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深圳市安培生物科技有限公司
中級(jí)會(huì)員 | 第5年

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實(shí)時(shí)熒光定量PCR的優(yōu)化(二)

時(shí)間:2021/10/12閱讀:1292
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如果你所研究的靶序列有前人建立過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR的方法,,就可以在公共數(shù)據(jù)庫(kù)中查找,,查看擴(kuò)增效率,、特異性,、靈敏度等信息,,省去從頭開(kāi)始的時(shí)間。


注意,,使用前人建立的方法前,,需要再次驗(yàn)證這個(gè)方法的參數(shù)是不是符合描述。防止長(zhǎng)時(shí)間重復(fù)實(shí)驗(yàn),,卻得不到想要的結(jié)果的人間慘劇。


推薦的公共引物探針數(shù)據(jù)庫(kù):


1,、RTPrimerDB


這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)內(nèi)的約6000個(gè)基因,,來(lái)自人、擬南芥,、大鼠等21個(gè)物種,,相對(duì)其他數(shù)據(jù)庫(kù)豐富。這些引物和探針,,也是經(jīng)過(guò)驗(yàn)證的,,70%已發(fā)表。使用該數(shù)據(jù)庫(kù)時(shí)建議通過(guò)網(wǎng)絡(luò)代理登錄,。


2,、PrimerBank 


這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)內(nèi)的探針引物是通過(guò)算法設(shè)計(jì)得到的,主要包括人和小鼠的基因。數(shù)據(jù)庫(kù)內(nèi)的小鼠引物,,經(jīng)過(guò)廣泛驗(yàn)證后,,被證實(shí)有83%的成功率。


3,、Real Time PCR Primer Sets 


這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)內(nèi)的引物和探針都經(jīng)過(guò)測(cè)試,、優(yōu)化,針對(duì)多種生物設(shè)計(jì),,包括人,、小鼠、大鼠等的基因,。


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