細胞表面蛋白質(zhì)組學分析檢測技術服務詳情介紹

細胞是生命活動的基本單元,，而細胞表面則是其感知,、識別和響應外界環(huán)境的前沿陣地。細胞表面蛋白廣泛參與信號轉(zhuǎn)導,、物質(zhì)轉(zhuǎn)運,、細胞識別和黏附等過程，是連接細胞內(nèi)外環(huán)境的關鍵橋梁,。細胞表面dànbáizhì組學（surface proteomics）可以系統(tǒng)了解這些蛋白在不同生理和病理狀態(tài)下的變化,。通過高通量手段對細胞表面蛋白進行全面鑒定和定量，研究人員能夠深入解析細胞狀態(tài),、識別功能亞群,，并挖掘潛在的干預靶點,。

一、細胞表面蛋白的研究價值

1,、關鍵的細胞功能執(zhí)行者

細胞表面蛋白不僅是細胞與外界環(huán)境的物理接觸點,，更承擔著信息接收與傳遞、細胞間識別,、組織構建與免疫調(diào)控等重要功能,。在發(fā)育、生理穩(wěn)態(tài)與疾病進展中,，其表達譜和功能狀態(tài)常常呈現(xiàn)出高度動態(tài)變化,。

2、多種研究場景的理想靶點

表面蛋白通常具有跨膜結構和胞外可識別區(qū)域,，因此極易成為診斷標志物和干預靶點,。無論是在基礎研究中識別細胞亞型，還是在應用研究中尋找藥物作用位點,，表面蛋白都發(fā)揮著bùkětìdài的作用,。

二、細胞表面蛋白組學的研究策略

1,、富集技術

細胞表面蛋白在全細胞蛋白中比例極低,，且多為疏水性強、跨膜結構復雜的膜蛋白,，因此在進入質(zhì)譜分析前,，必須進行有效的選擇性富集。常用策略包括：

• shēngwùsù化化學標記法：選擇性標記胞外區(qū)域賴氨酸殘基,，通過親和捕獲將表面蛋白從總蛋白中分離,。

• 代謝標記法：通過培養(yǎng)基中的特殊化合物引入可反應基團，間接標記并富集細胞膜表面糖蛋白或其他結構蛋白,。

• 細胞表面剝離法：溫和釋放表面蛋白或片段,，避免胞內(nèi)蛋白污染，適用于對膜完整性要求較高的實驗體系,。

這些方法可根據(jù)樣本類型,、研究目標和質(zhì)譜平臺特性靈活選擇與優(yōu)化。

2,、高分辨率質(zhì)譜

富集后的表面蛋白經(jīng)酶解生成肽段,，隨后進入高分辨率質(zhì)譜平臺進行分析。常用的數(shù)據(jù)采集模式包括DDA（Data Dependent Acquisition）和DIA（Data Independent Acquisition）,，DIA在數(shù)據(jù)完整性和重現(xiàn)性方面具有優(yōu)勢,。在質(zhì)譜識別結果基礎上，結合跨膜結構預測工具（如TMHMM、Phobius）和亞細胞定位數(shù)據(jù)庫注釋,，可以jīngzhǔn篩選真正定位于細胞膜表面的dànbáizhì,，從而提升生物學解釋的可靠性。

3,、數(shù)據(jù)分析策略

細胞表面蛋白組數(shù)據(jù)通常用于：

• 差異表達分析：識別不同條件下特異表達或上調(diào)的表面蛋白,；

• 聚類與分群分析：結合多樣本或多時間點數(shù)據(jù)，劃分功能相近或狀態(tài)相似的細胞亞群,；

• 通路富集與功能注釋：解析表面蛋白所涉及的通路與調(diào)控網(wǎng)絡,，結合已有文獻支持構建調(diào)控模型。

三,、細胞表面蛋白組學的主要應用方向

1,、細胞狀態(tài)表征與亞群識別

不同類型或狀態(tài)的細胞往往具有差異化的表面蛋白表達譜，通過高通量分析可構建表面標志物圖譜,，用于表征細胞功能狀態(tài)、識別稀有亞群或追蹤細胞命運演變,。在干細胞研究,、組織發(fā)育、生物過程動態(tài)監(jiān)測等場景中,，表面蛋白數(shù)據(jù)有助于建立更準確的細胞分類系統(tǒng),，尤其是在缺乏明確轉(zhuǎn)錄標志的體系中，其優(yōu)勢尤為突出,。

