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【RNA提取】RNA抽提的三大紀(jì)律八項(xiàng)注意!

時間:2021/8/30閱讀:3381
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今天我們談一談 RNA 抽提的問題,。為了方便大家記憶,總結(jié)出了“三大紀(jì)律八項(xiàng)注意",。


紀(jì)律一:無外源酶的污染,。 

外源酶會造成 RNA 的降解,造成 RNA 得率太低,,或者*失敗,。而外源酶又是無處不在的。這就要求注意以下三點(diǎn):

注意一:嚴(yán)格戴好口罩,,手套,。手指和呼吸時重要的外源酶的來源。所以童鞋們做 RNA 抽 提的時候,,還是要全副武裝起來,。這對自己也是一種保護(hù)措施,。 

注意二:實(shí)驗(yàn)所涉及的離心管,槍頭,,移液器,,實(shí)驗(yàn)臺面等要*處理。離心管和槍頭要用 DEPC 處理過,,單純的消毒滅菌可不行呀,。移液器和實(shí)驗(yàn)臺面等要用 75%的酒精擦過。 

注意三:實(shí)驗(yàn)所涉及的試劑/溶液,,尤其是水,,必須確保 RNase-Free。


紀(jì)律二:無內(nèi)源酶的活性,。 

這個和紀(jì)律一是一脈相承的,。目的都是減少 RNA 的降解,提高最終的得率,。而所有的組織都含有內(nèi)源酶,,這就要求我們在實(shí)驗(yàn)過程中,千方百計(jì)滅活內(nèi)源酶,。這也就誕生了下面的四大注意事項(xiàng): 

注意四:選擇合適的勻漿方法,。新鮮樣品取材后應(yīng)立即置于液氮中速凍,然后可以移至-70℃ 冰箱保存,。在碾磨前,,碾磨用具也必須預(yù)冷。在碾磨過程中,,一邊碾磨,,一邊補(bǔ)充液氮。樣品碾碎后,,在液氮剛剛揮發(fā)完時,,將樣品迅速轉(zhuǎn)移到含裂解液的容器中,立即混勻勻漿,。

注意五:選擇合適的裂解液?,F(xiàn)在市場上常用的裂解液幾乎都能抑制 Rnase 活性。但是,,高內(nèi)源酶含量的樣品,,如肝臟,脾臟等組織,,建議使用含苯酚的裂解液,。苯酚的滅活內(nèi)源酶的能力是很強(qiáng)的。 

注意六:控制好樣品的起始量。如果樣品的塊頭太大,,所有的細(xì)胞無法迅速和裂解液接觸,。里面沒有接觸到細(xì)胞的 RNA 很快就會被內(nèi)源酶降解。所以,,起始量不要太大,。如果塊頭太大,,要把它切成小塊小塊的,。


紀(jì)律三:明確抽提目的。 

我們做每一個實(shí)驗(yàn),,甚至每一個步驟,,都要清楚這樣子做的目的是什么。RNA 用于不同的實(shí)驗(yàn),,其質(zhì)量的要求是不一樣的,。那么,這就誕生了下面的最后兩條紀(jì)律: 

注意七:任何裂解液系統(tǒng)在接近樣品最大起始量時,,抽提成功率急劇下降,。所以,要進(jìn)行樣品的破碎和勻漿,。其目的是為了使 RNA *地完整地釋放出來,。如果樣品是細(xì)胞,則無須破碎即可直接勻漿,;如果是組織,,甚至器官,那就需要破碎后才能勻漿,;如果是酵母菌和細(xì)菌,,則需要先用相應(yīng)的酶破壁后才能勻漿。

注意八:RNA 抽提成功的一個經(jīng)濟(jì)的標(biāo)準(zhǔn)是后續(xù)實(shí)驗(yàn)的一次成功,,而不是得率,。我們?yōu)槭裁匆樘?RNA?是為了后面的實(shí)驗(yàn),,例如原位雜交,,免疫沉淀等等。所以,,一定要明確后面到底是要干嘛,?cDNA 文庫構(gòu)建要求 RNA 完整而無酶反應(yīng)抑制物殘留;Northern 對 RNA 完整性要求較高,,對酶反應(yīng)抑制物殘留要求較低,;RT-PCR 對 RNA 完整性要求不太高,但對酶 反應(yīng)抑制物殘留要求嚴(yán)格。不用每次都以獲得最高純度的 RNA 為目的,,從而造成不必要的浪費(fèi),。


綜上所述,對大部分實(shí)驗(yàn)者來說,,RNA 抽提比 DNA 抽提要困難得多,。所以,我們要個個牢記,,三大紀(jì)律八項(xiàng)注意,。

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