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基因的編輯調(diào)控技術(shù)—轉(zhuǎn)染,您了解多少,?

閱讀:1406      發(fā)布時(shí)間:2022-12-6
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轉(zhuǎn)染——是將外源基因如DNA,、RNA導(dǎo)入真核細(xì)胞的技術(shù)。是真核細(xì)胞在一定條件下主動(dòng)或被動(dòng)導(dǎo)入外源基因而獲得新的表型的過(guò)程,。隨著分子生物學(xué)和細(xì)胞生物學(xué)研究的不斷發(fā)展,,轉(zhuǎn)染已經(jīng)成為研究和控制真核細(xì)胞基因功能的常規(guī)工具。在研究基因功能,、基因表達(dá)調(diào)控,、突變分析和蛋白質(zhì)生產(chǎn)等領(lǐng)域中,轉(zhuǎn)染技術(shù)的應(yīng)用越來(lái)越廣泛,。

圖1 轉(zhuǎn)染

 

轉(zhuǎn)染的分類

根據(jù)外源性基因在真核細(xì)胞中表達(dá)時(shí)間的長(zhǎng)短我們可將轉(zhuǎn)染技術(shù)可分為瞬時(shí)轉(zhuǎn)染和穩(wěn)定轉(zhuǎn)染兩種,。在瞬時(shí)轉(zhuǎn)染的細(xì)胞中,外源基因得以表達(dá)但它們并不會(huì)整合到細(xì)胞的基因組中,,也就不會(huì)被復(fù)制,,適用的核酸類型主要包括質(zhì)粒DNA、siRNA,、miRNA和mRNA,。細(xì)胞瞬時(shí)轉(zhuǎn)染的外源基因表達(dá)時(shí)間有限,通常僅持續(xù)幾天,,直到外源基因在細(xì)胞分裂過(guò)程中因各種因素丟失為止,。穩(wěn)定轉(zhuǎn)染是建立在瞬時(shí)轉(zhuǎn)染的基礎(chǔ)上的,先對(duì)細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)染,,再對(duì)得到的細(xì)胞進(jìn)行篩選,,在少數(shù)轉(zhuǎn)染細(xì)胞中,外源基因能夠整合到細(xì)胞的基因組中,。適用的核酸類型只有質(zhì)粒DNA,,且外源基因成為細(xì)胞基因組的一部分從而得以復(fù)制,這就是穩(wěn)定轉(zhuǎn)染細(xì)胞的標(biāo)志,。穩(wěn)定轉(zhuǎn)染細(xì)胞的子代細(xì)胞也同樣表達(dá)外源基因,,由此形成穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的細(xì)胞系。

圖2 瞬時(shí)轉(zhuǎn)染和穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的區(qū)別

常規(guī)細(xì)胞轉(zhuǎn)染的途徑

1化學(xué)介導(dǎo)法

主要是使用載體分子去中和或者使帶負(fù)電的核酸帶正電荷,,讓核酸更容易進(jìn)入細(xì)胞內(nèi),。主要包括DEAE-葡聚糖法、磷酸鈣法,、陽(yáng)離子脂質(zhì)體法,、陽(yáng)離子聚合物法等。

化學(xué)介導(dǎo)法

原理

主要應(yīng)用

特點(diǎn)

DEAE-葡聚糖法

帶正電的DEAE-葡聚糖與核酸帶負(fù)電的磷酸骨架相互作用形成的復(fù)合物被細(xì)胞內(nèi)吞

瞬時(shí)轉(zhuǎn)染

相對(duì)簡(jiǎn)便、重復(fù)比磷酸鈣好,,但對(duì)細(xì)胞有一定的毒副作用,,轉(zhuǎn)染時(shí)需除血清且一般只用于BSC-1、CV-1,、COS細(xì)胞系

磷酸鈣法

磷酸鈣DNA復(fù)合物吸附細(xì)胞膜被細(xì)胞內(nèi)吞

穩(wěn)定轉(zhuǎn)染,、瞬時(shí)轉(zhuǎn)染

不適用于原代細(xì)胞(所需的DNA濃度較高),操作簡(jiǎn)便但重復(fù)性差,,有些細(xì)胞不適用,。細(xì)胞建議用CSCL梯度離心,轉(zhuǎn)染時(shí)拷貝數(shù)較多

人工脂質(zhì)體法

帶正電的脂質(zhì)體與核酸帶負(fù)電的磷酸基團(tuán)形成復(fù)合物,,然后脂質(zhì)體上剩余的電核與細(xì)胞膜上的唾液酸殘基的負(fù)電核結(jié)合

