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信帆生物為大家提供:Western blot實(shí)驗(yàn)步驟詳解
一.實(shí)驗(yàn)步驟
1. 組織塊稱重
2. 利用液氮、研缽粉碎組織塊
3. 加入RIPA緩沖液(每克組織3 ml RIPA),,PMSF(每克組織30μl,,10 mg/ml PMSF),,利用Polytron進(jìn)一步勻漿(15,000轉(zhuǎn)/分*1分鐘)維持4℃
4. 加入PMSF(每克組織30μl,10 mg/ml PMSF),,冰上孵育30分鐘
5. 移入離心管4℃ 約20,000 g(約15,000轉(zhuǎn))15分鐘
6. 上清液為細(xì)胞裂解液可分裝-20℃保存
7. 進(jìn)行Bradford比色法測定蛋白質(zhì)濃度
8. 取相同質(zhì)量的細(xì)胞裂解液(體積*蛋白質(zhì)濃度),,并加等體積的2×電泳加樣緩沖液
9. 沸水浴中3分鐘
10. 上樣
11. 電泳(濃縮膠20mA,分離膠35mA)
12. 電轉(zhuǎn)膜儀轉(zhuǎn)膜(100mA 40分鐘)
13. 膜用麗春紅染色,,膠用考馬斯亮藍(lán)染色
14. Westernblot 試劑盒顯色
15. 分析比較記錄
western blot的實(shí)驗(yàn)步驟及注意事項(xiàng)的資料
1. 把聚丙烯酰胺凝膠中的蛋白質(zhì)電泳轉(zhuǎn)移到硝酸纖維膜上,。
1)轉(zhuǎn)移緩沖液洗滌凝膠和硝酸纖維素膜,將硝酸纖維素膜鋪在凝膠上,,用5ml移液管在凝膠上來回滾動去除所有的氣泡,。
2)在凝膠/濾膜外再包一張3mm濾紙(預(yù)先用轉(zhuǎn)移緩沖液浸濕),將凝膠夾在中間,,保持濕潤和沒有氣泡,。
3)將此濾紙/凝膠/薄膜濾紙按照廠家建議方法放入電泳裝置中,凝膠面向陰極,。
4)將上述裝置放入緩沖液槽中,,并灌滿轉(zhuǎn)移緩沖液以淹沒凝膠。
5)按照廠家所示接通電源開始電泳轉(zhuǎn)移,。
6)轉(zhuǎn)移結(jié)束后,,取出薄膜和凝膠,棄去凝膠,。
2. 將薄膜漂在氨基黑中快速染色,,直至分子量標(biāo)準(zhǔn)顯現(xiàn)時取出,記錄下標(biāo)準(zhǔn)位置,。
3. 用100ml水洗滌纖維素膜,,必要時可用脫色緩沖液。
4. 膜置印跡緩沖液中于37℃保溫1小時,。
5. 室溫下,,用PBS-Tween緩沖液洗滌薄膜,。
6. 用封口機(jī)將薄膜封入塑料袋中,盡可能不留空氣,。
7.袋的一角剪一緩沖液的小口,,用透析袋夾緊。
8.混合:NGS(100微升),,印跡緩沖液中的抗體(10毫升),,加在裝薄膜的袋中,于室溫下?lián)u動2小時(或4℃過一夜)
9.用總體積300ml PBS-Tween緩沖液,,分4次在一淺盤中洗滌薄膜,,每次75ml。
10. 將連接生物素的羊抗兔IgG(40微升溶于10毫升印跡緩沖液/100微升 NGS)加在袋內(nèi),,于室溫下?lián)u動1小時。
11.按步驟9洗滌,。
12.加入抗生素蛋白-HRP(40微升溶于10毫升印跡緩沖液/100微升 NGS),,于室溫下?lián)u動。
注意事項(xiàng):
western blot中轉(zhuǎn)移在膜上的蛋白處于變性狀態(tài),,空間結(jié)構(gòu)改變,,因此那些識別空間表位的抗體不能用于western blot檢測。這種情況可以將表達(dá)目的蛋白的細(xì)胞或細(xì)胞裂解液中的所有蛋白物素化,,再用酶標(biāo)記親和素進(jìn)行western blot,。實(shí)驗(yàn)中取膠和膜需帶手套。
Western可以參考如下步驟進(jìn)行操作,。
