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DNA甲基化測序

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產(chǎn)品型號

品       牌Biowing

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所  在  地上海市

更新時間:2024-03-27 09:45:41瀏覽次數(shù):604次

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目標(biāo)區(qū)域甲基化重測序(Hi-MethylSeq),又叫重亞硫酸鹽擴(kuò)增子測序(Bisulfite Amplicon Sequencing,, BSAS),。翼和生物DNA甲基化測序可以對目標(biāo)區(qū)間進(jìn)行高通量的甲基化重測序分析,,精確計算每個位點的甲基化率,,進(jìn)行單堿基分辨率的定量分析,性價比高,。

表觀遺傳學(xué)(epigenetics)是目前分子生物學(xué)研究的熱點之一,,DNA甲基化測序是表觀遺傳學(xué)的重要內(nèi)容,是基因組DNA的主要表觀遺傳修飾形式之一,。DNA甲基化是指在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNMTs)的催化下,,將甲基基團(tuán)轉(zhuǎn)移到胞嘧啶堿基上的一種修飾方式。它主要發(fā)生在富含雙核苷酸CpG島的區(qū)域,。正常情況下CpG島是以非甲基化形式(活躍形式)存在的,,DNA甲基化可導(dǎo)致基因表達(dá)沉默,。DNMTs的活性異常與疾病有密切的關(guān)系,。對于維持正常細(xì)胞功能、傳遞基因組遺傳印記,、胚胎發(fā)育以及人類腫瘤發(fā)生,,起著至關(guān)重要的作用。

上海翼和生物通過亞硫酸氫鹽(bisulfite)處理,,用多重PCR擴(kuò)增目的片段,,添加barcode和測序通用接頭,在Illumina X10二代測序平臺對PCR產(chǎn)物進(jìn)行高通量測序,,利用生物信息學(xué)方法,,精確定量計算目標(biāo)區(qū)間內(nèi)的甲基化位點的甲基化狀態(tài),在完成目標(biāo)區(qū)域檢測的同時大幅降低研究費用,。

Hi-MethylSeq結(jié)合了亞硫酸鹽轉(zhuǎn)換,、靶向擴(kuò)增子高通量測序技術(shù),可實現(xiàn)多區(qū)段,、多位點的甲基化精確定量分析,。本方法適用于感興趣的目的片段的甲基化研究,在大樣本中進(jìn)一步確認(rèn)全基因組甲基化研究挑選的陽性位點。

重亞硫酸鹽處理是DNA甲基化測序中基因組DNA處理的金標(biāo)準(zhǔn),,是一個化學(xué)過程,,可造成DNA的損傷,很難同時實現(xiàn)100%的轉(zhuǎn)換效率和保持DNA的完整性,,二者需要做出一定的平衡,。Hi-MethylSeq目標(biāo)區(qū)域之外選取3段非CpG島序列作為內(nèi)對照,準(zhǔn)確評估樣本的轉(zhuǎn)化率,。



 

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