穩(wěn)定轉(zhuǎn)染,、瞬時(shí)轉(zhuǎn)染

使用方法簡(jiǎn)單,可攜帶大片段DNA,,通用于各種類型的裸露DNA或RNA,,能轉(zhuǎn)染各種類型的細(xì)胞,沒(méi)有免疫原性,。雖在體外基因轉(zhuǎn)染中有很高的效率,,但在體內(nèi),能被血清清除,,并在肺組織內(nèi)累積,,誘發(fā)強(qiáng)烈的抗炎反應(yīng),導(dǎo)致高水平的毒性,,這在很大程度上限制了其應(yīng)用

陽(yáng)離子聚合物

帶正電的聚合物與核酸帶負(fù)電的磷酸基團(tuán)形成帶正電的復(fù)合物后與細(xì)胞表面帶負(fù)電的蛋白多糖相互作用,,并通過(guò)內(nèi)吞作用進(jìn)入細(xì)胞

穩(wěn)定轉(zhuǎn)染、瞬時(shí)轉(zhuǎn)染所有細(xì)胞

除了具有陽(yáng)離子脂質(zhì)體的轉(zhuǎn)染效率高,、操作簡(jiǎn)單,、適用范圍廣、重復(fù)性好等特點(diǎn)外,,還具有在體內(nèi),、轉(zhuǎn)染效率高、細(xì)胞毒性低等特點(diǎn),,是新一代的轉(zhuǎn)染方法


2物理介導(dǎo)法

物理介導(dǎo)法是將核酸直接遞送到細(xì)胞質(zhì)或細(xì)胞核中,。主要包括電轉(zhuǎn)染、顯微注射法,、基因槍法,。

物理介導(dǎo)法

原理

主要應(yīng)用

特點(diǎn)

電轉(zhuǎn)染

通過(guò)高脈沖電壓破壞細(xì)胞膜電,DNA通過(guò)膜上形成的小孔導(dǎo)入細(xì)胞內(nèi)

穩(wěn)定轉(zhuǎn)染,、瞬時(shí)轉(zhuǎn)染所有細(xì)胞

適用性廣,除了質(zhì)粒外還可轉(zhuǎn)染大的基因組(>65kb),但細(xì)胞致死率高,,DNA和細(xì)胞用量大,, 需根據(jù)不同細(xì)胞類型優(yōu)化電穿孔實(shí)驗(yàn)條件,拷貝數(shù)較少只有1-20

顯微注射法

用顯微操作將DNA直接注入靶細(xì)胞核

穩(wěn)定轉(zhuǎn)染,、瞬時(shí)轉(zhuǎn)染

轉(zhuǎn)染細(xì)胞數(shù)有限,,多用于工程改造或轉(zhuǎn)基因動(dòng)物的胚胎細(xì)胞

基因槍法

將DNA用顯微重金屬顆粒沉淀,再將包被好的顆粒用彈道裝置投射入細(xì)胞,,DNA在胞內(nèi)逐步釋放,、表達(dá)

穩(wěn)定轉(zhuǎn)染、瞬時(shí)轉(zhuǎn)染

可用于的細(xì)胞類型有:人的表皮細(xì)胞,,纖維原細(xì)胞,,淋巴細(xì)胞系以及原代細(xì)胞


3生物介導(dǎo)法

又稱之為病毒介導(dǎo)法,是利用包裝了外源基因的病毒感染細(xì)胞的方法使得其進(jìn)入細(xì)胞,。病毒介導(dǎo)法轉(zhuǎn)染效率很高,,尤其是針對(duì)難轉(zhuǎn)染的活體細(xì)胞、原代細(xì)胞,。主要包括慢病毒,、逆轉(zhuǎn)錄病毒、腺病毒等病毒介導(dǎo)法,。

生物介導(dǎo)法

病毒基因

原理

主要應(yīng)用

特點(diǎn)

慢病毒

RNA病毒

包裝系統(tǒng)由包裝成分和載體成分組成,。將包裝成分與載體成分的多個(gè)質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染包裝細(xì)胞,即可在細(xì)胞上清中收獲攜帶目的基因的復(fù)制的慢病毒載體顆粒,。包裝好的病毒顆??梢灾苯佑糜谒拗骷?xì)胞的感染,目的基因進(jìn)入到宿主細(xì)胞之后,,經(jīng)過(guò)反轉(zhuǎn)錄,,整合到基因組,從而高水平的表達(dá)效應(yīng)分子

