(1)干細(xì)胞細(xì)胞膜通透性的差異：活細(xì)胞的細(xì)胞膜是一種選擇性膜,，對細(xì)胞起保護(hù)和屏障作用，只允許物質(zhì)選擇性的通過;而細(xì)胞死亡之后,，細(xì)胞膜受損,，通透性增加。

(2)死活細(xì)胞在代謝上的差異：由于活細(xì)胞中新陳代謝的作用,，使細(xì)胞內(nèi)具有較強(qiáng)的還原能力,，而死細(xì)胞或代謝緩慢的老細(xì)胞，則因它們的無還原能力或還原能力極弱,。

常見的細(xì)胞染料有：中性紅(細(xì)胞器的專有染料),、臺盼藍(lán)、甲基藍(lán),、美藍(lán),、熒光素雙醋酸酯(FDA)等。

① 中性紅染色：常用染料之一,，是細(xì)胞器的專有染料,。利用干細(xì)胞膜的通透性差異，用來染原生動物和顯示動植物組織中活細(xì)胞的內(nèi)含物等,。中性紅無毒,，常做活體染色的染料。

② 臺盼藍(lán)染色：當(dāng)細(xì)胞損傷或死亡時,，臺盼藍(lán)可穿透變性的細(xì)胞膜,，與解體的DNA 結(jié)合，使其著色,。而活細(xì)胞能阻止染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi),。故可以鑒別死細(xì)胞與活細(xì)胞。嚴(yán)格來說,，臺盼藍(lán)染色檢測的是細(xì)胞膜的完整性,，通常認(rèn)為細(xì)胞膜喪失完整性，即可認(rèn)為細(xì)胞已經(jīng)死亡。通過顯微鏡很容易就能識別出死亡的被臺盼藍(lán)染色的細(xì)胞,，并可使用細(xì)胞計(jì)數(shù)器進(jìn)行計(jì)數(shù),。

③ 美藍(lán)染色法：美藍(lán)是一種無毒性染料，它的氧化型是藍(lán)色的,，而還原型是無色的,，用它來對活細(xì)胞進(jìn)行染色，由于細(xì)胞中新陳代謝的作用,，使細(xì)胞內(nèi)具有較強(qiáng)的還原能力,，能使美藍(lán)從藍(lán)色的氧化型變?yōu)闊o色的還原型，所以活細(xì)胞無色,，而對于死細(xì)胞或代謝緩慢的老細(xì)胞,，則因它們無此還原能力或還原能力極弱，而被美藍(lán)染成藍(lán)色或淡藍(lán)色,。因此,，用美藍(lán)水浸片不僅可觀察酵母的形態(tài)，還可以區(qū)分死,、活細(xì)胞.

④ 干細(xì)胞甲基藍(lán)染色法：甲基藍(lán)染色與臺盼藍(lán)類似的染色機(jī)理,。