1.收集蛋白樣品(Protein sample preparation)
可以使用適當(dāng)?shù)牧呀庖?,例如碧云天生物試劑的Western及IP細(xì)胞裂解液,裂解貼壁細(xì)胞,、懸浮細(xì)胞或組織樣品,。對于某些特定的亞細(xì)胞組份蛋白,例如細(xì)胞核蛋白,、細(xì)胞漿蛋白,、線粒體蛋白等,可以參考相關(guān)文獻(xiàn)提取這些亞細(xì)胞組份蛋白,,也可以使用試劑盒進(jìn)行抽提,,例如碧云天生物試劑的細(xì)胞核蛋白與細(xì)胞漿蛋白抽提試劑盒。收集完蛋白樣品后,,為確保每個蛋白樣品的上樣量一致,,需要測定每個蛋白樣品的蛋白濃度。根據(jù)所使用的裂解液的不同,,需要采用適當(dāng)?shù)牡鞍诐舛葴y定方法,。因?yàn)椴煌牡鞍诐舛葴y定方法對于一些去垢劑和還原劑等的兼容性差別很大,。如果使用碧云天生物試劑的Western及IP細(xì)胞裂解液,可以使用BCA蛋白濃度測定試劑盒,。
2. 電泳(Electrophoresis)
(1) SDS-PAGE凝膠配制
SDS-PAGE凝膠可以參考一些文獻(xiàn)資料進(jìn)行配制,,也可以使用碧云天生物試劑的SDS-PAGE凝膠配制試劑盒。該試劑盒提供了除水和配膠器具外的所有試劑以及配制各種濃度SDS-PAGE的配方,。
(2) 樣品處理
在收集的蛋白樣品中加入適量濃縮的SDS-PAGE蛋白上樣緩沖液,。例如2X或5X的SDS-PAGE蛋白上樣緩沖液。使用5X的SDS-PAGE蛋白上樣緩沖液可以減小上樣體積,,在相同體積的上樣孔內(nèi)可以上樣更多的蛋白樣品,。5X的SDS-PAGE蛋白上樣緩沖液可以參考相關(guān)文獻(xiàn)資料配制,也可以使用碧云天生物試劑的SDS-PAGE蛋白上樣緩沖液(5X),。
100℃或沸水浴加熱3-5分鐘,,以充分變性蛋白.
(3) 上樣與電泳
冷卻到室溫后,把蛋白樣品直接上樣到SDS-PAGE膠加樣孔內(nèi)即可,。為了便于觀察電泳效果和轉(zhuǎn)膜效果,,以及判斷蛋白分子量大小,使用預(yù)染蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn),。
電泳時通常推薦在上層膠時使用低電壓恒壓電泳,,而在溴酚藍(lán)進(jìn)入下層膠時使用高電壓恒壓電泳。對于Bio-Rad的標(biāo)準(zhǔn)電泳裝置或類似電泳裝置,,低電壓可以設(shè)置在80-100V,,高電壓可以設(shè)置在120V左右。SDS-PAGE可以采用普通的電泳儀就可以滿足要求,,也可以采用碧云天的多功能電泳儀(帶定時),。為了電泳方便起見,也可以采用整個SDS-PAGE過程恒壓的方式,,通常把電壓設(shè)置在100V,,然后設(shè)定定時時間為90-120分鐘。設(shè)置定時可以避免經(jīng)常發(fā)生的電泳過頭,。通常電泳時溴酚藍(lán)到達(dá)膠的底端處附近即可停止電泳,,或者可以根據(jù)預(yù)染蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)的電泳情況,預(yù)計(jì)目的蛋白已經(jīng)被適當(dāng)分離后即可停止電泳,。
3. 轉(zhuǎn)膜(Transfer)
我們推薦在Western實(shí)驗(yàn)中選用PVDF膜,。硝酸纖維素膜(NC膜)也可以使用,但硝酸纖維素膜比較脆,,在操作過程中特別是用鑷子夾取等過程中容易裂開,。膜的使用請參考生物試劑商的推薦使用步驟。
