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腦癌驅(qū)動(dòng)基因
2013-8-9 閱讀(297)
來(lái)自哥倫比亞大學(xué)醫(yī)學(xué)中心Herbert Irving綜合癌癥中心的一個(gè)研究人員小組,,確定了18個(gè)驅(qū)動(dòng)zui常見,、侵襲性的成人腦癌——多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤形成的新基因,。這一研究發(fā)布在8月5日的《自然遺傳學(xué)》(Nature Genetics)雜志上,。
論文的主要作者,、哥倫比亞大學(xué)醫(yī)學(xué)中心病理學(xué)和神經(jīng)病學(xué)教授Antonio Iavarone博士說:“癌癥依賴于驅(qū)動(dòng)基因(driver genes)來(lái)維持癌癥,,這些驅(qū)動(dòng)基因是治療的靶點(diǎn)。”
“一旦你知道一種特定腫瘤的驅(qū)動(dòng)子,,你擊中它,,癌癥就會(huì)崩潰。我們認(rèn)為我們的研究已經(jīng)取得了膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中絕大多數(shù)的驅(qū)動(dòng)基因,,因此為膠質(zhì)母細(xì)胞瘤藥物開發(fā)提供了zui重要的靶點(diǎn)列表,,并為腦癌個(gè)體化治療奠定了基礎(chǔ)。”
哥倫比亞大學(xué)醫(yī)學(xué)中心兒科學(xué)和病理學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)副教授Anna Lasorella博士說,,對(duì)于大約15%的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者,,個(gè)體化治療有可能會(huì)很快成為現(xiàn)實(shí)。
她說:“新研究顯示大約15%的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤它們的驅(qū)動(dòng)基因,,都可以用目前FDA批準(zhǔn)可獲得的藥物靶向,。不知道為什么這些患者在當(dāng)前的臨床試驗(yàn)中沒有接受這些藥物治療。”
新生物信息學(xué)技術(shù)將驅(qū)動(dòng)基因與其他的突變區(qū)分開來(lái)
在所有單個(gè)腫瘤中,,可能有成百上千的基因發(fā)生了突變,,但將驅(qū)動(dòng)癌癥的突變與沒有影響的突變區(qū)分開來(lái)對(duì)研究人員而言是一個(gè)長(zhǎng)期存在的挑戰(zhàn)。
該研究小組結(jié)合高通量DNA測(cè)序與一種統(tǒng)計(jì)分析新方法,,生成了一個(gè)驅(qū)動(dòng)候選基因短名單,。大規(guī)模分析近140個(gè)腦瘤,測(cè)序腫瘤中每個(gè)基因的DNA和RNA,,鑒別出了每個(gè)腫瘤的所有突變,。共同作者、生物醫(yī)學(xué)信息學(xué)和系統(tǒng)生物學(xué)助理教授Raul Rabadan博士設(shè)計(jì)出一種統(tǒng)計(jì)算法,,隨后被用于鑒別zui有可能的驅(qū)動(dòng)突變,。不同于其他的技術(shù),這一算法不僅考慮到了不同腫瘤中基因的突變頻率,,還納入了突變方式,,由此將驅(qū)動(dòng)突變與其他的突變區(qū)分開來(lái)。
Iavarone博士說:“如果腫瘤中基因的一個(gè)副本在一個(gè)單位點(diǎn)突變,,第二個(gè)副本以另一種不同方式突變,,那么這個(gè)基因就有較高的概率是驅(qū)動(dòng)基因。”
分析確定了15個(gè)以往在其他研究中證實(shí)的驅(qū)動(dòng)基因,,還發(fā)現(xiàn)了18個(gè)從未顯示與膠質(zhì)母細(xì)胞相關(guān)的新驅(qū)動(dòng)基因,。
值得注意的是,在18個(gè)新基因中有一些zui重要的候選基因,,例如LZTR1和delta catenin,,在來(lái)自人類腫瘤的癌癥干細(xì)胞實(shí)驗(yàn)室研究、細(xì)胞培養(yǎng)物檢測(cè)以及移植小鼠研究中均被證實(shí)是驅(qū)動(dòng)基因,。
一個(gè)新的個(gè)體化癌癥治療模型
由于患者的腫瘤是由不同的驅(qū)動(dòng)基因驅(qū)動(dòng),,研究人員認(rèn)為個(gè)體化的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤治療將需要通過復(fù)雜的分析才能成為現(xiàn)實(shí)。首先,,必須對(duì)患者腫瘤中的所有基因進(jìn)行測(cè)序及分析,,確定它的驅(qū)動(dòng)基因。
“在某些腫瘤中驅(qū)動(dòng)基因很明顯,,但在另一些腫瘤中,,卻很難找到驅(qū)動(dòng)基因,”Iavarone博士說,。
一旦確定了候選驅(qū)動(dòng)基因,,就必須用分離自患者腫瘤的癌癥干細(xì)胞進(jìn)行實(shí)驗(yàn)室測(cè)試證實(shí)。
Lasorella博士說:“癌癥干細(xì)胞是腫瘤侵襲性的細(xì)胞,,是癌癥治療的關(guān)鍵靶細(xì)胞,。在癌癥干細(xì)胞中證實(shí)可成功擊中驅(qū)動(dòng)基因,能夠減緩細(xì)胞培養(yǎng)物和動(dòng)物模型中癌癥生長(zhǎng)的藥物,,將隨后在患者中進(jìn)行測(cè)試,。”
對(duì)于某些患者個(gè)體化治療已有可能
對(duì)于85%的已知膠質(zhì)母細(xì)胞瘤驅(qū)動(dòng)基因,還沒有獲得批準(zhǔn)的靶向它們的藥物,。
但哥倫比亞大學(xué)研究小組發(fā)現(xiàn),,大約15%的患者他們的腫瘤是由某些基因融合所驅(qū)動(dòng),,當(dāng)前可獲得靶向這些驅(qū)動(dòng)基因的FDA批準(zhǔn)藥物。
研究發(fā)現(xiàn),,一半的患者其腫瘤是由EGFR和其他幾種基因中的一種相融合所驅(qū)動(dòng),。融合使得EGFR這一與癌癥相關(guān)的生長(zhǎng)因子過度活化;過度活化的EGFR在這些膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中驅(qū)動(dòng)了腫瘤生長(zhǎng),。
“當(dāng)存在這種基因融合時(shí),,腫瘤會(huì)對(duì)它上癮,沒有它腫瘤無(wú)法存活,。我們認(rèn)為攜帶這種基因融合的患者有可能受益于已經(jīng)上市的EGFR抑制劑,。在我們的研究中,當(dāng)我們給予罹患人類膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的小鼠這些抑制劑時(shí),,強(qiáng)有力地抑制了腫瘤生長(zhǎng),。
其他一些患者的腫瘤包含F(xiàn)GFR與TACC基因融合。這些患者有可能受益于FGFR激酶抑制劑,。這些藥物的初步試驗(yàn)已經(jīng)證實(shí),,它們具有*的安全特性,應(yīng)該在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者中加速進(jìn)行檢測(cè),。