穩(wěn)定轉(zhuǎn)染特定宿主細(xì)胞

可以感染分裂期和非分裂期細(xì)胞,、容納外源性基因片段大,,可以長(zhǎng)期表達(dá)等顯著優(yōu)點(diǎn)。

逆轉(zhuǎn)錄病毒

RNA病毒

通過(guò)病毒中膜糖蛋白和宿主細(xì)胞表面的受體相互作用而進(jìn)入宿主細(xì)胞,,之后反轉(zhuǎn)錄酶啟動(dòng)合成DNA并隨機(jī)整合到宿主基因組中

穩(wěn)定轉(zhuǎn)染特定宿主細(xì)胞

可用于難轉(zhuǎn)染的細(xì)胞,、原代細(xì)胞,體內(nèi)細(xì)胞等,,但攜帶基因不能太大(<8kb),,細(xì)胞需處分裂期,需考慮安全因素

腺病毒

雙鏈DNA病毒

先和細(xì)胞表面的受體結(jié)合,,繼而被細(xì)胞內(nèi)吞

瞬時(shí)轉(zhuǎn)染特定宿主細(xì)胞

可用于感染分裂期和非分裂期細(xì)胞,、難轉(zhuǎn)染的細(xì)胞,需考慮安全因素



圖6 細(xì)胞轉(zhuǎn)染的途徑

細(xì)胞轉(zhuǎn)染相關(guān)實(shí)驗(yàn)

圖7 細(xì)胞轉(zhuǎn)染流程圖

以質(zhì)粒DNA為例介紹細(xì)胞轉(zhuǎn)染的流程(24孔板、貼壁細(xì)胞,、核酸轉(zhuǎn)染試劑盒(貨號(hào):abs60259)):

實(shí)驗(yàn)材料

1.1儀器設(shè)備

CO2培養(yǎng)箱,、超凈工作臺(tái)、倒置顯微鏡,、臺(tái)式冷凍離心機(jī),、水浴鍋、醫(yī)用冰箱,、-80℃冰箱,、移液器(一套)、細(xì)胞計(jì)數(shù)儀等,。

1.2試劑耗材
DMEM培養(yǎng)基,、胎牛血清(FBS)、磷酸緩沖溶液(PBS),、胰酶,、核酸轉(zhuǎn)染試劑盒(abs60259)、24孔板,、1.5ml無(wú)菌離心管若干等,。

實(shí)驗(yàn)步驟

Step1 細(xì)胞接種:

1.轉(zhuǎn)染前一天對(duì)細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)接,每孔接種1.5-2.0×105個(gè)細(xì)胞,,使轉(zhuǎn)染時(shí)細(xì)胞密度為90%左右,,且生長(zhǎng)良好(非常重要);

2.最好在轉(zhuǎn)染開始之前更換新鮮的含血清培養(yǎng)基,,以防轉(zhuǎn)染后孵育階段細(xì)胞密度太大,、營(yíng)養(yǎng)不足導(dǎo)致細(xì)胞死亡。

Step2 試劑A/DNA轉(zhuǎn)染復(fù)合物制備(該步完成后應(yīng)立即進(jìn)行轉(zhuǎn)染):

1.在1.5 ml無(wú)菌離心管A中加入50µl無(wú)血清培養(yǎng)基,,再加入適量的轉(zhuǎn)染試劑A,,見(jiàn)下表8。用移液器輕輕混勻后在室溫靜置5分鐘,。

2.在1.5 ml無(wú)菌離心管B中加入50µl無(wú)血清培養(yǎng)基,,并加入適量的試劑B,輕輕混勻,,再加入適量的DNA,,見(jiàn)下表8。用移液器再次輕輕混勻后在室溫靜置5分鐘,。

3.將DNA-培養(yǎng)基混合物滴加至試劑A-培養(yǎng)基混合物中,,用移液器輕輕混勻后在室溫靜置15~20分鐘后,立即轉(zhuǎn)染,。

注意: 1. 試劑A-培養(yǎng)基混合物和DNA-培養(yǎng)基混合物的混合次序非常重要,,切勿顛倒,。

  2. 離心管最好使用聚丙烯離心管。

Step3 轉(zhuǎn)染:

1.將Step2制備的轉(zhuǎn)染復(fù)合物滴加至培養(yǎng)基中,,邊加邊輕輕晃動(dòng)培養(yǎng)板以使復(fù)合物均勻分布,。加完后,立即將培養(yǎng)板轉(zhuǎn)入培養(yǎng)箱繼續(xù)培養(yǎng),。

