒10次,，使細菌裂解,，室溫，放置2min,。
6）加入250ulNB溶液,。立即上下顛倒10次，使之充分中和,，室溫,，放置2min。
7）室溫,，1500rpm,，高速離心15min。
8）將吸附柱放入收集管內,，離心得到的上清轉移至吸附柱,，室溫，15000rpm，高速離心30s,。
9）棄廢液,，將吸附柱放入收集管，加入700ul WB溶液到吸附柱中,，15000rpm,，高速離心30s。
10）重復上一操作,。
11）將吸附柱放入干凈的1.5ml 離心管中,，加30-50ul預熱的Elution Buffer，室溫,，放置2min,，高速離心1min。
12）樣品進行電泳檢測：1%瓊脂糖凝膠電泳,，上樣量為2ul,，紫外燈下觀察，MAX明亮的帶為超螺旋形式,，可以在一定程度上表明提取質粒的純度,。
3.質粒的純化
1）將之前提取好的質粒放入1.5ml離心管中,，加入1/10體積的3mol/L 無菌乙酸鈉溶液,。
2）加入2倍體積的無水乙醇，放置于-20℃沉淀4-6h或過夜,。
3）4℃,，高速離心機14000rpm，離心20min.
4）棄去上清,，70%乙醇洗2次,。
5）空氣干燥，可置超凈工作臺干燥,。
6）加200ul無菌水溶液干燥后所得沉淀,，即為質粒溶液。
7）紫外分光光度計測量質粒濃度和產量,。
測量OD260和OD280的值：質粒DNA濃度=OD260×50×稀釋倍數（μg/mL）,。
10個常見問題
一.時間控制問題
裂解時間太長，加入溶液P2后裂解時間不應超過5 分鐘,；吸附時間不夠,；溶解時間不夠都會導致質粒DNA提取實驗失敗。
二.大腸桿菌老化
建議涂布平板培養(yǎng)后,，重新挑選新菌落進行液體培養(yǎng),。
三.質粒拷貝數低
由于使用低拷貝數載體引起的質粒DNA 提取量低,，可更換具體相同功能的高拷貝數載體,。
四.溶液使用不當
溶液P2,、P3 在溫度較低時可能出現渾濁，應置于37℃培養(yǎng)箱保溫片刻直至溶解為清亮的溶液,，才能使用,。
五.吸附柱過載
不同產品中吸附柱吸附能力不同，如果需要提取的質粒量很大,，請分多次提取,。若用富集培養(yǎng)基，例如TB 或者 ×YT 菌液體積必須減少,；若質?；蛩拗骶欠浅８叩目截悢祷蛏L率，則需調整LB 培養(yǎng)液體積,。
六.質粒未全部溶解
洗脫溶解質粒時,，可適當加溫或延長溶解時間。
七.乙醇殘留
漂洗液洗滌后應離心盡量去除殘留液體,，樹脂型試劑盒漂洗后應晾干樹脂,，再加入洗脫緩沖液。
八.洗脫液加入位置不正確
洗脫液應加在硅膠膜中心部位以確保洗脫液會*覆蓋硅膠膜的表面達到MAX大洗脫效率,。
九.洗脫液不合適
DNA 只在低鹽溶液中才能被洗脫,。洗脫效率取決于pH 值。MAX大洗脫效率在pH7.0～ 8.5 間,。當用水洗脫時確保其 pH 值在此范圍內,，如果pH 過低可能性導致洗脫量低。洗脫時將滅菌蒸餾水或洗脫緩沖液加暖至 60 ℃后使用有利于提高洗脫效率,。
十.洗脫體積太小
洗脫體積對來回收率有一定影響,。隨著洗脫體積的增大回收率增高，但產品濃度降低,。為了得到較高的回收率可以增大洗脫體積,。