(1)干細胞細胞膜通透性的差異：活細胞的細胞膜是一種選擇性膜,，對細胞起保護和屏障作用,，只允許物質(zhì)選擇性的通過;而細胞死亡之后,，細胞膜受損，通透性增加,。

(2)死活細胞在代謝上的差異：由于活細胞中新陳代謝的作用,，使細胞內(nèi)具有較強的還原能力，而死細胞或代謝緩慢的老細胞,，則因它們的無還原能力或還原能力極弱,。

常見的細胞染料有：中性紅(細胞器的專有染料)、臺盼藍,、甲基藍,、美藍、熒光素雙醋酸酯(FDA)等,。

① 中性紅染色：常用染料之一,，是細胞器的專有染料。利用干細胞膜的通透性差異,，用來染原生動物和顯示動植物組織中活細胞的內(nèi)含物等,。中性紅無毒，常做活體染色的染料,。

② 臺盼藍染色：當細胞損傷或死亡時,，臺盼藍可穿透變性的細胞膜，與解體的DNA 結合,，使其著色,。而活細胞能阻止染料進入細胞內(nèi)。故可以鑒別死細胞與活細胞,。嚴格來說,，臺盼藍染色檢測的是細胞膜的完整性，通常認為細胞膜喪失完整性,，即可認為細胞已經(jīng)死亡,。通過顯微鏡很容易就能識別出死亡的被臺盼藍染色的細胞，并可使用細胞計數(shù)器進行計數(shù),。

③ 美藍染色法：美藍是一種無毒性染料,，它的氧化型是藍色的，而還原型是無色的,，用它來對活細胞進行染色,，由于細胞中新陳代謝的作用，使細胞內(nèi)具有較強的還原能力,，能使美藍從藍色的氧化型變?yōu)闊o色的還原型,，所以活細胞無色，而對于死細胞或代謝緩慢的老細胞,，則因它們無此還原能力或還原能力極弱,，而被美藍染成藍色或淡藍色。因此,，用美藍水浸片不僅可觀察酵母的形態(tài),，還可以區(qū)分死、活細胞.

④ 干細胞甲基藍染色法：甲基藍染色與臺盼藍類似的染色機理,。