HCoV-229E和HCoV-OC43都是在1960年代發(fā)現(xiàn)的,多年來(lái)一直被*為引起普通感冒的原因,,并在一生中引起頻繁的再感染,。在成年人中,這些病毒每年占急性呼吸道疾病的 4%至15%,,在高峰期高達(dá)35%,。兒童的年發(fā)病率達(dá)到8%,發(fā)病率高達(dá)20%,。據(jù)報(bào)道,,成人中229E和OC43病毒的感染頻率為每年每100人15至25人不等,其中有80%的感染者是先前具有該感染病毒抗體的人,。
NCBI收錄序列為KX344031.1,,全長(zhǎng)30713bp,基因編碼5個(gè)結(jié)構(gòu)蛋白:S,,M,,N,HE和E,。
- S蛋白(spike protein)穿過(guò)病毒膜,,并在冠狀病毒“冠狀”中形成特征性的尖峰。它被高度糖基化,,可能形成同源三聚體,,并介導(dǎo)受體結(jié)合和與宿主細(xì)胞膜融合。刺激中和抗體的主要抗原以及細(xì)胞毒性淋巴細(xì)胞的重要靶標(biāo)在S蛋白上,。
- M蛋白(membrane glycoprotein)具有一個(gè)短的N末端結(jié)構(gòu)域,,該結(jié)構(gòu)域在包膜的外表面上突出并跨過(guò)該包膜3次,在包膜內(nèi)留有一個(gè)長(zhǎng)的C末端,。M蛋白在病毒裝配中起重要作用,。
- 核衣殼蛋白N(nucleocapsid phosphoprotein)與RNA基因組結(jié)合形成核衣殼。它可能參與病毒RNA合成的調(diào)控,,并可能在病毒出芽過(guò)程中與M蛋白相互作用,。
- HCoV-OC43中發(fā)現(xiàn)血凝素酯酶糖蛋白(HE)。血凝素部分與宿主細(xì)胞表面的神經(jīng)氨酸結(jié)合,,可能使病毒初吸附到膜上,。酯酶從神經(jīng)氨酸裂解乙酰基,。冠狀病毒的HE基因與C型流感HE糖蛋白具有序列同源性,,可能反映了這兩種病毒之間的早期重組。
- 小包膜E(envelope protein)蛋白將其C末端留在包膜內(nèi),,然后跨越該包膜或彎曲并在內(nèi)部投射其N(xiāo)末端,。
根據(jù)CDC和WHO的介紹,,針對(duì)HCoV-OC43的核酸診斷一般是針對(duì)RdRP (RNA-dependent RNA polymerase)、Gene N和Gene E,, Gene S更多用于對(duì)應(yīng)藥物和疫苗的開(kāi)發(fā),。
以往針對(duì)試劑盒檢測(cè)限的性能評(píng)價(jià),一般是選擇體外轉(zhuǎn)錄的RNA,、或者臨床陽(yáng)性病毒來(lái)作為標(biāo)準(zhǔn)品,,用于性能評(píng)價(jià)。但是兩者都具有很明顯的確定,,首先體外轉(zhuǎn)錄的RNA,,一般是很純,單一,,不涉及提取,,不符合臨床病毒的微環(huán)境,因此必然造成檢測(cè)靈敏度被高估,,這也是存在高概率假陰性的主要原因,;再次臨床陽(yáng)性病毒,即使是滅活的病毒,,也是存在很大的生物安全隱患,,因此要求實(shí)驗(yàn)室級(jí)別為P3-P4,大部分開(kāi)發(fā)診斷試劑盒單位都不滿(mǎn)足改要求,,另外臨床陽(yáng)性病毒也是來(lái)源很有限,,不能被穩(wěn)定供應(yīng),反復(fù)用于試劑盒的性能評(píng)價(jià),。
因此,,有病毒的完整包膜結(jié)構(gòu),有HCoV-OC43對(duì)應(yīng)的核酸序列,,但是生物安全風(fēng)險(xiǎn)較低的假病毒標(biāo)準(zhǔn)品,,完美的克服了如上的缺點(diǎn),非常適合用于核酸診斷性能評(píng)價(jià)的標(biāo)準(zhǔn)品,。
科佰生物開(kāi)發(fā)了基于NCBI公布序列的假病毒產(chǎn)品,,用于各診斷試劑盒的性能評(píng)價(jià),其對(duì)應(yīng)的優(yōu)點(diǎn)如下:
- hCov-OC43-E 假病毒標(biāo)準(zhǔn)品,,區(qū)別于以往體外合成的RNA,、臨床陽(yáng)性活病毒,完美克服兩者的缺點(diǎn),,真正適合用于試劑盒的性能評(píng)價(jià),,包含檢測(cè)限、特異性,,重復(fù)性等,;
- 根據(jù)HCoV-OC43冠狀病毒的特點(diǎn),選取了RdRp(RNA-dependent RNA polymerase),、Gene E(envelope protein),、Gene N(nucleocapsid phosphoprotein)合計(jì)3個(gè)區(qū)段的序列,用于假病毒的包裝,,3個(gè)區(qū)段很好的表征了HCoV-OC43的特征序列,;
- 科佰生物設(shè)計(jì)了ddPCR體系的引物、探針序列,,可不需要構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)的前提下完成對(duì)假病毒的QC拷貝數(shù)檢測(cè),,非常準(zhǔn)確表征標(biāo)準(zhǔn)品的拷貝數(shù),而且克服了Q-PCR分析CT值的相對(duì)判斷標(biāo)準(zhǔn)的不準(zhǔn)確性,;
- hCov-OC43-E 假病毒標(biāo)準(zhǔn)品,,無(wú)致病性,可再生,,質(zhì)控方法可靠,,批次間穩(wěn)定,可以長(zhǎng)期穩(wěn)定制備和供應(yīng),,而且要求實(shí)驗(yàn)室生物安全級(jí)別為P2,,滿(mǎn)足很多單位的安全需求。