通常如果使用Bio-Rad的標(biāo)準(zhǔn)濕式轉(zhuǎn)膜裝置,,可以設(shè)定轉(zhuǎn)膜電流為300-400mA,,轉(zhuǎn)膜時間為30-60分鐘,。也可以在15-20mA轉(zhuǎn)膜過一夜。轉(zhuǎn)膜時也可以使用碧云天的多功能電泳儀(帶定時),。具體的轉(zhuǎn)膜時間要根據(jù)目的蛋白的大小而定,,目的蛋白的分子量越大,需要的轉(zhuǎn)膜時間越長,,目的蛋白的分子量越小,,需要的轉(zhuǎn)膜時間越短。
在轉(zhuǎn)膜過程中,,特別是高電流快速轉(zhuǎn)膜時,,通常會有非常嚴(yán)重的發(fā)熱現(xiàn)象,把轉(zhuǎn)膜槽放置在冰浴中進(jìn)行轉(zhuǎn)膜,。
轉(zhuǎn)膜的效果可以觀察所使用的預(yù)染蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn),,通常分子量zui大的1-2條帶較難全部轉(zhuǎn)到膜上。轉(zhuǎn)膜的效果也可以用麗春紅染色液對膜進(jìn)行染色,,以觀察實(shí)際的轉(zhuǎn)膜效果,。也可以用考馬斯亮藍(lán)快速染色液對完成轉(zhuǎn)膜的SDS-PAGE膠進(jìn)行染色,以觀察蛋白的殘留情況,。
4. 封閉(Blocking)
轉(zhuǎn)膜完畢后,立即把蛋白膜放置到預(yù)先準(zhǔn)備好的Western洗滌液中,,漂洗1-2分鐘,,以洗去膜上的轉(zhuǎn)膜液。從轉(zhuǎn)膜完畢后所有的步驟,,一定要注意膜的保濕,,避免膜的干燥,否則極易產(chǎn)生較高的背景,。
用微型臺式真空泵吸盡洗滌液,,加入Western封閉液,在搖床上緩慢搖動,室溫封閉60分鐘,。對于一些背景較高的抗體,,可以在4℃ 封閉過一夜。在整個Western過程中我們推薦使用碧云天生物試劑的側(cè)擺搖床,,側(cè)向擺動速度比較緩慢,,而且也容易讓溶液覆蓋蛋白膜。
5. 一抗孵育(Primary antibody incubation)
參考一抗的說明書,,按照適當(dāng)比例用Western一抗稀釋液稀釋一抗,。
用微型臺式真空泵吸盡封閉液,立即加入稀釋好的一抗,,室溫或4℃在側(cè)擺搖床上緩慢搖動孵育一小時,。如果一抗孵育一小時效果不佳,,可以在4℃緩慢搖動孵育過一夜。
回收一抗,。加入Western洗滌液,,在側(cè)擺搖床上緩慢搖動洗滌5-10分鐘。吸盡洗滌液后,,再加入洗滌液,,洗滌5-10分鐘。共洗滌3次,。如果結(jié)果背景較高可以適當(dāng)延長洗滌時間并增加洗滌次數(shù),。
6. 二抗孵育(Secondary antibody inucubation)
參考二抗的說明書,按照適當(dāng)比例用Western二抗稀釋液稀釋辣根過氧化物酶(HRP)標(biāo)記的二抗,。用微型臺式真空泵吸盡洗滌液,,立即加入稀釋好的二抗,室溫或4℃在側(cè)擺搖床上緩慢搖動孵育一小時,。
回收二抗,。加入Western洗滌液,在側(cè)擺搖床上緩慢搖動洗滌5-10分鐘,。吸盡洗滌液后,,再加入洗滌液,洗滌5-10分鐘,。共洗滌3次,。如果結(jié)果背景較高可以適當(dāng)延長洗滌時間并增加洗滌次數(shù)。
7. 蛋白檢測(Detection of proteins)
參考相關(guān)說明書,,使用BeyoECL, Western 熒光檢測試劑等ECL類試劑來檢測蛋白,。
洗片時可以使用X光片自動洗片機(jī)。如果沒有自動洗片機(jī),,可以用顯影定影試劑盒自行配制顯影液和定影液進(jìn)行手工洗片,。
8. 膜的重復(fù)利用(Membrane recovery)
如果蛋白樣品非常寶貴,可以使用Western一抗二抗去除液處理蛋白膜,,以重復(fù)利用蛋白膜,。
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