針對樣品的常見問題:
Q:細(xì)胞水平要做Western Blot,,多少細(xì)胞提的蛋白夠Western Blot,?
A:一般地5* 106就足夠了。
Q: 同一樣品能同時提RNA又提蛋白嗎,,這樣對Western Blot有無影響?
A:能,,沒有問題的,。
Q: 同一蛋白樣品能同時進(jìn)行兩種因子的Western Blot檢測嗎?
A:當(dāng)然可以,,有的甚至可以同時測幾十種樣品,。
Q: 如果目標(biāo)蛋白是膜蛋白或是胞漿蛋白,操作需要注意什么,?
A: 如果是膜蛋白和胞漿蛋白,,所用的去垢劑就要溫和得多,這時建議加上NaF去抑制磷酸化酶的活性,。
Q: 蛋白變性后可以存放多久,?
A:-80℃,一兩年沒有問題,。zui關(guān)鍵兩條:不要被蛋白酶水解掉;不要被細(xì)菌消化掉(也是被酶水解了),。
Q: 如果上樣量超載,,要用什么方法來增加上樣量?如果需要加大上樣量使原來弱的條帶能看清楚,。
A:可以濃縮樣品,,也可以根據(jù)你的目標(biāo)分子量透析掉一部分小分子蛋白。一般地,,超載30%是不會有問題的,。如果已經(jīng)超了不少了,而且小分子量的也要,,可以考慮加大膠的厚度,,可以試試1.5mm厚度的凝膠。
Q: 接下來我準(zhǔn)備采用DAB顯色技術(shù),,二抗是生物素化的多克隆抗體,,三抗是親和素生物素體系,不知采用這樣的方案后,,封閉液是否要作調(diào)整,,能否再用5%的脫脂奶粉呢?好像有資料說脫脂奶粉會影響親和素生物素的生成,,是嗎,?
A:不能使用脫脂奶粉,因為脫脂奶粉中含生物素,,用BSA代替應(yīng)該好一點(diǎn),,此外如果用于磷酸化指標(biāo)蛋白的檢測時也不能用脫脂奶粉,因為脫脂奶粉中含有酪蛋白,。
Q:一般一次上樣的蛋白總量是多少,,跟目的蛋白的表達(dá)量有關(guān)系嗎,?
A:Western Blot一般上樣30-100微克不等,結(jié)果跟目的蛋白的豐度,、上樣量,、一二抗的量和孵育時間都有關(guān)系,也與顯色時間長短有關(guān),。開始摸條件時,,為了拿到陽性結(jié)果,各個步驟都可以量多一點(diǎn)時間長一點(diǎn),,當(dāng)然背景也就出來了,。要拿到好的結(jié)果,如果抗體好的話比較容易,,抗體不好的話就需要反復(fù)地試了,,當(dāng)然有的不適合Western Blot的怎樣做也不行。所以拿到好的結(jié)果不容易,。
Q: 做組織樣品的western的時候,,處理樣品有什么訣竅嗎?還有,,您用過大牛血清做封閉劑嗎,?濃度如何?效果是不是比BSA好一點(diǎn),?
A:組織樣品必須進(jìn)行研磨,、勻漿超聲處理,蛋白質(zhì)溶解度會更好,,離心要充分,,膜蛋白需用更劇烈的方法抽提,低豐度膜蛋白可能還要分步抽提(超速離心),。還有一點(diǎn)就是組織中的蛋白酶活性更強(qiáng),,需要注意抑制蛋白酶的活性(加入PMSF和蛋白酶抑制劑 cocktail),封閉劑一般5%脫脂奶粉較常用,。如果一抗為多克隆抗體,,使用BSA也是不錯的選擇。
Q: 大分子量蛋白200 kD,,在做western要注意什么呢,?
A:做200kd蛋白的Western Blot時要注意,分離膠建議選擇>7%的,;剝膠時要小心,;轉(zhuǎn)移時間需要相應(yīng)延長;要做分子量參照(否則出現(xiàn)雜帶不知道如何分析),。
Q:蛋白的上樣量有沒有什么具體的要求,?
A:上樣量要根據(jù)實驗的要求來定,, 如果要求是定量和半定量的Western Blot 則上樣量要均等, 如果只是要定性,,則沒有太大的關(guān)系,, 盡量多上就行了, 但是不要超過0.3μg/mm2,。
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