2.培養(yǎng)12小時(shí)后即可觀察,最佳觀察或收獲時(shí)間為24~48小時(shí),。

3.試劑A在培養(yǎng)基中仍有較高的轉(zhuǎn)染效率,,因此轉(zhuǎn)染前后不需要換成無(wú)血清或低血清培養(yǎng)基。

培養(yǎng)皿

96孔板

48孔板

24孔板

12孔板

6孔板

10cm皿

培養(yǎng)基,、試劑,、DNA量

無(wú)血清培養(yǎng)基(μl)

2x10

2x25

2x50

2x100

2x200

2x1000


試劑A(μl)

0.5

1.3

2.5

5

10

50


試劑B(μl)

0.4

1

2

4

8

40


1ug/ul plasmid(μl)

0.16

0.4

0.8

1.6

3.2

16

培養(yǎng)基

0.1

0.25

0.5

1

2

10

表8 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染不同培養(yǎng)體系推薦初始轉(zhuǎn)染條件

影響細(xì)胞轉(zhuǎn)染效果的因素
(1) 細(xì)胞密度

細(xì)胞密度對(duì)轉(zhuǎn)染效率有一定的影響。不同的轉(zhuǎn)染試劑,,要求轉(zhuǎn)染時(shí)的最適細(xì)胞密度各不相同,,即使同一種試劑,也會(huì)因不同的細(xì)胞類型或應(yīng)用而異,。轉(zhuǎn)染時(shí)過(guò)高或者過(guò)低的細(xì)胞密度會(huì)導(dǎo)致轉(zhuǎn)染效率降低,,乃至表達(dá)水平偏低。因此如果選用新的細(xì)胞系或者新的轉(zhuǎn)染試劑,,最好能夠進(jìn)行優(yōu)化實(shí)驗(yàn)并為以后的實(shí)驗(yàn)建立一個(gè)穩(wěn)定方法,,包括適當(dāng)?shù)慕臃N量和培養(yǎng)時(shí)間等。陽(yáng)離子脂質(zhì)體試劑具有微量的細(xì)胞毒性而往往需要更高的鋪板密度或者更多的懸浮細(xì)胞數(shù),,有的要求細(xì)胞達(dá)到90%匯合度,;而研究細(xì)胞周期等表達(dá)周期長(zhǎng)的基因,就需要較低的鋪板密度,,所以需要選擇能夠在較低鋪板密度下進(jìn)行轉(zhuǎn)染的試劑,。一般轉(zhuǎn)染時(shí)貼壁細(xì)胞密度大致為50%-90%,但這個(gè)需要參考所選轉(zhuǎn)染試劑的說(shuō)明書,。

(2) 細(xì)胞生長(zhǎng)狀態(tài)

這點(diǎn)非常關(guān)鍵,,很多時(shí)候傳代次數(shù)太少或者太多都將導(dǎo)致細(xì)胞對(duì)轉(zhuǎn)染試劑敏感度的改變。因此,,為了提高轉(zhuǎn)染效率以及轉(zhuǎn)染穩(wěn)定性,、降低細(xì)胞毒性,應(yīng)盡量使用適度傳代,、生長(zhǎng)狀態(tài)良好的細(xì)胞系,。轉(zhuǎn)染的細(xì)胞是經(jīng)過(guò)幾次傳代后達(dá)到指數(shù)生長(zhǎng)期的細(xì)胞,細(xì)胞生長(zhǎng)旺盛,最容易轉(zhuǎn)染,。

(3) 細(xì)胞種類,、轉(zhuǎn)染試劑,、轉(zhuǎn)染方法

不同細(xì)胞種類的細(xì)胞在做轉(zhuǎn)染時(shí)轉(zhuǎn)染效率通常不同,因此所需要的轉(zhuǎn)染體系是不同的,,不能一種轉(zhuǎn)染體系用在所有類型細(xì)胞的轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn),。實(shí)驗(yàn)前應(yīng)根據(jù)實(shí)驗(yàn)要求和細(xì)胞特性選擇適合的轉(zhuǎn)染試劑。每種轉(zhuǎn)染試劑都有不同的轉(zhuǎn)染方法,,但大都大同小異,,同時(shí)目前產(chǎn)品都會(huì)提供一些已經(jīng)成功轉(zhuǎn)染的細(xì)胞株列表和文獻(xiàn),通過(guò)這些資料可選擇實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的轉(zhuǎn)染試劑,。另外,,在大規(guī)模使用前,仍需進(jìn)行轉(zhuǎn)染試劑和核酸比例的實(shí)踐摸索,。

