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中級(jí)會(huì)員 | 第5年

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qPCR實(shí)驗(yàn)為什么要制作熔解曲線(xiàn),?

時(shí)間:2021/10/11閱讀:4619
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熒光DNA結(jié)合染料法的缺點(diǎn)是它們能在反應(yīng)中結(jié)合所有DNA雙鏈,,包括在實(shí)時(shí)熒光PCR中產(chǎn)生的引物二聚體,,和其他非特異性產(chǎn)物,,引起大量的背景噪聲信號(hào),。


這種噪聲會(huì)影響我們對(duì)靶基因產(chǎn)量的評(píng)估,甚至熒光強(qiáng)度和靶基因的起始量,、全長(zhǎng)根本沒(méi)什么關(guān)系,。


因此,我們使用熒光DNA染料結(jié)合法時(shí),,需要對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行熔解曲線(xiàn)的分析,。通過(guò)對(duì)擴(kuò)增反應(yīng)產(chǎn)物逐漸升溫,同時(shí)監(jiān)測(cè)每一步的熒光信號(hào)來(lái)制作熔解曲線(xiàn),。

qPCR實(shí)驗(yàn)為什么要制作熔解曲線(xiàn)?.png

熔解曲線(xiàn)的縱坐標(biāo)是熒光信號(hào)值,,橫坐標(biāo)是溫度值,。通過(guò)觀察產(chǎn)生的信號(hào)峰和對(duì)應(yīng)溫度,可以判斷產(chǎn)物狀態(tài),。


理想情況下,,熔解曲線(xiàn)應(yīng)該是單峰,峰值對(duì)應(yīng)溫度是特異性產(chǎn)物的退火溫度,,這才能說(shuō)明擴(kuò)增產(chǎn)物中特異性產(chǎn)物占比大,。熒光DNA結(jié)合染料法的缺點(diǎn)是它們能在反應(yīng)中結(jié)合所有DNA雙鏈,包括在實(shí)時(shí)熒光PCR中產(chǎn)生的引物二聚體,,和其他非特異性產(chǎn)物,,引起大量的背景噪聲信號(hào),。

qPCR實(shí)驗(yàn)為什么要制作熔解曲線(xiàn),?.png

這種噪聲會(huì)影響我們對(duì)靶基因產(chǎn)量的評(píng)估,,甚至熒光強(qiáng)度和靶基因的起始量、全長(zhǎng)根本沒(méi)什么關(guān)系,。


因此,,我們使用熒光DNA染料結(jié)合法時(shí),需要對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行熔解曲線(xiàn)的分析,。通過(guò)對(duì)擴(kuò)增反應(yīng)產(chǎn)物逐漸升溫,同時(shí)監(jiān)測(cè)每一步的熒光信號(hào)來(lái)制作熔解曲線(xiàn),。


熔解曲線(xiàn)的縱坐標(biāo)是熒光信號(hào)值,,橫坐標(biāo)是溫度值。通過(guò)觀察產(chǎn)生的信號(hào)峰和對(duì)應(yīng)溫度,,可以判斷產(chǎn)物狀態(tài),。


理想情況下,熔解曲線(xiàn)應(yīng)該是單峰,,峰值對(duì)應(yīng)溫度是特異性產(chǎn)物的退火溫度,,這才能說(shuō)明擴(kuò)增產(chǎn)物中特異性產(chǎn)物占比大。


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