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科研實驗無小事——細胞的STR鑒定

時間:2021/9/29閱讀:2116
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做實驗的時候才發(fā)現(xiàn)細胞的種類太多,于是我們需要查詢各種文獻看每個細胞的特征,從而設(shè)計實驗規(guī)劃與步驟,,我們在緊湊的實驗種完成了實驗,,提交文章的時候,才發(fā)現(xiàn),,需要細胞鑒定,。


據(jù)統(tǒng)計約30%細胞系被交叉污染或錯誤辨識,因使用了交叉污染或錯誤辨識的細胞而導致研究結(jié)論錯誤、結(jié)果不可重復,、臨床細胞治療災難性后果……這浪費大量時間,、精力和金錢。因此NIH,、ATCC等機構(gòu)多次發(fā)出呼吁,,要求研究者對細胞進行鑒定,最近美媒報道1/6科學家在研究使用“假"細胞,,2014年12月,、2015年2月Science雜志分別發(fā)表文章專題闡述細胞交叉污染和錯誤辨識的嚴重性;2015年4月Nature通知:Nature旗下所有雜志將要求作者鑒定論文中所用細胞系,;2015年6月即有報道稱一科學家因用錯細胞系,,撤銷Nature論文。NIH,、ATCC,、Nature和Science等機構(gòu)對此多次發(fā)出呼吁,要求研究者對細胞進行鑒定,STR基因分型已被作為金標準應用于細胞系鑒定,越來越多雜志開始要求投稿人提供細胞STR鑒定結(jié)果,。


在2011年美國就已經(jīng)頒布了細胞STR鑒定國家標準(ANSI/ATCC ASN-0002-2011),。目前STR檢測已被廣泛應用于親子鑒定、個體識別,、細胞來源判定等方面,。ATCC、DSMZ,、JCRB等國際有名細胞庫已將STR基因分型列為細胞鑒定的金標準,。


STR鑒定已經(jīng)成為了細胞株的“ID"能在科研界通行無阻,必須要有STR,。那么動物源呢,,因為建立的DNA條帶并不完善,目前只有小鼠的部分細胞可以提供STR,。


STR鑒定描述:

利用熒光標記擴增產(chǎn)物長度多態(tài)分析方法對細胞樣本進行9個/16個STR位點進行分型,。設(shè)計PCR引物,組成2個PANEL用于擴增多態(tài)位點,。位點的熒光標記采用引物上標記5’FAM熒光標記,。引物用在線Primer3 軟件設(shè)計,。PCR產(chǎn)物稀釋后取少量與內(nèi)標標記混勻后直接上ABI 3130xl進行毛細管電泳,數(shù)據(jù)文件用GeneMapper4.0(Appliedbiosystems)來分析,。


STR(Short Tandem Repeat,,短串聯(lián)重復序列)是一類廣泛存在于真核生物基因組中的DNA串聯(lián)重復序列,由于其核心序列重復次數(shù)存在個體差異多態(tài)性,,因此STR也被稱為細胞的DNA指紋,。



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