2,、信號網(wǎng)絡解析與機制研究

細胞如何感知外界信號、如何整合多種刺激并作出反應,，往往依賴表面蛋白與配體之間的相互作用,。通過系統(tǒng)性表面蛋白組學分析，可以挖掘潛在的信號通路調(diào)控節(jié)點,，并探索它們在細胞行為調(diào)節(jié)中的具體角色,。這對構建動態(tài)信號傳導圖譜、理解應激響應機制,、分析疾病驅(qū)動因子等具有重要意義,。

3、生物標志物篩選與靶向干預探索

相較于胞內(nèi)蛋白,，細胞表面蛋白更適合作為臨床診斷和藥物作用靶點,。表面蛋白的表達變化可直接反映細胞病理狀態(tài)，有助于發(fā)現(xiàn)疾病早期預警指標或療效預測因子,。此外,，在藥物開發(fā)中，系統(tǒng)性表面蛋白組數(shù)據(jù)可用于篩選特異性靶點,，構建干預策略,，特別適合應用于抗體類藥物,、細胞治療或靶向遞送系統(tǒng)的設計。

細胞表面蛋白組學不僅是蛋白組學的一個分支,，更是解讀細胞通信邏輯,、狀態(tài)變遷和外界響應機制的核心窗口。它將基礎研究與轉(zhuǎn)化應用有效聯(lián)通,，為組織構建,、疾病理解和靶點發(fā)現(xiàn)提供了堅實的數(shù)據(jù)支撐。百泰派克生物科技將持續(xù)關注細胞表面蛋白組學領域的zuì新進展,，助力生命科學研究邁向更高分辨率,、更深層次的分子理解。

百泰派克生物科技特色項目

一,、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,，Nduāncèxù,，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務,。對于未知理論序列的dànbáizhì,，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析,。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上先進的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液,、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉,，PEC和和糖基化等N端修飾的影響,。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結合Nano-LC,，提供定量dànbáizhì組學,、靶向dànbáizhì組學、多肽組學,、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務,。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,，助力微量樣本蛋白組學,、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法,，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白,，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確,。

三,、單細胞質(zhì)譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內(nèi)部的分子,，然后用流式細胞原理分離單個細胞,，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量,。

※服務優(yōu)勢：

1.技術先進,，填補技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題,?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白,。

2.分析數(shù)量大,，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,，而流式質(zhì)譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,，且成本不高于單細胞RNAseq,。

3.應用前景大

①流式質(zhì)譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷,、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景,；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外,，質(zhì)譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾,；

③可檢測細胞存活率、細胞大小,、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量,、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四,、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的,、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別,。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥,、免疫疾病及傳染病的解決方案,，深入挖掘未知的靶標。

五,、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術,，MALDI TOF，高效色譜分離技術,，提供一系列完善的生物藥物分析方案,，從dànbáizhì、多肽,、抗體,、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析,。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務,，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征,，生物質(zhì)譜多組學優(yōu)質(zhì)服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務,。公司實驗室遵循NMPA、ICH,、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則,，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證，建立了完備的質(zhì)量體系,，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤,，為客戶提供一體化解決方案和技術服務,，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行,。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可,，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務,；

3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學,、代謝組學,、生物藥物表征、單細胞分析,、單細胞質(zhì)譜流式,、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等,；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求,；

5.服務3000+企業(yè),，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務!

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