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當(dāng)前位置:深圳市安培生物科技有限公司>>技術(shù)文章>>【干貨】RNA抽提原理和流程
現(xiàn)在我們所熟知的 TRIzol 是 Life Technologies 公司的商品名,,而同樣的試劑在 Piotr Chomczynski 創(chuàng)辦的 MRC 公司則被命名為 RNAzol(據(jù) Piotr Chomczynski 透露,他們已經(jīng)將 RNAzol 改進(jìn),,使抽提得到的 RNA 無(wú)基因組 DNA 殘留),。事實(shí)上,這種 RNA 抽提的方法應(yīng)該叫做“異硫氰酸胍-酚-氯仿抽提法",。
TRIzol 作用原理:
在勻質(zhì)化或溶解樣品中,,TRIzol 試劑可保持 RNA 的完整性,同時(shí)能破壞細(xì)胞及溶解細(xì)胞成分,。加入氯仿離心后,,裂解液分離成水相和有機(jī)相。RNA 存在于水相,。水相轉(zhuǎn)移后,,RNA 通過(guò)異丙醇沉淀回收。移去水相后,,用乙醇沉淀可從中間相得到 DNA,,加入異丙醇沉淀可從有機(jī)相得到蛋白質(zhì)。
需自備的耗材試劑:
o RNase free 的一次性帶蓋透明聚丙烯管
o RNase free 的槍頭
o RNase free 玻璃瓶:玻璃瓶 200°C 烘烤 2h 即可去除 RNase,,塑料瓶蓋可浸泡 10 分鐘 的 0.5 M NaOH 溶液,,然后用 RNase free 水*沖洗,并高壓蒸汽滅菌,。
o 氯仿
o 異丙醇
o RNase free 水:即 DEPC treated 水,。把水加入 RNase-free 玻璃瓶中,,加入 0.1%(v/v) DEPC 用力搖勻,37°C 過(guò)夜,,高溫高壓滅菌,。滅菌時(shí)瓶口需擰松,DEPC 受高溫會(huì)分解出大量 CO2,,注意安全,!
o 75%乙醇(無(wú)水乙醇溶于 RNase free 水中)
簡(jiǎn)明抽提流程:
裂解
a) 新鮮取材的組織液氮急凍后,每 50-100mg 組織加 1ml TRIzol,,使用強(qiáng)力勻漿機(jī)勻漿,;
b) 貼壁細(xì)胞則棄培養(yǎng)基后每 87.5px 皿中加入 TRIzol 試劑 1ml 吹打裂解;
c) 懸浮細(xì)胞則離心沉淀細(xì)胞棄培養(yǎng)基,,每 5-10×106 個(gè)細(xì)胞中加入 1ml TRIzol 吹打裂解,。
Tips:使用 TRIzol 試劑前避免洗滌組織和細(xì)胞,因?yàn)檫@增加了 mRNA 降解的可能性,。
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室溫孵育 5-10min
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每 1ml TRIzol 中加 200ul 氯仿,,用手大力搖管 15s, 室溫孵育 2-3min
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2-8°C,、12000 g×15min
離心后,,混合物分離為下層紅色的酚-氯仿相、中間相以及上層無(wú)色水相,。RNA 存在于水相,。
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轉(zhuǎn)移水相到一個(gè)新管,加入 500ul 異丙醇上下顛倒混勻,,室溫孵育 10min
Tips:轉(zhuǎn)移水相時(shí),,槍尖隨著液面下移而下移,避免擾亂分層,,慢慢吸取,,避免吸到中間相和下層有機(jī)相,更不要貪心吸太多,,吸大約 400ul 就好,。
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2-8°C、12000 g×10min 往往離心前 RNA 不可見(jiàn),,離心后再管側(cè)面和底部形成白色沉淀
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棄上清,,1ml 75%乙醇洗滌一次,2-8°C,、7500 g×5min
Tips:加入 75%乙醇時(shí)輕輕加進(jìn)去就好,,盡量不要把 RNA 沉淀吹散,把沉淀保持在原位最好了,,因?yàn)橛袝r(shí)候 RNA 太少,,吹散了再離心下來(lái)時(shí) RNA 碎片不一定能聚集到一起形成肉眼可見(jiàn)的沉淀,,導(dǎo)致后面的“盲操作"。而不小心吹散的話也沒(méi)關(guān)系,,對(duì) RNA 質(zhì)量不會(huì)有影響。
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盡量吸除上清,,室溫干燥 5-10min,,以 RNase free 水溶解,并保存于-70°C
Tips:密切注意 RNA 沉淀的干燥程度,,不要*干燥,,這將大大降低其溶解度。部分溶解的 RNA 其 A260/280 比值會(huì)偏低,。最佳干燥度為 RNA 沉淀仍然是白色的,,微微濕潤(rùn)呈啫喱狀。
OK,,搞定,!
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