(4) 核酸類型及質(zhì)量

用于轉(zhuǎn)染的核酸類型一般有質(zhì)粒DNA,、mRNA 、sirNA和miRNA,,針對(duì)不同的核酸一般采用不同的轉(zhuǎn)染試劑和轉(zhuǎn)染方法,。另外在制備高純度DNA時(shí),還需要對(duì)DNA進(jìn)行內(nèi)毒素的去除,,內(nèi)毒素的存在會(huì)造成細(xì)胞毒性,,嚴(yán)重影響轉(zhuǎn)染效率。同時(shí)DNA質(zhì)量對(duì)轉(zhuǎn)染的效果影響也非常大,,一般轉(zhuǎn)染技術(shù)是基于電荷吸引原理,,如果DNA不純,帶有污染物都會(huì)顯著影響轉(zhuǎn)染復(fù)合物的的形成,。


圖9 細(xì)胞轉(zhuǎn)染圖

本期小愛(ài)推薦

轉(zhuǎn)染類產(chǎn)品推薦

貨號(hào)

產(chǎn)品名稱

規(guī)格

abs60259

核酸轉(zhuǎn)染試劑盒

0.5ml/1.0ml/1.5ml

abs60255

質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)染試劑盒(貼壁細(xì)胞)

0.5ml/1.0ml/1.5ml

abs60256

PM原代細(xì)胞質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)染試劑盒

0.5ml/1.0ml/1.5ml

abs60257

溶液A(轉(zhuǎn)染增強(qiáng)劑,,僅用于質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)染)

0.25ml/0.5ml/1ml

abs60317

核酸共轉(zhuǎn)染試劑

0.5ml/1.0ml/1.5ml

abs60322

Lipofect5000質(zhì)粒轉(zhuǎn)染試劑

0.5ml/1.0ml

abs60324

PM原代細(xì)胞核酸轉(zhuǎn)染試劑盒

0.5ml/1.0ml/1.5ml

abs60325

SP懸浮細(xì)胞核酸轉(zhuǎn)染試劑盒

0.5ml/1.0ml/1.5ml

abs60327

SP懸浮細(xì)胞質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)染試劑盒

0.5ml/1.0ml/1.5ml


細(xì)胞培養(yǎng)類產(chǎn)品推薦

貨號(hào)

品名

規(guī)格

abs47047834

胰酶

100g/500g

abs961

10×PBS緩沖液

500ml/500ml×10

abs9468

RPMI 1640 培養(yǎng)基(ATCC 改良)

500ml

abs9484

RPMI-1640培養(yǎng)基

500ml/500ml×10

abs9483

高糖 DMEM 培養(yǎng)基(含 L-谷氨酰胺和丙酮酸鈉)

500ml/500ml×10

abs9501

無(wú)糖 DMEM 培養(yǎng)基(不含HEPES、L-谷氨酰胺和丙酮酸鈉,,含酚紅)

500ml/500ml×10

abs972

胎牛血清(優(yōu)級(jí))

125ml/500ml

abs973

胎牛血清(優(yōu)級(jí)),輻照

125ml/500ml

abs974

胎牛血清(標(biāo)準(zhǔn)級(jí))

125ml/500ml

abs975

胎牛血清(標(biāo)準(zhǔn)級(jí)),輻照

125ml/500ml

abs7004

細(xì)胞培養(yǎng)皿(35mm)

500個(gè)/箱

abs7005

細(xì)胞培養(yǎng)皿(60mm)

500個(gè)/箱

abs7003

細(xì)胞培養(yǎng)皿(100mm)

500個(gè)/箱

abs7033

標(biāo)準(zhǔn)透明6孔細(xì)胞培養(yǎng)板

50個(gè)/盒

abs7034

標(biāo)準(zhǔn)透明12孔細(xì)胞培養(yǎng)板

50個(gè)/箱

abs7035

標(biāo)準(zhǔn)透明24孔細(xì)胞培養(yǎng)板

50個(gè)/盒

abs7040

標(biāo)準(zhǔn)透明48孔細(xì)胞培養(yǎng)板

50個(gè)/箱

abs7036

標(biāo)準(zhǔn)透明96孔細(xì)胞培養(yǎng)板

50個(gè)/盒

abs7119

1.5ml離心管(無(wú)菌無(wú)酶)

500支/盒,10盒/箱(1袋/盒)

 


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